mRNA-seq (NGS) le géanóm tagartha
Is uirlis chaighdeánach é RNA-seq trasna na n-eolaíochtaí beatha agus barr, ag líonadh an bhearna idir ghéanóim agus próitéóim. Tá a neart i bhfionnachtain trascríbhinní nua agus i gcainníochtú a léirithe in aon mheasúnacht amháin. Úsáidtear go forleathan é le haghaidh staidéir thrascríbhinne chomparáideacha, ag caitheamh solais ar ghéinte a bhaineann le tréithe nó feinitíopaí éagsúla, amhail sócháin a chur i gcomparáid le cineálacha fiáine nó léiriú géine a nochtadh faoi choinníollacha sonracha. Comhtháthaíonn APP mRNA(Tagairt) BMKCloud cainníochtú léirithe, anailís difreálach léirithe (DEG), agus anailísí struchtúr seicheamh isteach sa phíblíne bithfhaisnéise mRNA-seq(NGS) agus comhcheanglaíonn sé láidreachtaí bogearraí comhchosúla, ag cinntiú áisiúlachta agus cairdiúlachta úsáideora. Is féidir le húsáideoirí a gcuid sonraí RNA-seq a uaslódáil chuig an scamall, áit a dtugann an Aip réiteach cuimsitheach, aon-stad d'anailís bhithfhaisnéise. Ina theannta sin, tugann sé tús áite do thaithí an chustaiméara, ag tairiscint oibríochtaí pearsantaithe atá oiriúnaithe do riachtanais shonracha úsáideoirí. Is féidir le húsáideoirí paraiméadair a shocrú agus misean na píblíne a chur isteach leo féin, an tuarascáil idirghníomhach a sheiceáil, sonraí/léaráidí a fheiceáil agus mianadóireacht sonraí a chomhlánú, amhail: roghnú géine sprice, braisliú feidhmiúil, léaráidí, etc.
Ardán:Illumina, MGI
Straitéis:RNA-Seq
Leagan Amach: Páirithe, glan-shonraí.
Cineál leabharlainne:fr-neamhshnáithe, fr-chéadshnáithe nó fr-darashnáithe
Fad léite:150 bp
Cineál comhaid:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz nó *.fq.gz. Déanfaidh an córaspéireáil na comhaid .fastq go huathoibríoch de réir a n-ainmneacha comhad,m.sh. *_1.fastq péireáilte le *._2.fastq.
Líon na samplaí:Níl aon srianta ar an líonde shamplaí, ach méadóidh an t-am anailíse de réir mar a líonannFásann samplaí.
Méid Sonraí Molta:6G in aghaidh an tsampla
