lncRNS
A hosszú, nem kódoló RNS-ek (lncRNS) 200 nukleotidnál hosszabb, alacsony kódolási potenciállal rendelkező, de kritikus szabályozó funkciókkal rendelkező RNS-ek. A BMKCloud lncRNS-folyamatot arra tervezték, hogy elemezze az rRNS-től megtisztított könyvtárakat egy kiváló minőségű, jól annotált referencia genommal, az lncRNS és az mRNS expressziójának együttes elemzésével. Az olvasási vágás és minőségellenőrzés után az olvasási eredményeket a referencia genomhoz igazítják a transzkriptumok összeállítása érdekében, és az ezt követő génszerkezet-elemzés alternatív splicingot és új géneket tár fel. A transzkriptumokat mRNS-ként vagy lncRNS-ként azonosítják, és a differenciális expressziós analízis azonosítja a differenciálisan expresszált lncRNS-eket, azok célpontjait és a differenciálisan expresszált géneket (DEGS). Mind a DEG-eket, mind a differenciálisan expresszált lncRNS-célpontokat funkcionálisan annotálják a gazdagított funkcionális kategóriák megtalálása érdekében.
Bioinformatika