-
Seicheamhú RNA núicléas aonair
Tá réabhlóid déanta ag forbairt teicnící gabhála cille aonair agus tógála leabharlainne saincheaptha, in éineacht le seicheamhú ard-tréchur, ar staidéir léirithe géine ag leibhéal na cille. Ligeann an dul chun cinn seo anailís níos doimhne agus níos cuimsithí a dhéanamh ar dhaonraí casta cille, ag sárú na dteorainneacha a bhaineann le meánléiriú géine thar gach cill agus ag caomhnú an fhíor-éagsúlachta laistigh de na daonraí seo. Cé go bhfuil buntáistí doshéanta ag seicheamhú RNA cille aonair (scRNA-seq), bíonn dúshláin ann i bhfíocháin áirithe ina bhfuil sé deacair fionraí cille aonair a chruthú agus ina n-éilíonn sé samplaí úra. Ag BMKGene, aghaidheoimid ar an mbac seo trí sheicheamhú RNA núicléas aonair (snRNA-seq) a thairiscint ag baint úsáide as an teicneolaíocht 10X Genomics Chromium den scoth. Leathnaíonn an cur chuige seo speictream na samplaí atá oiriúnach d'anailís trascríbhinní ag leibhéal na cille aonair.
Déantar núicléis a aonrú tríd an sliseanna nuálach 10X Genomics Chromium, ina bhfuil córas micrishreabhach ocht gcainéal le trasnú dúbailte. Laistigh den chóras seo, déantar coirníní glóthaí ina bhfuil barrachóid, tosaitheoirí, einsímí, agus núicléas aonair a ionchorprú i mbraoiníní ola de mhéid nanailítir, ag cruthú Coirníní Glóthaí in Eibleacht (GEM). Tar éis foirmiú GEM, tarlaíonn lysis cille agus scaoileadh barrachóid laistigh de gach GEM. Ina dhiaidh sin, déantar trascríobh droim ar ais ar mhóilíní mRNA i cDNAanna, lena n-ionchorpraítear barrachóid 10X agus Aitheantóirí Móilíneacha Uathúla (UMIs). Déantar na cDNAanna seo a thógáil faoi thógáil leabharlainne seicheamhaithe caighdeánach ansin, rud a éascaíonn iniúchadh láidir agus cuimsitheach ar phróifílí léirithe géine ag leibhéal na gcealla aonair.
Ardán: 10× Ardán Genomics Chromium agus Illumina NovaSeq
-
Seicheamhú mRNA Lánfhaid-Nanopore
Cé gur uirlis ilúsáideach í seicheamhú mRNA bunaithe ar NGS chun léiriú géine a chainníochtú, cuireann a spleáchas ar léamha gearra srian ar a héifeachtúlacht in anailísí trascríoptómacha casta. Ar an láimh eile, úsáideann seicheamhú nana-phorach teicneolaíocht léamha fada, rud a chuireann ar chumas tras-scríbhinní mRNA lánfhaid a sheicheamhú. Éascaíonn an cur chuige seo iniúchadh cuimsitheach ar splaiseadh malartach, comhleá géine, pola-adenylation, agus cainníochtú isoforms mRNA.
Is modh é seicheamhú nanopóir, modh a bhraitheann ar chomharthaí leictreacha fíor-ama móilíní aonair nanopóir, a thugann torthaí i bhfíor-am. Treoraithe ag próitéiní mótair, ceanglaíonn DNA dé-shnáithe le próitéiní nanopóir atá leabaithe i mbithscannán, ag dífhillteadh agus é ag dul tríd an gcainéal nanopóir faoi dhifríocht voltais. Braitear agus aicmítear na comharthaí leictreacha sainiúla a ghintear ag bunanna éagsúla ar an snáithe DNA i bhfíor-am, rud a éascaíonn seicheamhú núicléatíde cruinn agus leanúnach. Sáraíonn an cur chuige nuálach seo teorainneacha léimh ghearr agus soláthraíonn sé ardán dinimiciúil le haghaidh anailíse géanómaí casta, lena n-áirítear staidéir thrascríptómacha casta, le torthaí láithreacha.
Ardán: Nanopore PromethION 48
-
Seicheamhú mRNA lánfhaid -PacBio
Cé gur uirlis ilúsáideach é seicheamhú mRNA bunaithe ar NGS chun géinléiriú a chainníochtú, cuireann a spleáchas ar léamha gearra srian ar a úsáid in anailísí trascríoptómacha casta. Ar an láimh eile, úsáideann seicheamhú PacBio (Iso-Seq) teicneolaíocht léite fada, rud a chuireann ar chumas tras-scríbhinní mRNA lánfhaid a sheicheamhú. Éascaíonn an cur chuige seo iniúchadh cuimsitheach ar splaiseadh malartach, comhleá géine, agus pola-adenylation. Mar sin féin, tá roghanna eile ann maidir le cainníochtú géinléirithe mar gheall ar an méid mór sonraí a theastaíonn. Braitheann teicneolaíocht seicheamhú PacBio ar sheicheamhú aon-mhóilíne, fíor-ama (SMRT), rud a sholáthraíonn buntáiste soiléir maidir le tras-scríbhinní mRNA lánfhaid a ghabháil. Baineann an cur chuige nuálach seo le húsáid tonntreoraithe mód nialas (ZMWanna) agus tobair mhicrea-mhonaraithe a chuireann ar chumas breathnóireacht fíor-ama ar ghníomhaíocht polaiméaráise DNA le linn seicheamhú. Laistigh de na ZMWanna seo, sintéisíonn polaiméaráis DNA PacBio snáithe comhlántach DNA, ag giniúint léamha fada a shíneann thar iomlán na dtras-scríbhinní mRNA. Feabhsaíonn oibriú PacBio i mód seicheamhú Comhthoilithe Ciorclach (CCS) cruinneas tríd an móilín céanna a sheicheamhú arís agus arís eile. Tá cruinneas inchomparáide le NGS ag na léamha HiFi a ghintear, rud a chuireann tuilleadh le hanailís chuimsitheach agus iontaofa ar ghnéithe tras-scríbhinní casta.
Ardán: PacBio Sequel II; PacBio Revio
-
Seicheamhú mRNA Eocarótach-NGS
Is teicníc í seicheamhú mRNA a úsáideann seicheamhú den chéad ghlúin eile chun láithreacht agus cainníocht móilíní RNA i sampla bitheolaíoch a nochtadh, rud a thugann léargas ar léiriú géine sa sampla.
Leis an raon feidhme fairsing atá aige, nochtann an uirlis cheannródaíoch seo próifílí casta géinléirithe, struchtúir géine, agus meicníochtaí móilíneacha a bhaineann le próisis bhitheolaíocha éagsúla.
Glactar leis an teicníc seo go forleathan i dtaighde, i ndiagnóisic chliniciúil agus i bhforbairt drugaí, ós rud é go dtugann sí léargas ar chastacht dinimic cheallacha agus rialáil ghéiniteach, rud a sholáthraíonn bonn láidir chun fiosracht a mhúscailt faoina cumas i réimsí éagsúla.
Ardáin atá ar fáil: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7
-
Seicheamhú mRNA Neamh-Thagartha-NGS
Cumasaíonn seicheamhú mRNA próifíliú cuimsitheach a dhéanamh ar gach trascríbhinn mRNA laistigh de chealla faoi choinníollacha sonracha. Feidhmíonn an teicneolaíocht cheannródaíoch seo mar uirlis chumhachtach, ag nochtadh próifílí casta géinléirithe, struchtúir géine, agus meicníochtaí móilíneacha a bhaineann le próisis bhitheolaíocha éagsúla. Glactar go forleathan leis i dtaighde bunúsach, i ndiagnóisic chliniciúil, agus i bhforbairt drugaí, agus cuireann seicheamhú mRNA léargas ar fáil ar chastacht dinimic cheallacha agus rialáil ghéiniteach.
Ardán: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7
-
Seicheamhú Fada Neamhchódaithe-Illumina
Is RNAanna fada neamhchódaithe (lncRNAanna) iad RNAanna fada neamhchódaithe (lncRNAanna) atá níos faide ná 200 núicléatíd agus nach bhfuil mórán acmhainneachta códaithe acu agus is eilimintí ríthábhachtacha iad laistigh d'RNA neamhchódaithe. Faightear na RNAanna seo sa núicléas agus sa chíteaplasma, agus tá róil ríthábhachtacha acu i rialáil eipiginéiteach, trascríobhach agus iar-trascríobhach, rud a chuireann béim ar a dtábhacht i múnlú próisis cheallacha agus mhóilíneacha. Is uirlis chumhachtach í seicheamhú lncRNA i ndifreáil cealla, in ontogenesis agus i ngalair dhaonna.
Ardán: Illumina NovaSeq X
-
Seicheamhú RNA Beag-Illumina
Is grúpa móilíní RNA é RNA beag lena n-áirítear micrea-RNAanna (miRNAanna), RNAanna beaga cur isteach (siRNAanna), agus RNAanna idirghníomhacha piwi (piRNAanna). I measc na rudaí seo, tá miRNAanna, atá thart ar 18-25 núicléatíd ar fhad, suntasach go háirithe as a róil rialála lárnacha i bpróisis cheallacha éagsúla. Le patrúin léirithe fíocháin-shonracha agus céim-shonracha, taispeánann miRNAanna caomhnú ard i measc speiceas éagsúil.
Ardán: Illumina NovaSeq
-
Seicheamhú CircRNA-Illumina
Déanann seicheamhú RNA ciorclach (circRNA-seq) próifíliú agus anailís ar RNA ciorclacha, rang móilíní RNA a chruthaíonn lúba dúnta mar gheall ar imeachtaí splaisithe neamhchanónacha, rud a thugann cobhsaíocht mhéadaithe don RNA seo. Cé gur léiríodh go bhfeidhmíonn roinnt circRNA mar spúinsí micrea-RNA, ag seicheamhú micrea-RNA agus ag cosc orthu a mRNAanna sprice a rialáil, féadfaidh circRNA eile idirghníomhú le próitéiní, léiriú géine a mhodhnú, nó róil a bheith acu i bpróisis cheallacha. Tugann anailís léiriú circRNA léargas ar róil rialála na móilíní seo agus a dtábhacht i bpróisis cheallacha éagsúla, i gcéimeanna forbartha, agus i riochtaí galair, rud a chuireann le tuiscint níos doimhne ar chastacht rialáil RNA i gcomhthéacs léiriú géine.
Ardán: Illumina Novaseq X
-
Seicheamhú Tras-scríbhinní Iomlána – Illumina
Cuireann seicheamhú trascríptóim Wole cur chuige cuimsitheach ar fáil chun móilíní RNA éagsúla a phróifíliú, lena n-áirítear RNA códaithe (mRNA) agus neamhchódaithe (lncRNA, circRNA, agus miRNA). Gabhann an teicníc seo trascríptóim iomlán cealla sonracha ag nóiméad ar leith, rud a chuireann ar chumas tuiscint iomlánaíoch ar phróisis cheallacha.
Ardáin atá ar fáil: Illumina Novaseq X
