Кыскартылган бисулфите ырааттуулугу (RRBS)
ДНКнын метайликасын изилдөөдө бир аз жылдык бисульфитанын катышуусун кыскарткан бисульфитанын кыскартылышы (RRBS), ДНКнын метайликасы изилдөө чөйрөсүндө бүтүмдүк бисульфите статистикалык ырааттуулугу (WGBS) катары пайда болду. WGBS толугу менен геномду бир базалык резолюцияны карап, толук түшүнүктөрдү камсыз кылат, анын жогорку баасы чектелүү фактор болушу мүмкүн. RRBS стратегиялык жактан бул чакырыкты геномдун өкүлдөрүнүн өкүлүн тандап алуу менен тандап алуу менен бул чакырыкты азайтат. Бул методология CPG-Айленд-бай аймактарды байытууга таянат. Демек, региондорго CGG-Айленддерине проксималдык гана катышып, алыскы CGPG аралдары барлар талдоодон четтетилет. Бул процесстин ырааттуулугу менен биргеликте ДНКнын металлациясын жана ырааттуулуктун, PE150, өзүнчө мамилени, ар кандай максаттардын четине, ортоңку эмес, метиляциялык профилинин натыйжалуулугун жогорулатуу үчүн, ар тараптын четине багытталган. RRBS - бул эң баалуу ДНКнын метиляциялык изилдөөлөрүн изилдөөгө мүмкүндүк берген баа жеткис курал болуп саналат жана эпигенетикалык механизмдерди билүүгө мүмкүнчүлүк берет.
Кызмат өзгөчөлүктөрү
● шилтеме геномун талап кылат.
● Ламбда ДНК бисульфитинин конверсиясынын натыйжалуулугун көзөмөлдөө үчүн колдонулат.
● MSPI сиңирүү натыйжалуулугу да байкалат.
● Өсүмдүк үлгүлөрүнүн коштошуу үчүн кош энзим сиңгилиги.
● Иллюмина Новаска боюнча ырааттуулук.
Кызматтын артыкчылыктары
●Маанилүүлүгүнүн экономикалык жана натыйжалуу альтернативасы: анализди төмөндөтөт
●Толук платформа:Үлгүдө, китепкананы куруу, китепкананы түзүү жана биоинформатика талдоосуна ырааттуулугун текшерүү үчүн мыкты кызмат көрсөтүңүз.
●Кеңири экспертизаТөмөнкү түрдөгү ар түрдүү түрлөрү боюнча ийгиликтүү аяктагандыгы менен, Бменджендин он декадасын, жогорку тажрыйбалуу талдоо командасын, ар тараптуу мазмунун, жана сатуунун мыкты колдоосунан өтөт.
Кызмат мүнөздөмөлөрү
| Китепкана | Сезүү стратегия | Сунуш кылынган маалыматтардын чыгышы | Сапатты көзөмөлдөө |
| MSPI сиңирилген жана бисулфитка дарыланган китепкана | Illumina pe150 | 8 ГБ | Q30 ≥ 85% Бисулфите айландыруу> 99% MSPI натыйжалуулугу> 95% |
Үлгү талаптары
| Концентрация (ng / μl) | Жалпы суммасы (GG) |
| |
| Genomic DNA | ≥ 30 | ≥ 1 | Чектелген деградация же булгануу |
Кызматтын агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
Төмөнкү анализди камтыйт:
● Сапаттын сапатын контролдоо;
● Маалымдама геномун картасы;
● 5MC метилдүү негиздерин жана мотивди идентификациялоо;
● метиляцияны бөлүштүрүү жана үлгүлүү салыштыруу;
● дифференциалдык метиляциялык аймактарды талдоо (DMRS);
Dmrs үчүн байланышкан гендердин функционалдык аннотациясы.
Сапатты контролдоо: сиңирүү натыйжалуулугу (Генома картага)
Сапатты контролдоо: Бисульфите конверсиясы (металлация жөнүндө маалымат алууда)
Метилят картасы: 5mc металлациялык геном-кенен бөлүштүрүү
Салыштыруу: Негизги компонент анализи
Дифференциалдык метилтацияланган аймактар (DMRS) Талдоо: HeatMap
БМКЖИНИНИН БИСЭЦулфитинин коштоосунун пленкалык кызмат көрсөтүүлөрү менен байланышкан изилдөө жүргүзүлүүчү илимдердин илгичтерди изилдөө.
Ли, З. и Ал. (2022) "Чоң кычыштырган клеткаларга окшогон лейдигге окшогон клеткаларга,Pnas Nexus, 1 (4). Дой: 10.1093 / Пнаксекус / PGAC179.
Тянь, Х. et al. (2023) "" Геном "Генома-Ун ДНКнын дене курамын кытай монозиготикалык эгиздердеги,Европалык иликтөө журналы, 53 (11), б. E14055. DOI: 10.1111 / eci.14055.
Ву, Ю. (2022) 'ДНК метиляциясы жана белинин хип-коэффициенти: кытай мнозиготикалык эгиздердеги эпигенофиялуу изилдөө ",Эндокриногринологиялык иликтөө журналы, 45 (12), 2365-2376-бб. DOI: 10.1007 / S40618-022-01878-4.
