●Микробдук коомчулуктун профилин изоляциялоо жана өстүрүүчү ыкма: Генетикалык материалды генетикалык материалды чебер организмдерден өткөрүп берүү.
●Жогорку чечим: Айлана-чөйрөнүн үлгүлөрүндө аз молчулук түрлөрүн аныктоо.
●Биоинформатика талдоосу:Таксономикалык ар түрдүүлүккө гана эмес, коомчулуктун функционалдык ар түрдүүлүгүнө да көңүл бурган.
●Чоң тажрыйба:Ар кандай изилдөө чөйрөсүндө бир нече метагеномика долбоорлорун ийгиликтүү жабуу жана 200,000 үлгүлөрдү кайра иштетүү, биздин команда ар бир долбоорго бир топ тажрыйбаны алып келет.
Секент платформасы | Сезүү стратегия | Берилген маалыматтар | Сапатты көзөмөлдөө |
Иллюмина Новасек же DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20ГБ | Q30≥85% |
Концентрация (ng / μl) | Жалпы суммасы (ng) | Көлөмү (μl) |
≥1 | ≥30 | ≥20 |
● Топурак / Шлайт: 2-3г
● Ичеги-карын мазмуну: 0.5-2G
● Ичеги-карын мазмунунт: үтүктүрүү: 0.1-0,25г
● Өсүмдүктүн бети (байытылган чөкмө): 0.5-1G
● Ачуу чөкмө чөкмөлөрү: 0.2-0.5g
● Faechs (Чоң жаныбарлар): 0.5-2G
● Faech (чычкан): 3-5graine
● Өпкө алвеолярдык суюктук суюктук: Фильтр кагаз
● кындын SPAB: 5-6
● Терини / жыныс / шилекей / оозеки жумшак ткандардын / фаринжеал SPAB / Rectal SPAB: 2-3
● Микроорганизм: 5-6
● суу / аба / biofilm: фильтр кагаз
● Эндофитес: 2-3г
● Тиш планы: 0.5-1g
Төмөнкү анализди камтыйт:
● Маалыматтын сапатын контролдоо
● Метагеномия жана ген менен божомол
● ген аннотация
● Таксомиялык альфа
● Коомчулуктун функционалдык анализи: биологиялык функция, метаболикалык, антибиотиктерге каршылык
● Функционалдык жана таксономикалык көп түрдүүлүктү тең:
BETAнын ар түрдүүлүгүн анализдөө
Топтардык анализ
Корреляциялык анализ: Экологиялык факторлордун ортосунда жана курамы менен ар түрдүүлүгү ортосунда
Функционалдык анализ: Картанын антибиотикти туруктуулугу
Кегг метаболикалык жолдорун дифференциалдуу талдоо: Маанилүү жолдордун жылуулугу
Таксономикалык бөлүштүрүүнүн альфа ар түрдүүлүгү: Ace Index
БЕТА Таксономикалык бөлүштүрүү: PCOA
БМКЖЕНДИН МЕГЕНТИНИН СИЗИНГИНИН ИЛИМИНАСЫ ЖОЛУГУШУУЧУЛАРЫНЫН МЕГЕНЦИЯСЫ ЖӨНҮНДӨ ЖОЛУГУШУУ ПАЙДАЛАНУУЧУЛАРЫ ПАЙДАЛАНУУЧУ ПАЙДАЛАНУУЧУЛАРЫ аркылуу.
Хай, Q. et al. (2023) "Астобод форелинин металеномикалык жана метаболикалык талдоосу (oncorhynchus mykiss) ар кандай маданият суунун температурасында инфекциялык некроз вирусуна жуккан",Микробиологиядагы чек аралар, 14, б. 1275649. DOI: 10.3389 / FMM.2023.12.56649.
Мао, С. жана Ал. (2023) "Микробдук жамааттар, каршылык көрсөтүү гендери, ар кандай трофикалык мамлекеттердин шаарларындагы калыс тобокелдиктер: ички байланыштар жана тышкы таасирлер",Кооптуу материалдар журналы, 9, б. 100233. DOI: 10.1016 / J.Hazadv.2023.100233.
Су, М. жана Ал. (2022) 'Метрономикалык анализ, суюк-байланышкан жана койлордун суюктук менен байланышкан жана катуу байланышкан микроорганизмдеринин ортосундагы айырмачылыктарды жана функцияларындагы айырмачылыктарды аныктаган,Микробиологиядагы чек аралар, 13, б. 851567. DOI: 10.3389 / FMM.2022.851567.
Инь, Дж. Et al. (2023) 'Семиздик эмесИнновация4 (5), б. 100486. DOI: 10.1016 / J.XINN.2023.100486.
Жао, X. ж.б. (2023) "Хай эй-дивариумдун жогорку жана төмөнкү жетекчисиндеги потенциалдуу тобокелдиктеринин метагеномикалык түшүнүктөрү,Жалпы чөйрөнүн илими, 887, б. 164026. DOI: 10.1016 / j.scetenv.2023.164026.