Ампликондук ырааттуулук (16S/18S/ITS)

Illumina менен Amplicon (16S/18S/ITS) ырааттуулугун аныктоо - бул микробдук профилдерди алардын ырааттуулугуна жараша аныктоо жана андан кийин ар бир үлгүнүн ичиндеги жана үлгүлөрдүн ортосундагы жамааттын байлыгын жана ар түрдүүлүгүн чечмелөөгө аракет кылуу аркылуу микробдук ар түрдүүлүктү талдоо ыкмасы. BMKCloud Amplicon (NGS) түтүгү 16S, 18S, ITS жана бир нече функционалдык гендерди талдоо мүмкүнчүлүгүн берет. Ал окууну кыскартуу, жупташкан окууну чогултуу жана сапатты баалоо менен башталат, андан кийин алты ар кандай анализ бөлүмүндө колдонулган Операциялык Таксономик Бирдиктерди (OTU) түзүү үчүн окшош окууларды кластерлөө менен жүргүзүлөт. Таксономик аннотация ар бир үлгүнүн салыштырмалуу көптүгү жана курамы жөнүндө маалымат берет, ал эми альфа жана бета ар түрдүүлүктү талдоо тиешелүүлүгүнө жараша үлгүлөрдүн ичиндеги жана ортосундагы микробдук ар түрдүүлүккө багытталат. Топтор ортосундагы дифференциалдык талдоо параметрдик жана параметрдик эмес тесттерди колдонуу менен айырмаланган OTUларды табат, ал эми корреляциялык талдоо бул айырмачылыктарды экологиялык факторлор менен байланыштырат. Акырында, функционалдык гендин көптүгү маркердик гендин көптүгүнө негизделип болжолдонот, бул ар бир үлгүдөгү функция жана экология жөнүндө түшүнүк берет.