BMKCloud Log in
条形meirge-03

Táirgí

Seicheamhú Metagenomic-Nanópóir

Is uirlis mhóilíneach é Metagenomics a úsáidtear chun anailís a dhéanamh ar na hábhair ghéanómacha measctha a bhaintear as samplaí comhshaoil, a sholáthraíonn faisnéis mhionsonraithe maidir le héagsúlacht agus raidhse speiceas, struchtúr daonra, caidreamh phylogenetic, géinte feidhme agus líonra comhghaoil ​​le fachtóirí comhshaoil, etc. Tá ardáin seicheamhaithe Nanopore tugtha isteach le déanaí le staidéir mheitigenomic.Chuir a fheidhmíocht den scoth maidir le fad léite go mór le hanailís mheitigenómach síos-srutha, go háirithe cóimeáil meitigenóim.Ag baint leasa as fad léimh, tá staidéar meitigenómach bunaithe ar Nana-Pór in ann cóimeáil níos leanúnaí a bhaint amach i gcomparáid le meiteiginómaíocht gunna gráin.Foilsíodh gur éirigh le meitigenomics bunaithe ar Nanópóir géanóim iomlána agus dúnta baictéaracha a ghiniúint ó mhicribhithóim (Moss, EL, et. al,Biotech Dúlra, 2020)

Ardán:Nanopore PromethION P48


Sonraí Seirbhíse

Torthaí Taispeána

Cás BMK

Buntáistí Seirbhíse

● Ard-chaighdeán cóimeála-Feabhas a chur ar chruinneas sainaithint speiceas agus tuar géine feidhme

● Leithlisiú genome baictéarach dúnta

● Feidhmiú níos cumhachtaí agus níos iontaofa i réimsí éagsúla, m.sh. miocrorgánaigh phataigineacha nó géinte a bhaineann le frithsheasmhacht in aghaidh antaibheathach a bhrath

● Anailís mheitigenóim chomparáideach

Sonraíochtaí Seirbhíse

 Ardán

Seicheamhú

Sonraí molta

Am Slánúcháin

Nanópóir

ONT

6G/10G

65 lá oibre

Anailísí bithfhaisnéisíochta

● Rialú cáilíochta sonraí amh

● Tionól Metagenome

● Tacar géine agus anótáil nach bhfuil iomarcach

● Anailís ar éagsúlacht speiceas

● Anailís éagsúlachta feidhmeanna géiniteacha

● Anailís idirghrúpa

● Anailís comhlachais i gcoinne fachtóirí turgnamhacha

nanabhar

Riachtanais Samplacha agus Seachadadh

Riachtanais shamplacha agus seachadadh

Riachtanais Shamplacha:   

Le haghaidhsleachta DNA:

Cineál Samplach

Méid

Tiúchan

Íonachta

sleachta DNA

1-1.5 μg

> 20 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

Le haghaidh samplaí comhshaoil:

Cineál samplach

Nós imeachta samplála molta

Ithir

Méid samplála: thart.5 g;Ní mór an tsubstaint withered atá fágtha a bhaint den dromchla;Meilt píosaí móra agus pas a fháil trí scagaire 2 mm;Samplaí Aliquot in EP-feadán steiriúil nó cyrotube le haghaidh áirithinte.

Feces

Méid samplála: thart.5 g;Bailigh agus tabhair samplaí in EP-fheadán steiriúil nó i gcriootube lena áirithint.

Ábhar stéig

Ní mór samplaí a phróiseáil faoi riocht aiseipteach.Nigh an fíochán bailithe le PBS;Déan an PBS a lártheifneoir agus bailigh an deascán i bhfeadáin PE.

Sloda

Méid samplála: thart.5 g;Bailigh agus lig an sampla sloda in EP-fheadán steiriúil nó i gcriootube lena chur in áirithe

Dobharlach

Le haghaidh sampla le méid teoranta miocróbach, mar shampla uisce sconna, uisce tobair, etc., Bailigh 1 L uisce ar a laghad agus pas a fháil trí scagaire 0.22 μm chun miocróbach a shaibhriú ar an membrane.Stóráil an membrane i bhfeadán steiriúil.

Craiceann

Déan dromchla craiceann a scrapeadh go cúramach le swab cadáis steiriúla nó lann máinliachta agus cuir i bhfeadán steiriúil é.

Seachadadh Samplach Molta

Reo na samplaí i nítrigine leachtach ar feadh 3-4 uair an chloig agus a stóráil i nítrigine leachtach nó -80 céim go áirithinte fadtéarmach.Tá gá le seoladh samplach le h-oighear tirim.

Sreabhadh Oibre Seirbhíse

seachadadh samplach

Seachadadh samplach

Ullmhúchán Leabharlainne

Tógáil leabharlainne

Seicheamhú

Seicheamhú

Anailís sonraí

Anailís sonraí

Seirbhísí tar éis díol

Seirbhísí iar-díola


  • Roimhe Seo:
  • Ar Aghaidh:

  • 1.Heatmap: Cnuasú saibhreas speiceas3Géin 2.Feidhmeacha atá anótáilte do bhealaí meitibileach KEGG4Líonra comhghaol 3.Species54.Circos de ghéinte friotaíochta antaibheathach CARD
    6

    Cás BMK

    Cuireann meitigenomics nana-por ar chumas diagnóis chliniciúil tapa ar ionfhabhtú baictéarach riospráide íochtair

    Foilsithe:Biteicneolaíocht an Dúlra, 2019

    Buaicphointí Teicniúla
    Seicheamhú: Nanopore MinION
    Bithfhaisnéisíocht mheitigenomics chliniciúil: ídiú DNA óstaigh, anailís WIMP agus ARMA
    Brath tapa: 6 uair an chloig
    Íogaireacht ard: 96.6%

    Príomhthorthaí

    I 2006, ba chúis le hionfhabhtú riospráide níos ísle (CD) 3 mhilliún duine ar fud an domhain.Is é an modh tipiciúil chun pataigin LR1 a bhrath ná saothrú, a bhfuil droch-íogaireacht aige, aga slánúcháin fada agus a bhfuil easpa treorach ann i dteiripe antaibheathach go luath.Tá géarghá le fada le diagnóis mhiocróbach tapa agus chruinn.D'fhorbair an Dr Justin ó Ollscoil East Anglia agus a chomhpháirtithe modh metagenomic bunaithe ar Nanópóir chun pataigin a bhrath.De réir a sreabhadh oibre, is féidir 99.99% de DNA óstach a laghdú.Is féidir braite i bpataiginí agus géinte frithsheasmhach in aghaidh antaibheathach a chríochnú i 6 uair an chloig.

    Tagairt
    Charalampous, T. , Kay, GL , Richardson, H. , Aydin, A. , & O'Grady, J. .(2019).Cuireann meitigenomics nana-por ar chumas diagnóis chliniciúil tapa ar ionfhabhtú baictéarach riospráide íochtair.Biteicneolaíocht an Dúlra, 37(7), 1.

    fháil ceanglófar

    Scríobh do theachtaireacht anseo agus seol chugainn é

    Seol do theachtaireacht chugainn: