page_head_bg

Продукциялар

Эукариоттук мРНК секвенирлөө-Илюмина

mRNA секвенциясы белгилүү шарттарда клеткалардан транскрипцияланган бардык мРНКлардын профилин түзүүгө мүмкүндүк берет.Бул ген экспрессия профилин, ген структураларын жана кээ бир биологиялык процесстердин молекулярдык механизмдерин ачуу үчүн күчтүү технология.Бүгүнкү күнгө чейин мРНК секвенциясы фундаменталдык изилдөөдө, клиникалык диагностикада, дарыларды иштеп чыгууда ж.б. кеңири колдонулуп келет.

Платформа: Illumina NovaSeq 6000


Кызматтын чоо-жайы

Биоинформатика

Демо натыйжалары

Артыкчылыктары

ØЖогорку тажрыйбалуу: BMKде 200 000ден ашуун үлгүлөр ар кандай үлгүлөрдүн түрлөрүн камтыган, анын ичинде клетка маданияты, ткань, дене суюктугу ж.б. жана 7 000ден ашуун mRNA-Seq долбоорлору ар кандай изилдөө аймагын камтыган иштетилди.

ØКатуу сапатты көзөмөлдөө системасы: үлгү даярдоо, китепкана даярдоо, секвенирлөө жана биоинформатика, анын ичинде бардык кадамдар аркылуу негизги сапатты көзөмөлдөө пункттары жогорку сапаттагы натыйжаларды берүү үчүн тыгыз мониторинг астында турат.

ØАр кандай изилдөө максаттарын аткаруу үчүн функция аннотациялары жана байытуу изилдөөлөрү үчүн бир нече маалымат базалары бар.

ØСатуудан кийинки кызматтар: Долбоор аяктагандан кийин 3 айга жарактуу сатуудан кийинки кызматтар, анын ичинде долбоорлорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү чечүү, суроолор жана жооптор ж.б.

Үлгү талаптары жана жеткирүү

Китепкана Секвенирлөө стратегиясы Берилиштер сунушталат Сапатты көзөмөлдөө
Poly A байытылган Illumina PE150

6 Гб

Q30≥85%

Үлгү талаптары:

Нуклеотиддер:

Тазалык бүтүндүк Суммасы
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Чектелген же жок белок же ДНК булганышы гелде көрсөтүлгөн. Өсүмдүктөр үчүн: RIN≥6,5;Жаныбарлар үчүн: RIN≥7;28S/18S≥1,0;базалык бийиктиги чектелген же жок Конц.≥30 нг/мкл;Көлөмү ≥ 10 мкл;Жалпысынан ≥ 1,5 мкг

Кыртыш: Салмагы (кургак):≥1 г
*5 мг аз кыртыш үчүн, биз жарк-тоңдурулган (суюк азотто) кыртыш үлгүсүн жөнөтүүнү сунуштайбыз.

Клетка суспензиясы:Клеткалардын саны = 3×106- 1×107
*Биз тоңдурулган клетка лизатын жөнөтүүнү сунуштайбыз.Эгерде клетканын саны 5×105тен аз болсо, суюк азотто тоңдурулган флеш сунушталат, бул микро экстракция үчүн жакшыраак.

Кан үлгүлөрү:Көлөмү≥1 мл

Микроорганизм:Массасы ≥ 1 г

Сунушталган үлгү жеткирүү

Контейнер: 2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)

Үлгү энбелгиси: Топ+репликация, мисалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Жөнөтүү:

  1. Кургак муз: Үлгүлөрдү баштыктарга салып, кургак музга көмүү керек.
  2. RNAstable түтүктөр: РНК үлгүлөрүн РНКны турукташтыруучу түтүктө (мисалы, RNAstable®) кургатып, бөлмө температурасында жөнөтүүгө болот.

Кызматтын иш агымы

logo_01

Эксперимент дизайны

logo_02

Үлгү жеткирүү

logo_03

РНК экстракциясы

logo_04

Китепкананын курулушу

logo_05

Секвенциялоо

logo_06

Маалыматтарды талдоо

logo_07

Сатуудан кийинки кызматтар


  • Мурунку:
  • Кийинки:

  • Биоинформатика

    2(1)

    Эукариот mRNA секвенирлөө талдоо иш процесси

    Биоинформатика

    ØЧийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө

    ØМаалымдама геномунун тегиздөө

    ØТранскрипт структурасын талдоо

    ØЭкспрессиянын квантификациясы

    ØДифференциалдык экспрессияны талдоо

    ØФункцияга аннотация жана байытуу

    1.mRNA Маалыматтын каныккан ийри сызыгы

    3(1)

    2.Дифференциалдык туюнтма анализи-Вулкан сюжети

    4(1)

    3.DEGs боюнча KEGG аннотациясы

    5(1)

    4.DEG боюнча GO классификациясы

    6(1)

    цитата алуу

    Бул жерге билдирүүңүздү жазып, бизге жөнөтүңүз

    Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: