-
Протеомика
Протеомика включает в себя применение технологий для количественного определения общего белкового состава клетки, ткани или организма.Технологии, основанные на протеомике, используются в различных целях для различных исследовательских задач, таких как обнаружение различных диагностических маркеров, кандидатов для производства вакцин, понимание механизмов патогенности, изменение паттернов экспрессии в ответ на различные сигналы и интерпретация функциональных белковых путей при различных заболеваниях.В настоящее время технологии количественной протеомики в основном делятся на количественные стратегии TMT, Label Free и DIA.
-
Метаболомика
Метаболом является конечным последующим продуктом генома и состоит из полного набора всех низкомолекулярных молекул (метаболитов) в клетке, ткани или организме.Целью метаболомики является измерение широкого спектра малых молекул в контексте физиологических стимулов или болезненных состояний.Методологии метаболомики делятся на две отдельные группы: нецелевая метаболомика, предполагаемый комплексный анализ всех измеримых аналитов в образце, включая неизвестные химические вещества, с использованием ГХ-МС/ЖХ-МС, и целевая метаболомика, измерение определенных групп химически охарактеризованных и биохимически аннотированные метаболиты.
-
Массовый сегрегантный анализ
Массовый сегрегантный анализ (BSA) — это метод, используемый для быстрой идентификации генетических маркеров, связанных с фенотипом.Основной рабочий процесс BSA включает отбор двух групп людей с крайне противоположными фенотипами, объединение ДНК всех людей для формирования двух объемов ДНК и идентификацию дифференциальных последовательностей между двумя пулами.Этот метод широко использовался для идентификации генетических маркеров, тесно связанных с целевыми генами в геномах растений/животных.
-
Секвенирование ДНК/РНК – секвенатор нанопор
Секвенирование ONT — это технология секвенирования электрического сигнала в реальном времени для одной молекулы, основанная на нанопорах, принцип секвенирования на каждой платформе одинаков.Двухцепочечная ДНК/РНК будет связываться с нанопористым белком, встроенным в биопленку и раскручивающимся под руководством моторного белка, под действием разности потенциалов с обеих сторон биопленки нити ДНК/РНК проходят через белок канала нанопоры при определенном ставка.Из-за различий в химических свойствах различных оснований на цепи ДНК/РНК, когда одно основание или молекула ДНК проходит через канал нанопор, это вызывает изменение различных электрических сигналов.Обнаружив эти сигналы и соответствуя им, можно вычислить соответствующие базовые типы и завершить обнаружение последовательности в реальном времени.
-
Секвенирование ДНК/РНК — секвенатор PacBio
Платформа секвенирования PacBio — это платформа секвенирования длительного чтения, которая также известна как одна из технологий секвенирования третьего поколения (TGS).Основная технология, одномолекулярный режим реального времени (SMRT), позволяет генерировать считывания длиной в десятки килобаз.На основе «Секвенирования путем синтеза» разрешение отдельных нуклеотидов достигается с помощью волновода нулевого режима (ZMW), в котором освещается только ограниченный объем внизу (место синтеза молекул).Кроме того, секвенирование SMRT в значительной степени позволяет избежать систематической ошибки, связанной с последовательностью, в системе NGS, поскольку большинство этапов ПЦР-амплификации не требуются в процессе создания библиотеки.
Платформа: Сиквел II, Revio
