Агульнагеномнае даследаванне асацыяцый (GWAS) накіравана на выяўленне генетычных варыянтаў (генатыпу), звязаных з пэўнымі прыкметамі (фенатыпам).Даследаванні GWA даследуюць генетычныя маркеры, якія перасякаюць увесь геном вялікай колькасці асобін, і прагназуюць асацыяцыі генатыпу і фенатыпу шляхам статыстычнага аналізу на ўзроўні папуляцыі.Рэсеквенаванне поўнага геному патэнцыйна можа выявіць усе генетычныя варыянты.У спалучэнні з фенатыпічнымі дадзенымі GWAS можа быць апрацаваны для ідэнтыфікацыі звязаных з фенатыпам SNP, QTL і генаў-кандыдатаў, што моцна падтрымлівае сучасную селекцыю жывёл/раслін.SLAF - гэта самастойна распрацаваная спрошчаная стратэгія секвенирования геному, якая выяўляе размеркаваныя па ўсім геному маркеры, SNP.Гэтыя SNP, як малекулярна-генетычныя маркеры, могуць быць апрацаваны для даследаванняў асацыяцыі з мэтавымі прыкметамі.Гэта эканамічна эфектыўная стратэгія ў выяўленні складаных прыкмет, звязаных з генетычнымі варыяцыямі.
