Léarscáil Teasa
Glacann an uirlis Léarscáil Teasa comhad sonraí maitrís mar ionchur agus tugann sé deis d’úsáideoirí sonraí a scagadh, a normalú agus a chnuasú. Is é an phríomhchás úsáide le haghaidh léarscáileanna teasa ná anailís chnuasaigh ar leibhéal léirithe géine idir samplaí éagsúla.
Anótáil Géine
Déanann an uirlis Anótála Géine anótáil géine bunaithe ar ailíniú seicheamh comhad FASTA ionchuir i gcoinne bunachair shonraí éagsúla.
Uirlis Chuardaigh Ailínithe Áitiúil Bhunúsach (BLAST)
Is leagan comhtháite BMKCloud de NCBI BLAST é an uirlis BLAST agus is féidir í a úsáid chun na feidhmeanna céanna a dhéanamh trí úsáid a bhaint as sonraí a uaslódáiltear chuig an gcuntas BMKCloud.
Réamhaisnéis CDS_UTR
Tá an uirlis Réamhaisnéise CDS_UTR deartha chun réigiúin chódaithe (CDS) agus réigiúin neamhchódaithe (UTR) a thuar i seichimh thrascríbhinne ar leith bunaithe ar thorthaí BLAST i gcoinne bunachair shonraí próitéine aitheanta agus torthaí réamhaisnéise ORF.
Plota Manhattan
Cuireann an uirlis Manhattan Plota ar chumas turgnaimh arda samplaí a thaispeáint agus úsáidtear go coitianta í i staidéir chomhlachais ar fud an ghéanóim (GWAS).
Léaráid Circos
Soláthraíonn uirlis Léaráid CIRCOS léirshamhlú éifeachtach ar an gcaoi a bhfuil gnéithe géanómacha dáilte ar fud an ghéanóim. I measc na ngnéithe coitianta tá loci chainníochtúla, SNPanna, InDels, athróga struchtúracha agus líon cóipeanna.
Saibhriú Ontolaíochta Géine (GO)
Soláthraíonn uirlis Saibhrithe GO anailís saibhrithe feidhmiúil. Is é an pacáiste TopGO-Bioconductor an príomhbhogearraí san uirlis seo, lena n-áirítear anailís ar léiriú difreálach, anailís ar shaibhriú GO agus léirshamhlú na dtorthaí.
Anailís Líonra Comhléirithe Géine Ualaithe (WGCNA)
Is modh mianadóireachta sonraí a úsáidtear go forleathan é WGCNA chun modúil chomhléirithe géine a aimsiú. Tá sé infheidhme maidir le tacair sonraí éagsúla léirithe lena n-áirítear sonraí léirithe géine micrea-araí agus NGS.
InterProScan
Soláthraíonn uirlis InterProScan anailís agus aicmiú seicheamh próitéine InterPro.
Saibhriú GO KEGG
Tá uirlis Saibhrithe GO KEGG deartha chun histagram saibhrithe GO, histagram saibhrithe KEGG agus conair saibhrithe KEGG a ghiniúint bunaithe ar shraith géinte a chuirtear ar fáil agus anótáil chomhfhreagrach.
