Anailís Chomhlachais ar fud an Ghéanóim
Sreabhadh Oibre
Buntáistí Seirbhíse
●Saineolas fairsing agus taifid fhoilsitheoireachtaLe taithí charntha i nGréasáin Chomhtháite Uisce (GWAS), tá na céadta tionscadal speicis curtha i gcrích ag BMKGene i dtaighde daonra GWAS, chabhraigh sé le taighdeoirí níos mó ná 100 alt a fhoilsiú, agus shroich an fachtóir tionchair carnach 500.
● Anailís chuimsitheach bithfhaisnéiseáirítear sa shreabhadh oibre anailís chomhlachais tréithe SNP, ag seachadadh sraith géinte iarrthóra agus a n-anótáil fheidhmiúil chomhfhreagrach.
●Foireann bithfhaisnéisíochta ardcháilithe agus timthriall anailíse gearrLe taithí mhór in anailís gheanómach ardleibhéil, seachadann foireann BMKGene anailísí cuimsitheacha le ham tiontaithe tapa.
●Tacaíocht Iar-Dhíolacháin:Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú tionscadail le tréimhse seirbhíse iar-díola 3 mhí. Le linn an ama seo, cuirimid obair leantach tionscadail, cúnamh le fabhtcheartú, agus seisiúin C&F ar fáil chun aon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí a fhreagairt.
Sonraíochtaí agus ceanglais seirbhíse
| Cineál seicheamhúcháin | Scála daonra molta | Straitéis seicheamhúcháin | Riachtanais núicléatíde |
| Seicheamhú Géanóim Iomlán | 200 sampla | 10x | Tiúchan: ≥ 1 ng/µL Méid iomlán ≥ 30ng Díghrádú nó éilliú teoranta nó gan aon dhíghrádú nó éilliú |
| Blúir Aimplithe Lócas Sonrach (SLAF) | Doimhneacht an chlib: 10x Líon na gclibeanna: < 400 Mb: Moltar WGS < 1Gb: 100K clibeanna 1Gb > 2Gb: 300K clibeanna Uasmhéid 500k clibeanna | Tiúchan ≥ 5 ng/µL Méid iomlán ≥ 80 ng Nana-bhraon OD260/280=1.6-2.5 Glóthach agaróise: gan aon dhíghrádú nó éilliú nó éilliú teoranta
|
Roghnú Ábhar
Cineálacha éagsúla, fospeicis, cineálacha talún/bainc géine/teaghlaigh mheasctha/acmhainní fiáine
Cineálacha, fospeicis, cineálacha talún éagsúla
Teaghlach leathdheirfiúracha/teaghlach lándheirfiúracha/acmhainní fiáine
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Dearadh turgnaimh
Seachadadh samplach
Eastóscadh RNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Áirítear an anailís seo a leanas:
- Anailís chomhlachais ar fud an ghéanóim: samhail LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Anótáil fheidhmiúil ar ghéinte iarrthóra
Anailís chomhlachais tréithe SNP – plota Manhattan
Anailís chomhlachais tréithe SNP – plota QQ
Iniúch na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí de GWAS BMKGene trí bhailiúchán coimeádta foilseachán:
Lv, L. et al. (2023) 'Léargas ar bhunús géiniteach caoinfhulaingt amóinia i mbreallóg rásúir Sinonovacula constricta trí staidéar comhlachais ar fud an ghéanóim',Dobharshaothrú, 569, lch. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Nochtann anailísí il-ómacha ar 398 gabháltas muiléad eireaball sionnach réigiúin gheanómacha a bhaineann le ceansú, tréithe meitibilít, agus éifeachtaí frith-athlastacha',Gléasra Móilíneach, 15(8), lgh. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Mapáil Chomhlachais ar fud an Ghéanóim de Fhéinitíopaí Hulless Barely i dTimpeallacht Triomach',Teorainneacha san Eolaíocht Plandaí, 13, lch. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'Tugann GmST1, a chódaíonn sulfotransferase, friotaíocht do shraitheanna víris mósáice pónaire soighe G2 agus G3',Planda, Cill & Timpeallacht, 44(8), lgh. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
