Léarscáil teasa
Úsáidtear comhad sonraí maitrís le haghaidh líníocht léarscáil teasa, ar féidir sonraí maitrís a scagadh, a normalú agus a bhraisle.Úsáidtear é den chuid is mó le haghaidh anailíse braisle ar leibhéal slonn géine idir samplaí éagsúla.
Anótáil Géine
Déantar anótáil géine trí sheichimh a mhapáil i gcomhad FASTA i gcoinne bunachair shonraí éagsúla.
Anótáil Géine
Uirlis Chuardaigh Bhunúsach Ailínithe Áitiúil
CDS_UTR_Tuar
Tá an uirlis seo deartha chun réigiúin códaithe (CDS) agus réigiúin neamhchódaithe (UTR) a thuar i seichimh tras-scríofa áirithe bunaithe ar phléascadh i gcoinne bunachar sonraí próitéine aithnid agus tuar ORF.
Plota Manhattan
Cuireann plota Manhattan ar chumas taispeáint sonraí le líon mór pointí sonraí.Úsáidtear go coitianta é i staidéir comhlachais ar fud an ghéanóim (GWAS).
Ciorcas
Ligeann léaráid CIRCOS cur i láthair díreach dáiltí SNP, InDeL, SV, CNV ar ghéanóim.
GO_ Saibhriú
Is uirlis é TopGO atá deartha le haghaidh saibhriú feidhmiúil.Is éard atá sa phacáiste TopGO-Bithsheoltóra anailís léiriú difreálach, anailís saibhrithe GO agus léirshamhlú ar na torthaí.Ginfidh sé fillteán le haschur darb ainm "Graph", ina mbeidh torthaí do topGO_BP, topGO_CC agus topGO_MF.
WGCNA
Is modh mianadóireachta sonraí é WGCNA a úsáidtear go forleathan chun modúil chomhléirithe géine a fháil amach.Tá sé infheidhme maidir le tacair sonraí slonn éagsúla lena n-áirítear sonraí micrea-eagair agus sonraí slonn géine a tháinig ó sheicheamhú na chéad ghlúine eile.
IdirProScan
Anailís agus aicmiú seicheamh próitéin InterPro
GO_KEGG_Saibhriú
Dearadh an uirlis seo chun histeagram saibhrithe GO, histeagram saibhrithe KEGG agus cosán saibhrithe KEGG a ghiniúint bunaithe ar thacar géine a cuireadh ar fáil agus anótáil chomhfhreagrach.