BMKCloud кирүү

Продукциялар

Эукариоттук мРНК секвенирлөө-NGS

Эукариоттук мРНКнын секвенирлөөсү-NGS Сунушталган сүрөт

мРНК секвенирлөөсү – бул биологиялык үлгүдөгү РНК молекулаларынын бар экендигин жана санын аныктоо үчүн кийинки муундагы секвенирлөөнү колдонгон ыкма, бул үлгүдөгү ген экспрессиясынын сүрөтүн берет.

Кеңири колдонулушу менен, бул заманбап курал ар кандай биологиялык процесстер менен байланышкан татаал ген экспрессиясынын профилдерин, ген структураларын жана молекулярдык механизмдерди ачып берет.

Бул ыкма изилдөөлөрдө, клиникалык диагностикада жана дары-дармектерди иштеп чыгууда кеңири колдонулат, анткени ал клеткалык динамика менен генетикалык жөнгө салуунун татаалдыктарын түшүнүүгө мүмкүндүк берет жана анын ар кандай тармактардагы потенциалы жөнүндө кызыгууну ойготуу үчүн бекем негиз түзөт.

Жеткиликтүү платформалар: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

Биз менен байланышыңыз

Кызматтын чоо-жайы

Биоинформатика

Демо натыйжалары

Сунушталган басылмалар

Өзгөчөлүктөрү

● Тизекке мүнөздүү секвенирлөө маалыматтарын алууга мүмкүндүк берүүчү кошумча багыттагы мРНК китепканасын даярдоо

● Ар кандай бизнес-анализдер кардарларыбыздын бардык муктаждыктарын канааттандырат

Артыкчылыктары

●Кеңири экспертизаБиз клетка культуралары, ткандар жана дене суюктуктары сыяктуу ар кандай үлгүлөрдү камтыган 600 000ден ашык үлгүлөрдү иштеттик. Биз ар бир долбоорго тажрыйбанын байлыгын алып келебиз.

●Катуу сапатты көзөмөлдөөБиз үлгү даярдоодон баштап, китепканага даярдоого, ырааттуулукту аныктоого жана биоинформатикага чейинки бардык этаптарда негизги көзөмөл пункттарын ишке ашырабыз. Биздин кылдат мониторингибиз дайыма жогорку сапаттагы натыйжаларды алууну камсыз кылат.

●Толук аннотацияБиз дифференциалдык экспрессияланган гендерди (ДЭГ) функционалдык жактан аннотациялоо жана тиешелүү байытуу анализдерин жүргүзүү үчүн бир нече маалымат базаларын колдонобуз. Бул комплекстүү ыкма транскриптомдук жооптун негизинде жаткан клеткалык жана молекулярдык процесстерди түшүнүүгө мүмкүндүк берет, бул сиздин экспериментиңиздин маалыматтары жөнүндө мүмкүн болгон бардык маалыматты алууну камсыздайт.

●Сатуудан кийинки колдооБиз катышуунун канчалык маанилүү экенин түшүнөбүз, ошондуктан биздин милдеттенмебиз долбоорду аяктоодон тышкары, 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтүн камтыйт. Бул убакыттын ичинде биз долбоорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү чечүүгө жардам берүү жана жыйынтыктарга байланыштуу ар кандай суроолорго жооп берүү үчүн суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.

Үлгү талаптары жана жеткирүү

Китепкана

Ырааттуулук стратегиясы

Сунушталган маалыматтар

Сапатты көзөмөлдөө

Поли А менен байытылган

Иллюминат PE150

DNBSEQ-T7

6 -10 Гб

Q30≥85%

Үлгү талаптары:

Нуклеотиддер:

Минималдуу үлгү талаптары:

Конц. (нг/мкл)

Суммасы (мкг)

Тазалык

Бүтүндүк

Стандарттык китепкана

≥ 10

≥ 0.2

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Гелде белоктун же ДНКнын булганышы чектелген же такыр жок экени көрсөтүлгөн.

Өсүмдүктөр үчүн: RIN≥4.0;

Жаныбарлар үчүн: RIN≥4.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

базалык бийиктиги чектелген же такыр жок

Багыттоочу китепкана

≥ 10

≥ 0.2

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Гелде белоктун же ДНКнын булганышы чектелген же такыр жок экени көрсөтүлгөн.

Өсүмдүктөр үчүн: RIN≥4.0;

Жаныбарлар үчүн: RIN≥4.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

базалык бийиктиги чектелген же такыр жок

Өсүмдүктөр

Жаныбар

Муун буттуулар

Бүтүн кан

Клеткалар

Тамыр, сабак же желекче: 450 мг

Жалбырак же урук: 300 мг

Мөмө-жемиш: 1,2 г

Жүрөк же ичеги: 300 мг

Ички органдар же мээ: 240 мг

Булчуң: 450 мг

Сөөктөр, чач же тери: 1 г

Курт-кумурскалар: 6 г

Рак сымалдары: 300 мг

1 түтүк

106 клетка

Сунушталган үлгү жеткирүү

Контейнер: 2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)

Үлгү белгилөө: Топ+көчүрмө, мисалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...

Жөнөтүү:

1. Кургак муз: Үлгүлөрдү баштыктарга салып, кургак музга көмүү керек.

2. РНК стол түтүкчөлөрү: РНК үлгүлөрүн РНКны стабилдештирүүчү түтүкчөдө (мисалы, RNAstable®) кургатып, бөлмө температурасында жеткирүүгө болот.

Үлгү талаптары жана жеткирүү

Эксперименттик дизайн

Үлгү жеткирүү

РНКны бөлүп алуу

Китепкана куруу

Ырааттуулук

Маалыматтарды талдоо

Сатуудан кийинки кызматтар

Мурунку: Шилтемеге негизделбеген мРНК секвенирлөөсү-NGS

Кийинки: Толук метраждуу мРНК секвенирлөө -PacBio

Биоинформатика

Жеткиликтүү шилтеме геному бар үлгүлөр үчүн BI анализи төмөнкүдөй:

ØЧийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө

ØШилтеме геномунун тегизделиши

ØТранскрипттин түзүмүн талдоо

ØТуюнтманы сандык жактан аныктоо

ØДифференциалдык экспрессияны талдоо

ØФункцияны аннотациялоо жана байытуу

Шилтеме геному жок үлгүлөр үчүн бул вариант жеткиликтүү:

• Чийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө

•Структураны оптималдаштыруу менен чогултуу

•Дифференциалдык экспрессияны талдоо

•Функцияны аннотациялоо жана байытуу

Геномдун шилтеме түзүмү

Маалыматтардын каныккандыгы

Үлгү корреляциясы жана биологиялык кайталоолорду баалоо

Дифференциалдык экспрессияланган гендер (ДЭГ)

DEGлердин функционалдык аннотациясы

ДЭГлердин функционалдык жактан байытылышы

BMKGene компаниясынын эукариоттук NGS mRNA секвенирлөө кызматтары аркылуу жетишилген жетишкендиктерди тандалган басылмалар жыйнагы аркылуу изилдеңиз.

Хуан, Л. жана башкалар (2023) 'Триклозан жана триклокарбан жытты таанууну чектөө, жыт сигналынын берилишин бузуу жана жыт маалыматын иштетүүнү бузуу менен алтын балыктардын жыт сезүү жөндөмүн алсыратат',Суу изилдөө, 233, б. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.

Jia, LJ жана башкалар. (2023) 'Aspergillus fumigatus адамдын p11 клеткасын басып алып, козу карындарды камтыган фагосомаларды деградацияланбаган жолго багыттайт',Клетка ээси жана микроб, 31(3), 373-388.e10-бб. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.

Jin, K. жана башкалар (2022) 'Ма бамбукунун (Dendrocalamus latiflorus Munro) бүчүрүнүн өнүгүшүнө катышкан TCP транскрипция факторлору',Өсүмдүк таануудагы чек аралар, 13, б. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.

Wen, X. жана башкалар. (2022) 'Chrysanthemum lavandulifolium геному жана ар түрдүү капитулум түрлөрүнүн негизиндеги молекулярдык механизм',Бакчачылыкты изилдөө, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.

Чжан, Юцзе жана башкалар (2023) 'Синергиялык ROS күчөтүү жана аутофагияны бөгөттөө аркылуу жоон ичеги рагында сонодинамикалык терапияны күчөтүү үчүн каскаддык нанореактор',Нано бүгүн, 49, стр. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.