-
Seicheamhú Meitagéineomach -NGS
Is bailiúchán d'ábhar géiniteach iomlán pobail mheasctha orgánach é meitigéinóm, amhail meitigéinóm comhshaoil agus daonna. Tá géinómaí miocrorgánach in-saothraithe agus neamh-in-saothraithe ann. Cuireann seicheamhú meitigéineomach gunna gráin le NGS ar chumas staidéar a dhéanamh ar na tírdhreacha géanómacha casta seo atá leabaithe i samplaí comhshaoil trí níos mó ná próifíliú tacsanomaíoch a sholáthar, ag tabhairt léargais mhionsonraithe freisin ar éagsúlacht speiceas, dinimic flúirse, agus struchtúir chasta daonra. Thar staidéir thacsanomaíocha, cuireann meitigéinómaíocht gunna gráin peirspictíocht géanómach feidhmiúil ar fáil freisin, rud a chuireann ar chumas iniúchadh a dhéanamh ar ghéinte ionchódaithe agus a róil ionchasacha i bpróisis éiceolaíocha. Ar deireadh, cuireann bunú líonraí comhghaoil idir eilimintí géiniteacha agus fachtóirí comhshaoil le tuiscint iomlánaíoch ar an idirghníomhaíocht chasta idir pobail mhiocróbacha agus a gcúlra éiceolaíoch. Mar fhocal scoir, seasann seicheamhú meitigéineomach mar uirlis lárnach chun castachtaí géanómacha pobal miocróbach éagsúil a nochtadh, ag soilsiú na gcaidrimh ilghnéitheacha idir géineolaíocht agus éiceolaíocht laistigh de na héiceachórais chasta seo.
Ardáin: Illumina NovaSeq agus DNBSEQ-T7
-
Seicheamhú Meitagéineamach-TGS
Is bailiúchán d'ábhar géiniteach pobail mheasctha orgánach é meitigéinóm, amhail meitigéinóm comhshaoil agus daonna. Tá géanóim miocrorgánach in-saothraithe agus neamh-saothraithe ann. Cuireann seicheamhú meitigéineomach ar chumas staidéar a dhéanamh ar na tírdhreacha géanómacha casta seo atá leabaithe i samplaí éiceolaíocha trí níos mó ná próifíliú tacsanomaíoch a sholáthar. Cuireann sé dearcadh géanómach feidhmiúil ar fáil freisin trí iniúchadh a dhéanamh ar na géinte ionchódaithe agus a róil ionchasacha i bpróisis chomhshaoil. Cé gur úsáideadh cur chuige traidisiúnta gunna gráin le seicheamhú Illumina go forleathan i staidéir mheitiigéineomach, tá teacht chun cinn seicheamhú léite fada Nanopore agus PacBio tar éis an réimse a athrú. Feabhsaíonn teicneolaíocht Nanopore agus PacBio anailísí bithfhaisnéise iartheachtach, go háirithe tionól meitigéinóm, rud a chinntíonn tionóil níos leanúnaí. Léiríonn tuarascálacha gur ghin meitigéinómaíocht bunaithe ar Nanopore agus PacBio géanóim bhaictéaracha iomlána agus dúnta ó mhicribhithóim chasta (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Soláthraíonn comhtháthú léamhanna Nanopore le léamhanna Illumina cur chuige straitéiseach maidir le ceartú earráide, rud a mhaolaíonn cruinneas íseal Nanopore. Baineann an teaglaim sineirgisteach seo leas as láidreachtaí gach ardáin seicheamhaithe, ag tairiscint réiteach láidir chun teorainneacha féideartha a shárú agus cruinneas agus iontaofacht anailísí meitigéinómacha a fheabhsú.
Ardán: Nanopore PromethION 48, Illumia agus PacBio Revio
-
Seicheamhú Aimplicon 16S/18S/ITS-PacBio
Feidhmíonn na géinte rRNA 16S agus 18S, mar aon leis an réigiún Spásaire Tras-scríofa Inmheánach (ITS), mar mharcóirí méarloirg mhóilíneacha lárnacha mar gheall ar a meascán de réigiúin an-chaomhnaithe agus hipear-athraitheach, rud a fhágann gur uirlisí luachmhara iad chun orgánaigh phrócarótacha agus eocarótacha a thréithriú. Cuireann aimpliú agus seicheamhú na réigiún seo cur chuige gan aonrú ar fáil chun comhdhéanamh agus éagsúlacht mhiocróbach a imscrúdú ar fud éiceachórais éagsúla. Cé go ndíríonn seicheamhú Illumina de ghnáth ar réigiúin ghearra hipear-athraitheach cosúil le V3-V4 de 16S agus ITS1, tá sé léirithe gur féidir anótáil tacsanomaíoch níos fearr a bhaint amach trí fhad iomlán 16S, 18S, agus ITS a sheicheamhú. Mar thoradh ar an gcur chuige cuimsitheach seo, bíonn céatadáin níos airde de sheichimh aicmithe go cruinn, rud a bhaintear amach leibhéal réitigh a shíneann go dtí sainaithint speiceas. Seasann ardán seicheamhaithe Aon-Mhóilín Fíor-Ama (SMRT) PacBio amach trí léamha fada an-chruinne (HiFi) a sholáthar a chlúdaíonn na haimplicóin lánfhaid, ag dul in iomaíocht le cruinneas seicheamhú Illumina. Leis an gcumas seo, is féidir le taighdeoirí buntáiste gan sárú a bhaint amach — radharc lánléargais ar an tírdhreach géiniteach. Méadaíonn an clúdach leathnaithe an taifeach i ndéanamh anótála speiceas go suntasach, go háirithe laistigh de phobail bhaictéaracha nó fungasacha, rud a chuireann ar chumas tuiscint níos doimhne a fháil ar chastacht dhaonraí miocróbach.
-
Seicheamhú Aimplicon 16S/18S/ITS-NGS
Is modh cumhachtach é seicheamhú aimplicon le teicneolaíocht Illumina, ag díriú go sonrach ar na marcóirí géiniteacha 16S, 18S, agus ITS, chun an fhíligineacht, an tacsanomaíocht, agus líonmhaireacht na speiceas laistigh de phobail mhiocróbacha a nochtadh. Baineann an cur chuige seo le réigiúin hipearathraitheacha marcóirí géiniteacha tí a sheicheamhú. Tugadh isteach é ar dtús mar mhéarlorg móilíneach agWoeses et al.Sa bhliain 1977, rinne an teicníc seo réabhlóidiú ar phróifíliú na miocróibíoma trí anailísí gan aonrú a chumasú. Trí sheicheamhú 16S (baictéir), 18S (fungais), agus Spásaire Tras-scríofa Inmheánach (ITS, fungais), is féidir le taighdeoirí ní hamháin speicis flúirseacha ach cinn neamhchoitianta agus anaithnid a aithint freisin. Glactar go forleathan mar uirlis lárnach, agus tá seicheamhú aimplicon ina uirlis ríthábhachtach chun comhdhéanamh miocróbach difreálach a aithint i dtimpeallachtaí éagsúla, lena n-áirítear béal an duine, na n-inní, an stól, agus níos faide anonn.
-
Ath-sheicheamhú Géanóim Iomláin Baictéarach agus Fungasach
Tá tionscadail athsheicheamhú lán-ghéanóim baictéarach agus fungasach ríthábhachtach chun géanóm miocróbach a chur chun cinn trí chomhlánú agus comparáid ghéanóm miocróbach a chumasú. Éascaíonn sé seo innealtóireacht choipeadh, optamú próiseas tionsclaíoch, agus iniúchadh conairí meitibileachta tánaisteacha. Ina theannta sin, tá athsheicheamhú fungasach agus baictéarach ríthábhachtach chun oiriúnú comhshaoil a thuiscint, cineálacha a optamú, agus dinimic éabhlóid ghéiniteach a nochtadh, agus impleachtaí leathana aige sa leigheas, sa talmhaíocht, agus san eolaíocht chomhshaoil.
-
Seicheamhú RNA Prócarótach
Cumasaíonn seicheamhú RNA próifíliú cuimsitheach a dhéanamh ar gach trascríbhinn RNA laistigh de chealla faoi choinníollacha sonracha. Feidhmíonn an teicneolaíocht cheannródaíoch seo mar uirlis chumhachtach, ag nochtadh próifílí casta géinléirithe, struchtúir géine, agus meicníochtaí móilíneacha a bhaineann le próisis bhitheolaíocha éagsúla. Glactar go forleathan leis i dtaighde bunúsach, i ndiagnóisic chliniciúil, agus i bhforbairt drugaí, agus cuireann seicheamhú RNA léargas ar fáil ar chastacht dinimic cheallacha agus rialáil ghéiniteach. Tá ár bpróiseáil samplach RNA procarótach saincheaptha do thrascríbhinní procarótacha, lena n-áirítear ídiú rRNA agus ullmhú leabharlainne treorach.
-
Seicheamhú Meiteatrascríptóim
Ag baint leasa as teicneolaíocht seicheamhaithe Illumina, nochtann seirbhís seicheamhaithe meiteathranscriptóim BMKGENE léiriú géine dinimiciúil réimse éagsúil miocrób, ó eocaróit go prócaróit agus víris, laistigh de thimpeallachtaí nádúrtha amhail ithir, uisce, farraige, stól, agus an gut. Cuireann ár seirbhís chuimsitheach ar chumas taighdeoirí tumadh isteach i bpróifílí iomlána léirithe géine phobail mhiocróbacha casta. Thar anailís tacsanomaíoch, éascaíonn ár seirbhís seicheamhaithe meiteathranscriptóim iniúchadh ar shaibhriú feidhmiúil, ag soilsiú géinte a léirítear go difriúil agus a róil. Nocht réimse léargas bitheolaíoch agus tú ag nascleanúint trí thírdhreacha casta léiriú géine, éagsúlachta tacsanomaíche, agus dinimic fheidhmiúla laistigh de na nideoga comhshaoil éagsúla seo.
-
Nua Tionól Géanóim Fungal
Cuireann BMKGENE réitigh ildánacha ar fáil do ghéanóim fungasacha, ag freastal ar riachtanais taighde éagsúla agus ar iomláine an ghéanóim atá ag teastáil. Trí úsáid a bhaint as seicheamhú gearrléamh Illumina amháin, is féidir dréacht-ghéanóm a ghiniúint. Cuirtear léamha gearra agus seicheamhú fadaléamh ag baint úsáide as Nanopore nó Pacbio le chéile le haghaidh géanóm fungasach níos scagtha le contigs níos faide. Ina theannta sin, feabhsaíonn comhtháthú seicheamhú Hi-C na cumais tuilleadh, rud a chuireann ar chumas géanóm iomlán ar leibhéal crómasóim a bhaint amach.
-
An Tionól Géanóim Baictéarach nua
Cuirimid seirbhís iomlán tionóil géanóm baictéarach ar fáil, ag ráthú nach bhfuil aon bhearna ann. Is féidir é seo a dhéanamh trí theicneolaíochtaí seicheamhaithe léite fada, amhail Nanopore agus PacBio le haghaidh tionóil agus seicheamhaithe léite gearr a chomhtháthú le Illumina le haghaidh bailíochtú tionóil agus ceartú earráide ar léamha ONT. Soláthraíonn ár seirbhís an sreabhadh oibre bithfhaisnéise iomlán ó thionól, anótáil fheidhmiúil, agus anailís bhithfhaisnéise chun cinn, ag comhlíonadh spriocanna taighde sonracha. Cuireann an tseirbhís seo ar chumas forbairt géanóm tagartha beachta le haghaidh staidéir ghéiniteacha agus ghéanómacha éagsúla. Ina theannta sin, is í an bunús í d’fheidhmchláir amhail uasmhéadú brú, innealtóireacht ghéiniteach, agus forbairt teicneolaíochta miocróbach, ag cinntiú sonraí geanómacha iontaofa agus saor ó bhearnaí atá ríthábhachtach chun léargais eolaíocha agus nuálaíocht bhiththeicneolaíoch a chur chun cinn.
