-
Протеомика
Протеомиката включва приложения на технологии за количествено определяне на общото съдържание на протеини в клетка, тъкан или организъм.Технологиите, базирани на протеомика, се използват в различни възможности за различни изследователски настройки, като откриване на различни диагностични маркери, кандидати за производство на ваксини, разбиране на механизмите на патогенност, промяна на моделите на експресия в отговор на различни сигнали и интерпретация на функционални протеинови пътища при различни заболявания.Понастоящем технологиите за количествена протеомика се разделят главно на количествени стратегии TMT, Label Free и DIA.
-
Метаболомика
Метаболомът е крайният продукт надолу по веригата на генома и се състои от общото допълнение на всички молекули с ниско молекулно тегло (метаболити) в клетка, тъкан или организъм.Метаболомиката има за цел да измерва широка гама от малки молекули в контекста на физиологични стимули или болестни състояния.Метаболомичните методологии попадат в две отделни групи: ненасочена метаболомика, предвиден цялостен анализ на всички измерими аналити в проба, включително химични неизвестни с помощта на GC-MS/LC-MS, и насочена метаболомика, измерване на определени групи от химически характеризирани и биохимично анотирани метаболити.
-
Групиран сегрегационен анализ
Групираният сегрегантен анализ (BSA) е техника, използвана за бързо идентифициране на генетични маркери, свързани с фенотипа.Основният работен процес на BSA включва избиране на две групи индивиди с изключително противоположни фенотипове, обединяване на ДНК на всички индивиди, за да се образуват две големи части от ДНК, идентифициране на диференциални последователности между два пула.Тази техника е широко използвана за идентифициране на генетични маркери, силно свързани с целеви гени в растителни/животински геноми.
-
Секвениране на ДНК/РНК – нанопорен секвенатор
ONT секвенирането е технология за секвениране на електрически сигнал в реално време с една молекула, базирана на нанопори, принципът на секвениране на всяка платформа е един и същ.Двуверижната ДНК/РНК ще се свърже с нанопорест протеин, вграден в биофилма и се развива под ръководството на моторния протеин, под действието на разликата в напрежението от двете страни на биофилма, ДНК/РНК нишките преминават през протеина на нанопорния канал при определено процент.Поради разликите в химичните свойства на различните бази на ДНК/РНК веригата, когато една единствена база или ДНК молекула преминава през нанопорния канал, това ще предизвика промяна на различни електрически сигнали.Чрез откриване и съпоставяне на тези сигнали могат да бъдат изчислени съответните основни типове и откриването в реално време на последователността може да бъде завършено.
-
ДНК/РНК секвениране -PacBio Sequencer
Платформата за секвениране PacBio е отдавна прочетена платформа за секвениране, която също е известна като една от технологиите за секвениране от трето поколение (TGS).Основната технология, едномолекулно реално време (SMRT), дава възможност за генериране на четения с дължина десетки килобази.На базата на „Секвениране чрез синтез“ разделителната способност на единичен нуклеотид се постига чрез вълновод с нулев режим (ZMW), където се осветява само ограничен обем на дъното (мястото на синтеза на молекулата).В допълнение, секвенирането на SMRT до голяма степен избягва специфично за последователността отклонение в NGS системата, тъй като повечето от стъпките на PCR амплификация не са необходими в процеса на изграждане на библиотека.
Платформа: Sequel II, Revio
