Seicheamh mRNA eukaryotic-Illumina
Buntáistí
ØArdtaithí: Próiseáladh níos mó ná 200,000 sampla i BMK a chlúdaíonn cineálacha éagsúla samplaí, lena n-áirítear cultúr cille, fíochán, sreabhán coirp, etc. agus dúnadh os cionn 7,000 tionscadal mRNA-Seq a chlúdaíonn réimse taighde éagsúla.
ØCóras dian rialaithe cáilíochta: Tá dlúthmhonatóireacht á déanamh ar phointí lárnacha rialaithe cáilíochta trí gach céim lena n-áirítear ullmhú samplaí, ullmhú leabharlainne, seicheamhú agus bithfhaisnéisíocht chun torthaí ardchaighdeáin a bhaint amach.
ØBunachar sonraí iolracha ar fáil le haghaidh staidéir anótála agus saibhrithe feidhme chun spriocanna taighde éagsúla a chomhlíonadh.
ØSeirbhísí iar-díola: Seirbhísí iar-díola bailí ar feadh 3 mhí ar chríochnú an tionscadail, lena n-áirítear obair leantach na dtionscadal, fabhtcheartú, Q&A torthaí, etc.
Riachtanais Samplacha agus Seachadadh
| Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Sonraí molta | Rialú Cáilíochta |
| Polai A saibhrithe | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Riachtanais Shamplacha:
Núicléatídí:
| Íonachta | Ionracas | Méid |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5Éilliú próitéine nó DNA teoranta nó gan aon a thaispeáint ar fhoirmiú. | I gcás plandaí: RIN≥6.5; Le haghaidh ainmhithe: RIN≥7; 28S/18S≥1.0; ingearchló bonnlíne teoranta nó gan aon | Conc.≥30 ng/μl;Imleabhar ≥ 10 μl;Iomlán ≥ 1.5 μg |
Fíochán: Meáchan(tirim):≥1 g
* I gcás fíocháin níos lú ná 5 mg, molaimid sampla fíocháin reoite (i nítrigin leachtach) a sheoladh.
fionraí cille:Comhaireamh cille = 3×106- 1×107
* Molaimid lysate cille reoite a longáil.Sa chás go bhfuil an líon cille níos lú ná 5 × 105, moltar splanc-reoite i nítrigine leachtach, rud is fearr le haghaidh micrea-eastóscadh.
Samplaí fola:Toirt ≥ 1 ml
Miocrorgánach:Mais ≥ 1 g
Seachadadh Samplach Molta
Coimeádán: feadán lártheifneoir 2 ml (Ní mholtar scragall stáin)
Lipéadú samplach: Grúpa+ macasamhail m.sh. A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Loingsiú:
- Oighear tirim: Ní mór samplaí a phacáil i málaí agus a chur faoi oighear tirim.
- Feadáin RNAstable: Is féidir samplaí RNA a thriomú i bhfeadán cobhsaíochta RNA (m.sh. RNAstable®) agus iad a sheoladh i dteocht an tseomra.
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Dearadh turgnaimh
Seachadadh samplach
eastóscadh RNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Bithfhaisnéisíocht
Eocaryotic sreabhadh oibre anailíse seicheamhaithe mRNA
Bithfhaisnéisíocht
ØRialú cáilíochta sonraí amh
ØAilíniú genome tagartha
ØAnailís ar struchtúr tras-scríbhinní
ØCainníochtú slonn
ØAnailís cainte difreálach
ØAnótáil feidhme agus saibhriú
1.mRNA Cuar Sáithiúcháin Sonraí
2.Anailís léiriú difreálach - plota Bolcán
3.Nóta KEGG ar DEGanna
4.Aicmiú GO ar DEGanna
