Seicheamhú Aimplicon (16S/18S/ITS)

Is modh é seicheamhú Amplicon (16S/18S/ITS) le Illumina chun éagsúlacht mhiocróbach a anailísiú trí phróifílí miocróbacha a aithint de réir a seicheamh agus ansin iarracht a dhéanamh saibhreas agus éagsúlacht phobail a dhíchódú laistigh de gach sampla agus idir samplaí. Ceadaíonn píblíne BMKCloud Amplicon (NGS) anailís a dhéanamh ar ghéinte 16S, 18S, ITS agus ilghéinte feidhmiúla. Tosaíonn sé le bearradh léamha, tionól léamha péireáilte agus measúnú cáilíochta, agus ina dhiaidh sin braisliú léamha comhchosúla chun Aonaid Tacsanomaíocha Oibríochtúla (OTUanna) a ghiniúint a úsáidtear i sé chuid anailíse éagsúla. Soláthraíonn anótáil tacsanomaíoch faisnéis faoi líonmhaireacht agus comhdhéanamh coibhneasta gach sampla, agus díríonn anailísí éagsúlachta alfa agus béite ar éagsúlacht mhiocróbach laistigh de shamplaí agus idir samplaí, faoi seach. Faigheann anailís dhifreálach idir grúpaí OTUanna atá difriúil ag baint úsáide as tástálacha paraiméadracha agus neamhpharaiméadracha araon, agus nascann anailís chomhghaolmhaireachta na difríochtaí seo le tosca comhshaoil. Ar deireadh, déantar flúirse géine feidhmiúla a thuar bunaithe ar líonmhaireacht géine marcóra, rud a thugann léargas ar fheidhm agus éiceolaíocht i ngach sampla.