条形meirge-03

Táirgí

Seicheamhú DNA/RNA – Seicheamhóir Nanopóir

Is teicneolaíocht seicheamhaithe comharthaí leictrigh fíor-ama móilín aonair í seicheamhú ONT atá bunaithe ar nana-phóir, agus tá prionsabal seicheamhaithe gach ardáin mar an gcéanna. Ceanglóidh DNA/RNA dé-shnáithe le próitéin nana-phóiriúil atá leabaithe sa bhithfhilm agus ag dífhillte faoi threoir próitéine mótair. Faoi ghníomh difríochta voltais ó dhá thaobh an bhithfhilm, téann snáitheanna DNA/RNA tríd an bpróitéin sa chainéal nana-phóir ag ráta áirithe. Mar gheall ar na difríochtaí in airíonna ceimiceacha na mbonn éagsúil ar an snáithe DNA/RNA, nuair a théann bonn aonair nó móilín DNA tríd an gcainéal nana-phóir, beidh athrú ar chomharthaí leictreacha éagsúla mar thoradh air. Trí na comharthaí seo a bhrath agus a chomhfhreagras, is féidir na cineálacha bonn comhfhreagracha a ríomh, agus is féidir brath fíor-ama an tseicheamh a chríochnú.


Sonraí Seirbhíse

Toradh Taispeántais

Sonraí Seirbhíse Gnéithe

Ardán

Méid na Leabharlainne

Toradh Sonraí Teoiriciúla (In aghaidh na Cille)

Cruinneas Aonbhonn

Feidhmchláir

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultrafhada, cDNA-PCR

70-90Gb/Ceall

85-92%

Glaoch SV, De novo, Seicheamhú lánfhaid, Iso-Seq, Anótáil géine, Brath meitiliúcháin DNA

Buntáistí Seirbhíse

● Os cionn 5 bliana de thaithí ar ardán seicheamhúcháin PacBio le na mílte tionscadal dúnta le speicis éagsúla.
● Is comhpháirtí oifigiúil de chuid Oxford Nanopore é BMKGENE, le deimhniú RNA/DNA dé-ardáin.
● Tá samhlacha príomhshrutha seicheamhóirí ann a bhfuil trealamh iomlán agus tréchur seicheamhaithe leordhóthanach acu.
● Bunaithe ar ardán Nanopore, tá níos mó ná 10 taighde Denovo ar ainmhithe agus plandaí foilsithe in irisí aitheanta go hidirnáisiúnta.

Riachtanais Shamplacha


Cineál Samplach

Méid

Tiúchan (Qubit ®)

Imleabhar

Íonacht

Daoine eile

DNA geanómach

Ag brath ar Riachtanas Sonraí

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Buaic shoiléir ag 260 nm, gan aon éillithe

Ní mór tiúchan a thomhas le Qubit agus Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA iomlán

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; gan aon éillithe

Luach RIN ≥7.5

 

Sreabhadh Oibre Seirbhíse

ullmhú samplach

Ullmhú samplach

Ullmhúchán Leabharlainne

Tógáil leabharlainne

Seicheamhú

Seicheamhú

Anailís sonraí

Anailís sonraí

Sampla QC

Seachadadh tionscadail


  • Roimhe Seo:
  • Ar Aghaidh:

  • Measúnú Cáilíochta Sonraí ar Shampla DNA

    Tábla 1. Staitisticí ar shonraí glana.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    glanSeicheamhUimhir

    glanSumBase

    glanN50Len

    glanN90Len

    glanMeanLen

    glanMaxLen

    glanMeanCáilíocht

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    Measúnú Cáilíochta Sonraí ar Shampla RNA

    Tábla 1. Staitisticí ar shonraí glana.

    Ainm Comhaid

    Aitheantas Cliant

    LéighUimhir

    UimhirBhunús

    N50

    Meánfhad

    Fad Uasta

    MeánscórQ

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    C12

    Fíor 1. Dáileadh fad léitheoireachta

    A3

    Fíor 2. Dáileadh scór cáilíochta sonraí glana

    A4

    Fíor 3. Dáileadh scór faid agus cáilíochta sonraí glana

    A5

    faigh luachan

    Scríobh do theachtaireacht anseo agus seol chugainn í

    Seol do theachtaireacht chugainn: