● به ژنوم مرجع نیاز دارد.
DNA DNA Lambda برای نظارت بر بازده تبدیل بیسولفیت اضافه می شود.
● توالی در Illumina Novaseq.
●استاندارد طلا برای تحقیقات متیلاسیون DNA: این فناوری پردازش تبدیل متیلاسیون بالغ از دقت بالا و تکرارپذیری خوبی برخوردار است.
●پوشش گسترده و وضوح یک پایه:تشخیص سایتهای متیلاسیون در سطح ژنوم.
●پلت فرم کامل:ارائه خدمات عالی یک مرحله ای از پردازش نمونه ، ساخت کتابخانه ، توالی به تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک.
●تخصص گسترده: با پروژه های توالی WGBS با موفقیت در طیف متنوعی از گونه ها ، BMKGENE بیش از یک دهه تجربه ، یک تیم تجزیه و تحلیل بسیار ماهر ، محتوای جامع و پشتیبانی عالی پس از فروش را به ارمغان می آورد.
●امکان پیوستن به تجزیه و تحلیل Transcriptomics: امکان تجزیه و تحلیل یکپارچه WGBS با سایر داده های OMICS مانند RNA-Seq.
کتابخانه | استراتژی توالی | خروجی داده های توصیه شده | کنترل کیفیت |
بیسولفیت تحت درمان | Illumina PE150 | عمق 30 برابر | q30 ≥ 85 ٪ تبدیل بیسولفیت> 99 ٪ |
غلظت (ng/μl) | مقدار کل (میکروگرم) | الزامات اضافی | |
DNA ژنومی | 5 ≥ | 400 نانوگرم | تخریب یا آلودگی محدود |
شامل تجزیه و تحلیل زیر است:
control کنترل کیفیت توالی خام ؛
● نقشه برداری به ژنوم مرجع ؛
● تشخیص پایه های متیله شده 5MC ؛
● تجزیه و تحلیل توزیع متیلاسیون و حاشیه نویسی.
● تجزیه و تحلیل مناطق متیله شده متفاوت (DMR).
● حاشیه نویسی عملکردی ژنهای مرتبط با DMR.
5MC تشخیص متیلاسیون: انواع سایتهای متیله شده
نقشه متیلاسیون. توزیع ژنوم متیلاسیون 5MC
حاشیه نویسی مناطق بسیار متیله شده
مناطق متیله شده متفاوت: ژنهای مرتبط
مناطق متیله شده متفاوت: حاشیه نویسی ژنهای مرتبط (هستی شناسی ژن)
پیشرفت های پژوهشی را که توسط کل خدمات توالی ژنوم Bisulfite BMKGENE از طریق مجموعه ای از نشریات مورد نظر تسهیل شده است ، کاوش کنید.
Fan ، Y. et al. (2020) "تجزیه و تحلیل پروفایل متیلاسیون DNA در طول رشد عضلات اسکلتی گوسفند با استفاده از توالی بیسولفیت ژنوم" ،ژنومیک BMC، 21 (1) ، صص 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
ژائو ، X. و همکاران. (2022) "آشفتگی های متیلاسیون اسید deoxyribonucleic رمان در کارگرانی که در معرض وینیل کلرید قرار دارند" ،سم شناسی و سلامت صنعتی، 38 (7) ، صص 377-388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo ، J. و همکاران. (2020) "روابط بین متیلاسیون ژنوم ، سطح RNA های غیر کد کننده ، mRNA ها و متابولیت ها در رسیدن میوه گوجه فرنگی" ،مجله گیاه، 103 (3) ، صص 980-994. doi: 10.1111/tpj.14778.