Ny fametahana fototarazo avo lenta, indrindra amin'ny mponina midadasika, dia dingana fototra amin'ny fandalinana ny fikambanan'ny fototarazo, izay manome fototra fototarazo ho an'ny fikarohana fototarazo miasa, fanadihadiana momba ny evolisiona, sns. ) dia nampidirina mba hanamaivanana ny vidin'ny filaharana isaky ny santionany, ary hitazonana ny fahombiazany amin'ny fahitana marika fototarazo.Mazàna no tratra izany amin'ny alalan'ny fakana ny sombintsombin'ny fameperana ao anatin'ny halehiben'ny habe nomena, izay antsoina hoe tranomboky famakafakana mihena (RRL).Ny sequencing fragment amplified-locus manokana (SLAF-Seq) dia tetika novolavolain-tena ho an'ny fikarohana SNP de novo sy ny genotyping SNP ho an'ny mponina marobe.
Fomba fiasa ara-teknika
SLAF vs fomba RRL efa misy
Ny tombony amin'ny SLAF
Fahombiazan'ny fahitana marika fototarazo avo kokoa- Miaraka amin'ny teknolojian'ny filaharana avo lenta, ny SLAF-Seq dia afaka mahatratra marika an'hetsiny hita ao anatin'ny génome manontolo mba hanatanterahana ny fangatahan'ny tetik'asa fikarohana isan-karazany, na miaraka amin'ny génome reference.
Customized & Flexible endrika fanandramana- Ho an'ny tanjona na karazana fikarohana samihafa dia misy ny paikady fandevonan-kanina enzymatic isan-karazany ao anatin'izany ny fandevonan-kanina tokana, roa-enzyme ary multi-enzyme.Ny paikadin'ny fandevonan-kanina dia hojerena mialoha amin'ny silico mba hiantohana ny famolavolana anzima tsara indrindra.
Fahombiazana ambony amin'ny fandevonan-kanina enzymatic- Ny fandevonan-kanina enzymatic efa novolavolaina mialoha dia manome SLAF mitovitovy kokoa amin'ny krômôzôma.Afaka mahatratra 95% mahery ny fanangonana sombin-javatra mahomby.
Halaviro ny filaharana miverimberina- Ny isan-jaton'ny filaharana miverimberina ao amin'ny angona SLAF-Seq dia ahena ho ambany noho ny 5%, indrindra amin'ireo karazana manana singa miverimberina avo lenta, toy ny varimbazaha, katsaka, sns.
Workflow bioinformatic novolavolain-tena- Ny BMK dia namolavola rindranasa bioinformatic mitambatra azo ampiharina amin'ny teknolojia SLAF-Seq mba hiantohana ny fahamendrehana sy ny fahamarinan'ny vokatra farany.
Fampiharana ny SLAF
Sarintany fifamatorana génétique
Fanamboarana sarintany fototarazo avo lenta sy famantarana ny loci mifehy ny karazana voninkazo ao amin'ny Chrysanthemum (Chrysanthemum x morifolium Ramat.)
Gazety: Fikarohana momba ny fambolena navoaka: 2020.7
GWAS
Famantarana ny fototarazo kandida mifandray amin'ny votoatin'ny isofavone amin'ny voan'ny soja amin'ny alàlan'ny fikambanan'ny génome-wide sy ny sarintany mifandraika
Gazety: The Plant Journal Navoaka: 2020.08
Genetika evolisiona
Ny famakafakana genomika ny mponina sy ny fivoriambe de novo dia manambara ny niandohan'ny vary ahi-dratsy ho toy ny lalao evolisiona
Gazety: Molecular Plant Navoaka: 2019.5
Famakafakana Segregant betsaka (BSA)
GmST1, izay mamadika sulfotransferase, manome fanoherana ny viriosy mosaika soja G2 sy G3
Gazety: Plant, Cell & Environment Navoaka: 2021.04
Reference
Sun X, Liu D, Zhang X, et al.SLAF-Seq: fomba mahomby amin'ny fikarohana SNP de novo lehibe sy ny genotyping amin'ny alàlan'ny sequencing avo lenta [J].Plos one, 2013, 8(3):e58700
Hira X, Xu Y, Gao K, et al.Fanamboarana sarintany fototarazo avo lenta sy famantarana ny loci mifehy ny karazana voninkazo ao amin'ny Chrysanthemum (Chrysanthemum × morifolium Ramat.).Hortic Res.2020;7:108.
Wu D, Li D, Zhao X, et al.Famantarana ny fototarazon'ny kandida mifandray amin'ny votoatin'ny isoflavone amin'ny voan'ny soja amin'ny alàlan'ny fikambanan'ny genome sy ny sarintany mifandraika.Plant J. 2020;104(4): 950-963.
Sun J, Ma D, Tang L, et al.Ny fanadihadiana momba ny Genomic Population sy ny Fivoriambe De Novo dia manambara ny niandohan'ny vary varimbazaha ho toy ny lalao evolisiona.Mol Plant.2019;12(5):632-647.Mol Plant.2018;11(11):1360-1376.
Zhao X, Jing Y, Luo Z, et al.GmST1, izay mamadika sulfotransferase, dia manome fanoherana ny viriosy mosaika soja G2 sy G3.Zavamaniry Cell Environ.2021;10.1111/pc.14066
Fotoana fandefasana: Jan-04-2022