-
Tionól Géanóim T2T | Seicheamhú Ultrafhada
Is é Géanóm T2T (Teloméir-go-Teloméir) an caighdeán óir le haghaidh tionól géanóim ardchaighdeáin, ag tagairt d'athchruthú géanóim ar scála crómasóm gan bhearnaí nó gan bhearnaí a shíneann ó theloméir amháin go dtí an ceann eile, agus ag briseadh teorainneacha ilroinnte tionól traidisiúnta an ghéanóim.
Cumhachtaithe ag seicheamhú léamha ultra-fhada lárnach ONT agus comhtháite le seicheamhú domhain il-ardán agus píblínte bithfhaisnéise optamaithe, díríonn réiteach Géanóm BMKGENE T2T ar na "réigiúin dhorcha" géanómacha is deacra a réiteach — teileaméirí (coimpléisc núicléapróitéine speisialaithe ag foircinn crómasóim eocarótacha), ceintréiméirí orgánach níos airde (eagair athrá tandem ollmhóra), agus réigiúin haplóitípe athrá agus heitrisigeacha casta eile, nach bhfuil inréitithe le fada an lá le haghaidh seicheamhú léamha fada caighdeánach. Murab ionann agus léamha fada traidisiúnta nach dtrasnaíonn na réigiúin seo agus a chuireann titim seicheamhach nó contigs chiméireacha faoi deara, is féidir le léamha ultra-fhada ONT bearnaí neamh-chomhthionóil agus réigiúin chasta a shárú. Tá BMKGene tiomanta do ghéanóim T2T ardchaighdeáin saor ó bhearnaí nó gan bhearnaí a sheachadadh do speicis éagsúla.
Díghlasálann tógáil ghéanóm T2T réigiúin ghéanómacha casta nach raibh inrochtana roimhe seo, líonann sé bearnaí taighde ríthábhachtacha, agus soláthraíonn sé sonraí bunúsacha soladacha, ardchruinneas le haghaidh staidéir dhomhain lena n-áirítear éabhlóid speiceas, mianadóireacht géinte feidhmiúil, pórú móilíneach, leigheas beacht agus taighde eolaíoch ceannródaíoch eile.
-
Próitéamaíocht
Díríonn próitéomaíocht ar phróitéiní—na forghníomhaithe ar ghníomhaíochtaí saoil a bhfuil ról ríthábhachtach acu i rialáil trascríobh orgánach. Déanann sé anailís ar chomhdhéanamh, leibhéil léirithe, agus stáit mhodhnúcháin na bpróitéiní uile a athraíonn go dinimiciúil i bhfíocháin nó i gcealla, ag tabhairt aghaidh ar an tionchar suntasach atá ag dinimic flúirse próitéóim ar phróisis éagsúla saoil. Úsáidtear go forleathan é sa leigheas, sa talmhaíocht, agus sa bhfeirmeoireacht ainmhithe. Úsáideann Próitéomaíocht Cháilíochtúil teicneolaíocht aitheantais próitéine HPLC-MS/MS chun samplaí a aithint, lena n-áirítear stiallacha glóthaí, IP, agus samplaí CO-IP/Pull down. Baintear amach cainníochtú agus sainaithint chruinn ar na próitéiní uile a chuireann géanóm in iúl nó i gcóras measctha casta le Próitéomaíocht Chainníochtúil. Déantar teicneolaíochtaí próitéomaíochta cainníochtúla reatha a chatagóiriú den chuid is mó i gcur chuige lipéadaithe (TMT) agus saor ó lipéad (Saor ó Lipéad, DIA, PRM). Soláthraíonn BMKGENE réitigh próitéomaíochta il-ardáin agus il-theicneolaíochta.
-
Meitibileolaíocht
Is disciplín iartheachtach den gheanómaíocht í meitibileamaíocht, a dhíríonn go príomha ar shubstaintí beaga-mhóilíní a bhfuil meáchan móilíneach níos lú ná 1500 Da acu. Cuireann sé ar chumas meitibilítí freagairtí orgánach ar spreagthaigh sheachtracha agus ar athruithe fiseolaíocha/paiteolaíocha a léiriú ar bhealach níos íogaire. Tá athruithe ar leibhéal meitibilít de bharr athruithe géiniteacha laistigh dá raon feidhme taighde freisin, rud a sholáthraíonn dearcadh taighde úrnua.
Cuireann BMKGENE réimse iomlán seirbhísí meitibileachta ar fáil, lena n-áirítear meitibileachta neamhspriocdhírithe, meitibileachta spriocdhírithe go forleathan, agus meitibileachta spriocdhírithe. Ag baint úsáide as crómatagrafaíocht leachtach-mais-speictriméadracht (LC-MS) nó crómatagrafaíocht gháis-mais-speictriméadracht (GC-MS), is féidir na hathruithe dinimiciúla i bhformhór na meitibilítí beaga móilíní in orgánaigh roimh agus tar éis spreagadh seachtrach a bhrath. Tá croílár na seirbhísí seo i meitibilítí a aithint a bhfuil difríochtaí suntasacha iontu idir grúpaí turgnamhacha agus rialaithe agus a gcomhghaol le hathruithe fiseolaíocha/paiteolaíocha agus na meicníochtaí bunúsacha a iniúchadh tuilleadh.
-
Seicheamhú mRNA/LncRNA/CircRNA eiseasómach - Illumina
Is veicilí beaga iad eisisóim a scaoileann cealla, agus de ghnáth bíonn trastomhas idir 30 agus 100 nanaiméadar acu. Tá RNA éagsúil sna veicilí seo. Creidtear go bhfuil róil ríthábhachtacha ag eisisóim i gcumarsáid idircheallach, i bhfreagairtí imdhíonachta, agus i bhforbairt galair, agus is féidir iad a scaipeadh chuig codanna eile den chorp trí shreabháin choirp amhail plasma, seile, agus fual. Iompraíonn siad bithmhóilíní sonracha chun feidhmeanna na gcealla glacadóra a rialáil, rud a théann i bhfeidhm ar stáit fhiseolaíocha ceallacha. Meastar freisin go bhfuil róil thábhachtacha ag eisisóim i bhforbairt galair, lena n-áirítear ailse, galair néar-dhíghiniúnacha, agus coinníollacha athlastacha. Cuireann taighde ar eisisóim léargais agus modhanna nua ar fáil chun galair a dhiagnóisiú, a chóireáil agus a chosc.
-
Seicheamhú RNA Beag Eicsómach-Illumina
Is veicilí beaga iad eisisóim a scaoileann cealla, agus a mbíonn trastomhas idir 30 agus 100 nanaiméadar acu de ghnáth. Tá RNA éagsúil sna veicilí seo. I measc na gcineálacha RNA in eisisóim, is é an micrea-RNA (miRNA) an ceann is coitianta agus is mó a ndéantar staidéar air. Is rang de RNAí beaga neamhchódaithe é miRNA atá thart ar 18-25 núicléatíd ar fhad. Déanann siad idirghabháil i dtostú géine iar-thríscríobh trí cheangal leis an réigiún neamhaistrithe 3′ (3′ UTR) de mRNAí sprice, rud a rialaíonn léiriú géine. Mar shampla, tá miRNAí sonracha in eisisóim a scaoileann cealla meall áirithe, amhail miR-126 agus miR-92a. Is féidir leis na miRNAí seo tionchar a imirt ar léiriú géine i gcealla glacadóra agus angiogenesis meall a chur chun cinn (Tomohiro Umezu, et al., Oncogene, 2012).
-
BMKMANU S3000_Tras-scríbhinn Spásúil
Is teicníc í transcriptóimic spásúil a ligeann dúinn léiriú géine a ghabháil agus a shamhlú laistigh de fhíocháin. Is féidir leis seo a bheith ríthábhachtach chun tuiscint a fháil ar an gcaoi a n-idirghníomhaíonn cealla.
Tá ardáin éagsúla ann don chur chuige seo. Ar an ábhar seo, d'fhorbair BMKGene BMKManu 3000 Spatial transcriptome Chip, ardán a fheabhsaíonn feidhmíocht na teicníce, ag baint taifeach focheallach amach agus ag cumasú socrú taifeach il-leibhéil.
Clúdaíonn an tslis seo 4.2 milliún spota ag baint úsáide as teicneolaíocht phaitinnithe de mhicreathonnáin atá sraitheáilte le coirníní atá luchtaithe le tóireadóirí barrachódaithe go spásúil. Leis an modh seo, tar éis an ghabhála agus an aimplithe, faighimid leabharlann cDNA atá saibhrithe leis na samplaí barrachódaithe atá comhoiriúnach le Illumina.
Ar na sonraí, cinntíonn an meascán de chód barra spásúil agus UMIanna cruinneas agus sainiúlacht na sonraí a ghintear. Trí na nithe thuas go léir a chomhcheangal, soláthraíonn BMKManu suíomh sonraí thar a bheith ilúsáideach.
-
Leabharlanna réamhdhéanta DNBSEQ
Is teicneolaíocht nuálach NGS í DNBSEQ, arna forbairt ag MGI, a d’éirigh léi costais sheicheamhaithe a laghdú tuilleadh agus an tréchur a mhéadú. Baineann ullmhú leabharlanna DNBSEQ le hilroinnt DNA, ullmhú ssDNA, agus aimpliú ciorcail rollta chun na nana-liathróidí DNA (DNB) a fháil. Ansin luchtaítear iad seo ar dhromchla soladach agus ina dhiaidh sin déantar iad a sheicheamhú trí Shintéis Tóireoireachta-Aince chomhcheangailte (cPAS). Comhcheanglaíonn teicneolaíocht DNBSEQ na buntáistí a bhaineann le ráta earráide aimplithe íseal a bheith aige le patrúin earráide ard-dlúis a úsáid le nana-liathróidí, rud a fhágann go mbíonn tréchur agus cruinneas níos airde i gceist le seicheamhú.
Cuireann ár seirbhís seicheamhaithe leabharlainne réamhdhéanta ar chumas custaiméirí leabharlanna seicheamhaithe Illumina a ullmhú ó fhoinsí éagsúla (mRNA, an géanóm iomlán, aimplicon, leabharlanna 10x, i measc nithe eile), a thiontú go leabharlanna MGI inár saotharlanna le seicheamhú i DNBSEQ-T7, rud a chuireann ar chumas méideanna móra sonraí a bheith ar fáil ar chostais níos ísle.
-
Idirghníomhaíocht Crómatin bunaithe ar Hi-C
Is modh é Hi-C atá deartha chun cumraíocht ghéanómach a ghabháil trí idirghníomhaíochtaí bunaithe ar ghaireacht agus seicheamhú ard-tréchur a chomhcheangal. Tá an modh bunaithe ar thrasnascadh crómatin le formaildéad, agus ina dhiaidh sin díleá agus ath-ligation ar bhealach nach ndéanfaidh ach blúirí atá nasctha go comhfhiúsach táirgí ligation a fhoirmiú. Trí na táirgí ligation seo a sheicheamhú, is féidir eagrú 3T an ghéanóim a staidéar. Cumasaíonn Hi-C staidéar a dhéanamh ar dháileadh na gcodanna den ghéanóm atá pacáilte go héadrom (urranna A, eocrómatin) agus is dóichí a bheith gníomhach ó thaobh trascríobh de, agus na réigiúin atá pacáilte níos dlúithe (urranna B, Heitreacrómatin). Is féidir Hi-C a úsáid freisin chun Fearainn Chomhlachaithe go Toipeolaíoch (TADanna) a aithint, réigiúin den ghéanóm a bhfuil struchtúir fillte acu agus ar dócha go mbeidh patrúin léirithe comhchosúla acu, agus chun lúba crómatin a aithint, réigiúin DNA atá ancaire le chéile ag próitéiní agus atá saibhrithe go minic in eilimintí rialála. Tugann seirbhís seicheamhú Hi-C BMKGene cumhacht do thaighdeoirí iniúchadh a dhéanamh ar thoisí spásúla na géanómaice, ag oscailt bealaí nua chun rialáil an ghéanóim agus a impleachtaí i sláinte agus i ngalar a thuiscint.
-
Tuaslagán mRNA Lánfhaid PacBio 2+3
Cé gur uirlis ilúsáideach í seicheamhú mRNA bunaithe ar NGS chun léiriú géine a chainníochtú, cuireann a brath ar léamha gearra srian ar a héifeachtúlacht in anailísí trascríptómacha casta. Ar an láimh eile, úsáideann seicheamhú PacBio (Iso-Seq) teicneolaíocht léamha fada, rud a chuireann ar chumas tras-scríbhinní mRNA lánfhaid a sheicheamhú. Éascaíonn an cur chuige seo iniúchadh cuimsitheach ar splaiseadh malartach, comhleá géine, agus pola-adenylation, cé nach é an rogha is mó é le haghaidh cainníochtú léiriú géine. Droicheadaíonn an teaglaim 2+3 an bhearna idir Illumina agus PacBio trí bhrath ar léamha PacBio HiFi chun an tsraith iomlán d'isofhoirmeacha tras-scríbhinne a aithint agus seicheamhú NGS chun na hisofhoirmeacha comhionanna a chainníochtú.
Ardáin: PacBio Revio agus Illumina NovaSeq
-
Anailís Chomhlachais ar fud an Ghéanóim
Is é aidhm Staidéir Chomhlachais ar fud an Ghéanóim (GWAS) ná athróga géiniteacha (géanóipeanna) a aithint atá nasctha le tréithe sonracha (feinitíopaí). Trí mharcóirí géiniteacha a scrúdú ar fud an ghéanóim iomláin i líon mór daoine aonair, déanann GWAS comhlachais géinitíop-feinitíop a eastósú trí anailísí staitistiúla ar leibhéal an daonra. Faigheann an modheolaíocht seo feidhmeanna fairsinge i dtaighde galair dhaonna agus in iniúchadh géinte feidhmiúla a bhaineann le tréithe casta in ainmhithe nó i bplandaí.
Ag BMKGENE, cuirimid dhá bhealach ar fáil chun GWAS a dhéanamh ar dhaonraí móra: Seicheamhú Iomlán-Ghéanóim (WGS) a úsáid nó modh seicheamhú géanóim ionadaíochta laghdaithe a roghnú, an Fragment Aimplithe Lóchais Shonrach (SLAF) atá forbartha againn féin. Cé go n-oireann WGS do ghéanóim níos lú, tagann SLAF chun cinn mar rogha eile cost-éifeachtach chun staidéar a dhéanamh ar dhaonraí níos mó le géanóim níos faide, rud a íoslaghdaíonn costais seicheamhaithe go héifeachtach, agus a ráthaíonn éifeachtúlacht ard fionnachtana marcóirí géiniteacha ag an am céanna.
-
Seicheamhú RNA núicléas aonair
Tá réabhlóid déanta ag forbairt teicnící gabhála cille aonair agus tógála leabharlainne saincheaptha, in éineacht le seicheamhú ard-tréchur, ar staidéir léirithe géine ag leibhéal na cille. Ligeann an dul chun cinn seo anailís níos doimhne agus níos cuimsithí a dhéanamh ar dhaonraí casta cille, ag sárú na dteorainneacha a bhaineann le meánléiriú géine thar gach cill agus ag caomhnú an fhíor-éagsúlachta laistigh de na daonraí seo. Cé go bhfuil buntáistí doshéanta ag seicheamhú RNA cille aonair (scRNA-seq), bíonn dúshláin ann i bhfíocháin áirithe ina bhfuil sé deacair fionraí cille aonair a chruthú agus ina n-éilíonn sé samplaí úra. Ag BMKGene, aghaidheoimid ar an mbac seo trí sheicheamhú RNA núicléas aonair (snRNA-seq) a thairiscint ag baint úsáide as an teicneolaíocht 10X Genomics Chromium den scoth. Leathnaíonn an cur chuige seo speictream na samplaí atá oiriúnach d'anailís trascríbhinní ag leibhéal na cille aonair.
Déantar núicléis a aonrú tríd an sliseanna nuálach 10X Genomics Chromium, ina bhfuil córas micrishreabhach ocht gcainéal le trasnú dúbailte. Laistigh den chóras seo, déantar coirníní glóthaí ina bhfuil barrachóid, tosaitheoirí, einsímí, agus núicléas aonair a ionchorprú i mbraoiníní ola de mhéid nanailítir, ag cruthú Coirníní Glóthaí in Eibleacht (GEM). Tar éis foirmiú GEM, tarlaíonn lysis cille agus scaoileadh barrachóid laistigh de gach GEM. Ina dhiaidh sin, déantar trascríobh droim ar ais ar mhóilíní mRNA i cDNAanna, lena n-ionchorpraítear barrachóid 10X agus Aitheantóirí Móilíneacha Uathúla (UMIs). Déantar na cDNAanna seo a thógáil faoi thógáil leabharlainne seicheamhaithe caighdeánach ansin, rud a éascaíonn iniúchadh láidir agus cuimsitheach ar phróifílí léirithe géine ag leibhéal na gcealla aonair.
Ardán: 10× Ardán Genomics Chromium agus Illumina NovaSeq
-
Seicheamhú Géanóim Iomlán Plandaí/Ainmhithe
Is teicníc í Seicheamhú Géanóim Iomláin (WGS) a úsáidtear chun seicheamh iomlán DNA ghéanóm orgánaigh a chinneadh ag an am céanna.
De ghnáth, roinntear an tseirbhís ina dhá ghrúpa éagsúla ag brath ar an ngéanóm tagartha atá ann:
- De novoseicheamhú iomlán an ghéanóim.Sa chás seo, níl aon ghéanóm tagartha ar fáil don ghéanóm atá le seicheamhú, agus ar an gcúis sin, is é cuspóir an tseicheamhaithe seo é a ghiniúint (nó ceann atá ann cheana a fheabhsú). Caithfidh an teicníc seo sonraí Illumina agus seicheamhú léitheoireachta fada a úsáid chun tionól an ghéanóim a fheabhsú trí fhorluí a chruthú idir léamha.
- Ath-sheicheamhú.Tagraíonn sé do sheicheamhú iomlán an ghéanóim d’aonair éagsúla de speicis a bhfuil géanóim tagartha ar eolas acu. Ar an mbonn seo, is féidir difríochtaí géanómacha daoine aonair nó daonraí a aithint tuilleadh.
-
Seicheamhú mRNA Lánfhaid-Nanopore
Cé gur uirlis ilúsáideach í seicheamhú mRNA bunaithe ar NGS chun léiriú géine a chainníochtú, cuireann a spleáchas ar léamha gearra srian ar a héifeachtúlacht in anailísí trascríoptómacha casta. Ar an láimh eile, úsáideann seicheamhú nana-phorach teicneolaíocht léamha fada, rud a chuireann ar chumas tras-scríbhinní mRNA lánfhaid a sheicheamhú. Éascaíonn an cur chuige seo iniúchadh cuimsitheach ar splaiseadh malartach, comhleá géine, pola-adenylation, agus cainníochtú isoforms mRNA.
Is modh é seicheamhú nanopóir, modh a bhraitheann ar chomharthaí leictreacha fíor-ama móilíní aonair nanopóir, a thugann torthaí i bhfíor-am. Treoraithe ag próitéiní mótair, ceanglaíonn DNA dé-shnáithe le próitéiní nanopóir atá leabaithe i mbithscannán, ag dífhillteadh agus é ag dul tríd an gcainéal nanopóir faoi dhifríocht voltais. Braitear agus aicmítear na comharthaí leictreacha sainiúla a ghintear ag bunanna éagsúla ar an snáithe DNA i bhfíor-am, rud a éascaíonn seicheamhú núicléatíde cruinn agus leanúnach. Sáraíonn an cur chuige nuálach seo teorainneacha léimh ghearr agus soláthraíonn sé ardán dinimiciúil le haghaidh anailíse géanómaí casta, lena n-áirítear staidéir thrascríptómacha casta, le torthaí láithreacha.
Ardán: Nanopore PromethION 48
