ከፍተኛ መጠን ያለው ጂኖታይፕ ፣ በተለይም በሕዝብ ብዛት ፣ በጄኔቲክ ማህበር ጥናቶች ውስጥ መሠረታዊ እርምጃ ነው ፣ ይህም ለተግባራዊ የጂን ግኝት ፣ የዝግመተ ለውጥ ትንተና ፣ ወዘተ. ) በዘረመል ማርከር ግኝት ላይ ምክንያታዊ ቅልጥፍናን ጠብቆ ሳለ በአንድ ናሙና ውስጥ የቅደም ተከተል ወጪን ለመቀነስ አስተዋውቋል።ይህ በተለምዶ የሚገኘው የተቀነሰ የውክልና ቤተ-መጽሐፍት (RRL) ተብሎ በሚጠራው የመጠን ክልል ውስጥ የእገዳ ቁርጥራጭን በማውጣት ነው።Specific-locus amplified fragment sequencing(SLAF-Seq) ለዴ ኖቮ SNP ግኝት እና ለትልቅ ህዝብ SNP genotyping በራሱ ያደገ ስልት ነው።
ቴክኒካዊ የስራ ሂደት
SLAF vs ነባር RRL ዘዴዎች
የ SLAF ጥቅሞች
ከፍተኛ የጄኔቲክ ማርከር ግኝት ውጤታማነት- ከከፍተኛ የሂደት ቅደም ተከተል ቴክኖሎጂ ጋር በማጣመር፣ SLAF-Seq በማጣቀሻ ጂኖምም ሆነ ከእኛ ጋር የተለያዩ የምርምር ፕሮጀክቶችን ጥያቄ ለማሟላት በአጠቃላይ ጂኖም ውስጥ የተገኙ በመቶ ሺዎች የሚቆጠሩ መለያዎችን ማግኘት ይችላል።
የተበጀ&ተለዋዋጭ የሙከራ ንድፍ- ለተለያዩ የምርምር ግብ ወይም ዝርያዎች ፣ ነጠላ ኢንዛይም ፣ ባለሁለት ኢንዛይም እና ባለብዙ ኢንዛይም መፈጨትን ጨምሮ የተለያዩ የኢንዛይሞች መፈጨት ስልቶች አሉ።የተመቻቸ የኢንዛይም ዲዛይን ለማረጋገጥ የምግብ መፍጨት ስትራቴጂ በሲሊኮን በቅድሚያ ይገመገማል።
በኢንዛይም የምግብ መፈጨት ውስጥ ከፍተኛ ውጤታማነት- አስቀድሞ የተነደፈ የኢንዛይም መፈጨት በክሮሞሶም ላይ የበለጠ በእኩል የሚሰራጩ SLAFዎችን ይሰጣል።ቁርጥራጭ መሰብሰብን በብቃት ከ95% በላይ ማሳካት ይችላል።
ተደጋጋሚ ቅደም ተከተል ያስወግዱ- በ SLAF-Seq መረጃ ውስጥ ያለው የድግግሞሽ ቅደም ተከተል መቶኛ ከ 5% ያነሰ ነው, በተለይም እንደ ስንዴ, በቆሎ, ወዘተ የመሳሰሉ ከፍተኛ ደረጃ ያላቸው ተደጋጋሚ ንጥረ ነገሮች ባላቸው ዝርያዎች ውስጥ.
በራስ-የዳበረ ባዮኢንፎርማቲክ የስራ ፍሰት- BMK የመጨረሻውን ውጤት አስተማማኝነት እና ትክክለኛነት ለማረጋገጥ ለ SLAF-Seq ቴክኖሎጂ የሚተገበር የተቀናጀ የባዮኢንፎርማቲክ የስራ ፍሰት አዘጋጅቷል።
የ SLAF መተግበሪያ
የጄኔቲክ ትስስር ካርታ
በ Chrysanthemum (Chrysanthemum x ሞሪፎሊየም ራማት) ውስጥ ከፍተኛ-ጥቅጥቅ ያለ የጄኔቲክ ካርታ ግንባታ እና የሎሲ ቁጥጥር የአበባ አይነት ባህሪያትን መለየት።
ጆርናል፡ ሆርቲካልቸር ጥናት ታትሟል፡ 2020.7
GWAS
በአኩሪ አተር ዘሮች ውስጥ ከአይሶፋቮን ይዘት ጋር የተያያዘ የእጩ ጂን መለየት ጂኖም-ሰፊ ማህበር እና ትስስር ካርታ
ጆርናል፡ የፕላንት ጆርናል ታትሟል፡ 2020.08
የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ
የህዝብ ብዛት ጂኖሚክ ትንታኔ እና ደ ኖቮ ስብሰባ የአረም ሩዝ አመጣጥ እንደ የዝግመተ ለውጥ ጨዋታ ያሳያል
ጆርናል: ሞለኪውላር ተክል የታተመ: 2019.5
የጅምላ ሴግሬጋንት ትንተና (BSA)
GmST1፣ sulfotransferaseን ኮድ የሚያደርግ፣ የአኩሪ አተር ሞዛይክ ቫይረስ ዝርያዎችን G2 እና G3 መቋቋምን ይሰጣል።
ጆርናል፡ ተክል፣ ሴል እና አካባቢ ታትሟል፡ 2021.04
ማጣቀሻ
Sun X፣ Liu D፣ Zhang X፣ እና ሌሎችም።SLAF-Seq፡ ቀልጣፋ የትልቅ ደረጃ ደ ኖቮ SNP ግኝት እና የጂኖቲፕቲንግ ከፍተኛ ቅደም ተከተል[J] በመጠቀም።Plos አንድ, 2013, 8 (3): e58700
ዘፈን X፣ Xu Y፣ Gao K እና ሌሎችም።ከፍተኛ መጠን ያለው የጄኔቲክ ካርታ ግንባታ እና በ Chrysanthemum (Chrysanthemum × ሞሪፎሊየም ራማት) ውስጥ የሎሲ ቁጥጥር የአበባ አይነት ባህሪያትን መለየት።ሆርቲክ ሪስ.2020፤7፡108።
Wu D፣ Li D፣ Zhao X፣ እና ሌሎችም።በአኩሪ አተር ዘሮች ውስጥ ከአይዞፍላቮን ይዘት ጋር የተያያዘ የእጩ ጂን ጂኖም-ሰፊ ማህበር እና ትስስር ካርታን በመጠቀም መለየት።ተክል ጄ 2020;104 (4): 950-963.
ሱን ጄ፣ማ ዲ፣ ታንግ ኤል፣ እና ሌሎችም።የህዝብ ጂኖሚክ ትንተና እና የዲ ኖቮ ጉባኤ የአረም ሩዝ አመጣጥ እንደ ዝግመተ ለውጥ ጨዋታ ያሳያል።ሞል ተክል.2019;12 (5): 632-647.ሞል ተክል.2018;11(11)፡1360-1376።
Zhao X፣ Jing Y፣ Luo Z እና ሌሎችም።GmST1፣ sulfotransferase ን ኮድ የሚያደርገው፣ የአኩሪ አተር ሞዛይክ ቫይረስ ዝርያዎችን G2 እና G3 መቋቋምን ይሰጣል።የእፅዋት ሕዋስ አካባቢ.2021;10.1111 / ፒሲ.14066
የልጥፍ ጊዜ: ጥር-04-2022