ଉଚ୍ଚ-ଟ୍ରୁପୁଟ ଜେନୋଟାଇପିଂ, ବିଶେଷତ large ବୃହତ-ଜନସଂଖ୍ୟା ଉପରେ, ଜେନେଟିକ୍ ଆସୋସିଏସନ୍ ଅଧ୍ୟୟନରେ ଏକ ମ fundamental ଳିକ ପଦକ୍ଷେପ, ଯାହା କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଜିନ୍ ଆବିଷ୍କାର, ବିବର୍ତ୍ତନ ବିଶ୍ଳେଷଣ ଇତ୍ୟାଦି ପାଇଁ ଜେନେଟିକ୍ ଆଧାର ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ | ଜେନେଟିକ୍ ମାର୍କର ଆବିଷ୍କାର ଉପରେ ଯୁକ୍ତିଯୁକ୍ତ ଦକ୍ଷତା ବଜାୟ ରଖିବାବେଳେ, ନମୁନା ପ୍ରତି କ୍ରମର ମୂଲ୍ୟକୁ କମ୍ କରିବାକୁ ପ୍ରବର୍ତ୍ତିତ |ଏହା ସାଧାରଣତ given ପ୍ରଦତ୍ତ ଆକାର ପରିସର ମଧ୍ୟରେ ପ୍ରତିବନ୍ଧକ ଖଣ୍ଡ ବାହାର କରି ହାସଲ ହୁଏ, ଯାହାକୁ ହ୍ରାସ ହୋଇଥିବା ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ ଲାଇବ୍ରେରୀ (RRL) କୁହାଯାଏ |ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ-ଲୋକସ୍ ବର୍ଦ୍ଧିତ ଖଣ୍ଡ କ୍ରମ (SLAF-Seq) ହେଉଛି ଡି ନୋଭୋ SNP ଆବିଷ୍କାର ଏବଂ ବୃହତ ଜନସଂଖ୍ୟାର SNP ଜେନୋଟାଇପ୍ ପାଇଁ ଏକ ସ୍ୱ-ବିକଶିତ ରଣନୀତି |
ଯାନ୍ତ୍ରିକ କାର୍ଯ୍ୟ ପ୍ରବାହ |
SLAF ବନାମ ବିଦ୍ୟମାନ RRL ପଦ୍ଧତି |
SLAF ର ଲାଭ
ଉଚ୍ଚ ଜେନେଟିକ୍ ମାର୍କର ଆବିଷ୍କାର ଦକ୍ଷତା |- ଉଚ୍ଚ-ଥ୍ରୋପୁଟ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ସହିତ ମିଳିତ ହୋଇ, SLAF-Seq ବିଭିନ୍ନ ଜିନୋମ ମଧ୍ୟରେ ଆବିଷ୍କୃତ ହୋଇଥିବା ଶହ ଶହ ହଜାର ଟ୍ୟାଗକୁ ଏକ ରେଫରେନ୍ସ ଜିନୋମ ସହିତ କିମ୍ବା ବିଭିନ୍ନ ଅନୁସନ୍ଧାନ ପ୍ରକଳ୍ପର ଅନୁରୋଧ ପୂରଣ କରିବାକୁ ହାସଲ କରିପାରିବ |
କଷ୍ଟୋମାଇଜ୍ ଏବଂ ଫ୍ଲେକ୍ସିବଲ୍ ପରୀକ୍ଷାମୂଳକ ଡିଜାଇନ୍ |- ବିଭିନ୍ନ ଅନୁସନ୍ଧାନ ଲକ୍ଷ୍ୟ କିମ୍ବା ପ୍ରଜାତି ପାଇଁ, ଏକକ ଏନଜାଇମ୍, ଡୁଆଲ୍-ଏନଜାଇମ୍ ଏବଂ ମଲ୍ଟି-ଏନଜାଇମ୍ ହଜମ ସହିତ ବିଭିନ୍ନ ଏନଜାଇମାଟିକ୍ ହଜମ କ strateg ଶଳ ଉପଲବ୍ଧ |ଏକ ଉତ୍କୃଷ୍ଟ ଏନଜାଇମ୍ ଡିଜାଇନ୍ ନିଶ୍ଚିତ କରିବାକୁ ସିଲିକୋରେ ହଜମ କ strategy ଶଳ ପୂର୍ବ-ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନ କରାଯିବ |
ଏନଜାଇମାଟିକ ହଜମରେ ଉଚ୍ଚ ଦକ୍ଷତା |- ପୂର୍ବ-ପରିକଳ୍ପିତ ଏନଜାଇମାଟିକ୍ ହଜମ କ୍ରୋମୋଜୋମରେ ଅଧିକ ସମାନ ଭାବରେ ବଣ୍ଟିତ SLAF ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ |ଭଗ୍ନାଂଶ ସଂଗ୍ରହ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମତା 95% ରୁ ଅଧିକ ହାସଲ କରିପାରିବ |
ପୁନରାବୃତ୍ତି କ୍ରମକୁ ଏଡ଼ାନ୍ତୁ |- SLAF-Seq ତଥ୍ୟରେ ପୁନରାବୃତ୍ତି କ୍ରମର ଶତକଡା 5% ରୁ କମ୍ ହୋଇଯାଏ, ବିଶେଷକରି ଉଚ୍ଚ ସ୍ତରର ପୁନରାବୃତ୍ତି ଉପାଦାନ ବିଶିଷ୍ଟ ପ୍ରଜାତିଗୁଡିକରେ ଯେପରିକି ଗହମ, ମକା ଇତ୍ୟାଦି |
ସ୍ developed- ବିକଶିତ ବାୟୋ ଇନଫର୍ମାଟିକ୍ ୱାର୍କଫ୍ଲୋ |- BMK ଏକ ସମନ୍ୱିତ ବାୟୋ ଇନଫର୍ମାଟିକ୍ ୱାର୍କଫ୍ଲୋକୁ SLAF-Seq ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ପାଇଁ ପ୍ରଯୁଜ୍ୟ ଚୂଡ଼ାନ୍ତ ଫଳାଫଳର ନିର୍ଭରଯୋଗ୍ୟତା ଏବଂ ସଠିକତା ନିଶ୍ଚିତ କରିବାକୁ ବିକଶିତ କଲା |
SLAF ର ପ୍ରୟୋଗ |
ଜେନେଟିକ୍ ଲିଙ୍କେଜ୍ ମାନଚିତ୍ର
ଉଚ୍ଚ ସାନ୍ଦ୍ରତା ଜେନେଟିକ୍ ମାନଚିତ୍ର ନିର୍ମାଣ ଏବଂ କ୍ରାଇସେଣ୍ଟେମ୍ରେ ଫୁଲ-ପ୍ରକାର ଗୁଣକୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରୁଥିବା ଲୋକୀର ଚିହ୍ନଟ (କ୍ରାଇସେଣ୍ଟେମ୍ x ମୋରିଫୋଲିୟମ୍ ରାମାଟ |)
ପତ୍ରିକା: ଉଦ୍ୟାନ କୃଷି ଅନୁସନ୍ଧାନ ପ୍ରକାଶିତ: 2020.7
GWAS
ଜେନୋମ-ୱାଇଡ୍ ଆସୋସିଏସନ୍ ଏବଂ ଲିଙ୍କେଜ୍ ମ୍ୟାପିଙ୍ଗ୍ ବ୍ୟବହାର କରି ସୋୟାବିନ୍ ମଞ୍ଜିରେ ଆଇସୋଫାଭନ୍ ବିଷୟବସ୍ତୁ ସହିତ ଜଡିତ ଏକ ପ୍ରାର୍ଥୀ ଜିନ୍ ର ଚିହ୍ନଟ |
ପତ୍ରିକା: ଉଦ୍ଭିଦ ପତ୍ରିକା ପ୍ରକାଶିତ: 2020.08 |
ବିବର୍ତ୍ତନଗତ ଜେନେଟିକ୍ସ |
ଜନସଂଖ୍ୟା ଜେନୋମିକ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ ଏବଂ ଡି ନୋଭୋ ଆସେମ୍ବଲି ଏକ ବିବର୍ତ୍ତନଶୀଳ ଖେଳ ଭାବରେ ତୃଣକ ଚାଉଳର ଉତ୍ପତ୍ତି ବିଷୟରେ ପ୍ରକାଶ କରେ |
ପତ୍ରିକା: ମଲିକୁଲାର ଉଦ୍ଭିଦ ପ୍ରକାଶିତ: 2019.5 |
ବଲ୍କେଡ୍ ସେଗ୍ରେଗାଣ୍ଟ ଆନାଲିସିସ୍ (BSA)
GmST1, ଯାହା ଏକ ସଲଫୋଟ୍ରାନ୍ସଫ୍ରେଜ୍ ଏନକୋଡ୍ କରେ, ସୋୟାବିନ୍ ମୋଜାଇକ୍ ଜୀବାଣୁ G2 ଏବଂ G3 ପ୍ରତିରୋଧକୁ ପ୍ରତିରୋଧ କରେ |
ପତ୍ରିକା: ଉଦ୍ଭିଦ, କୋଷ ଏବଂ ପରିବେଶ ପ୍ରକାଶିତ: 2021.04 |
ସନ୍ଦର୍ଭ
ସନ୍ ଏକ୍ସ, ଲିୟୁ ଡି, Zhang ାଙ୍ଗ ଏକ୍ସ, ଇତ୍ୟାଦି |SLAF-Seq: ବୃହତ-ମାପର ଡି ନୋଭୋ SNP ଆବିଷ୍କାର ଏବଂ ଉଚ୍ଚ-ଥ୍ରୋପୁଟ କ୍ରମ [J] ବ୍ୟବହାର କରି ଜେନୋଟାଇପିଂର ଏକ ଦକ୍ଷ ପଦ୍ଧତି |ପ୍ଲସ୍ ୱାନ୍, 2013, 8 (3): e58700 |
ଗୀତ X, ଜୁ Y, ଗାଓ କେ, ଇତ୍ୟାଦି |ଉଚ୍ଚ ସାନ୍ଦ୍ରତା ଜେନେଟିକ୍ ମାନଚିତ୍ର ନିର୍ମାଣ ଏବଂ କ୍ରାଇସେଣ୍ଟେମ୍ରେ ଫୁଲ-ପ୍ରକାର ଗୁଣକୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରୁଥିବା ଲୋକୀର ଚିହ୍ନଟ (କ୍ରାଇସେଣ୍ଟେମ୍ × ମୋରିଫୋଲିୟମ୍ ରାମାଟ |) |ହର୍ଟିକ୍ ରେସ୍2020; 7: 108
ୱୁ ଡି, ଲି ଡି, ଜାଓ ଏକ୍ସ, ଇତ୍ୟାଦି |ଜେନୋମ-ୱାଇଡ୍ ଆସୋସିଏସନ୍ ଏବଂ ଲିଙ୍କେଜ୍ ମ୍ୟାପିଙ୍ଗ୍ ବ୍ୟବହାର କରି ସୋୟାବିନ୍ ମଞ୍ଜିରେ ଆଇସୋଫ୍ଲୋଭୋନ୍ ବିଷୟବସ୍ତୁ ସହିତ ଜଡିତ ଏକ ପ୍ରାର୍ଥୀ ଜିନ୍ ର ପରିଚୟ |ଉଦ୍ଭିଦ J. 2020;104 (4): 950-963 |
ସୂର୍ଯ୍ୟ ଜେ, ମା ଡି, ଟାଙ୍ଗ୍ ଏଲ୍, ଇତ୍ୟାଦି |ଜନସଂଖ୍ୟା ଜେନୋମିକ୍ ଆନାଲିସିସ୍ ଏବଂ ଡି ନୋଭୋ ବିଧାନସଭା ଏକ ବିବର୍ତ୍ତନ ଖେଳ ଭାବରେ ତୃଣକ ଚାଉଳର ଉତ୍ପତ୍ତି ପ୍ରକାଶ କରେ |ମଲ୍ ପ୍ଲାଣ୍ଟ |2019; 12 (5): 632-647 |ମଲ୍ ପ୍ଲାଣ୍ଟ |2018;11 (11): 1360-1376 |
Zhao X, Jing Y, Luo Z, et al।GmST1, ଯାହା ଏକ ସଲଫୋଟ୍ରାନ୍ସଫ୍ରେଜ୍ ଏନକୋଡ୍ କରେ, ସୋୟାବିନ୍ ମୋଜାଇକ୍ ଜୀବାଣୁ G2 ଏବଂ G3 ପ୍ରତିରୋଧକୁ ପ୍ରତିରୋଧ କରେ |ଉଦ୍ଭିଦ ସେଲ୍ ପରିବେଶ |2021; 10.1111 / pce.14066
ପୋଷ୍ଟ ସମୟ: ଜାନୁଆରୀ -04-2022 |