CircRNA

RNAهای حلقوی (circRNAها) RNAهای غیر کدکننده‌ای هستند که ساختارهای حلقوی تشکیل می‌دهند و نقش‌های تنظیمی متعددی دارند، از جمله رقابت با miRNA برای ژن‌های هدف و اتصال به پروتئین. خط لوله circRNA BMKCloud برای تجزیه و تحلیل کتابخانه‌های فاقد rRNA با یک ژنوم مرجع با حاشیه‌نویسی خوب و کیفیت بالا طراحی شده است. تجزیه و تحلیل با برش و کنترل کیفیت خواندن آغاز می‌شود و به دنبال آن هم‌ترازی خواندن با ژنوم مرجع و پیش‌بینی circRNAهای جدید، همراه با شناسایی circRNAهای شناخته شده از پایگاه‌های داده، انجام می‌شود. اهداف miRNA و میزبان‌های circRNA مربوطه متعاقباً شناسایی می‌شوند. تجزیه و تحلیل بیان افتراقی، circRNAهای با بیان افتراقی را آشکار می‌کند و میزبان‌های مربوطه به صورت عملکردی حاشیه‌نویسی می‌شوند تا عملکردهای بیولوژیکی غنی‌شده استخراج شوند.