Эукариоттук мРНК анализи (Шилтеменин негизиндеги жана жаңы варианттар бар)
Бул түтүк NGS RNA-Seq маалыматтарын киргизүү катары колдонот жана бир нече ылдый анализдердин натыйжаларын чыгарат, анын ичинде, бирок алар менен чектелбестен: маалыматтардын сапатын баалоо ырааттуулугу,de novoтранскрипция сайтынын аннотациясы, өзгөрмөлүү сплайсинг анализи, дифференциалдык экспрессия анализи, функция аннотациясы жана байытуу анализи.
Узак эмес коддолгон РНК анализи
Узун коддолбогон РНКлар (lncRNA) узундугу 200 нттен ашкан жана хроматинди уюштурууда жана жөнгө салууда роль ойной турган коддолбогон транскрипттер. Жогорку өтүмдүү секвенирлөө технологиялары жана биоинформатика биздин lncRNA ырааттуулугун жана позициялоо маалыматын түшүнүүгө жардам берип, маанилүү жөнгө салуучу функциялары бар lncRNAларды аныктоого жардам берди. Бул түтүк эукариоттук mRNA талдоо түтүкчөсүндө айтылган анализдерге кошумча lncRNA анализин берет.
16S/18S/ITS ампликонун секвенирлөө
Amplicon Sequecing микробдук ар түрдүүлүктү талдоо түтүгү микробдук ар түрдүүлүк долбоорун талдоодогу көп жылдык тажрыйбанын негизинде иштелип чыккан. Түтүк стандартташтырылган негизги анализди камтыйт, ал учурдагы микробдук изилдөөлөрдүн негизги анализинин мазмунун жана жекелештирилген анализди камтыйт. Талдоо отчету ар түрдүү жеке талдоо жүргүзүү мүмкүнчүлүгү менен бай жана ар тараптуу. Кошумчалай кетсек, үлгүлөрдү жана топторду кошумча ыңгайлаштыруу жана көзөмөлдөө үчүн тез арада өзгөртсө болот.
Shotgun Metagenomics Analysis
Shotgun Metagenomic Analysis түтүгү экологиялык үлгүлөрдөн алынган аралаш геномдук материалдардан NGS маалыматтарын колдонот. Камтылган анализдер түрлөрдүн көп түрдүүлүгү жана көптүгү, популяциянын түзүлүшү, филогенетикалык байланыштары, функционалдык гендер жана экологиялык факторлор менен корреляция тармактары жөнүндө толук маалымат берет.
NGS-WGS Variant Analysis
NGS-WGS Variant Analysis интегралдык вариантты аныктоо конвейери болуп саналат, ал маалыматтардын сапатын контролдоону, ырааттуулукту тегиздөөнү, аннотацияны жана ген мутациясын талдоону жүзөгө ашырат. Түтүк SNP жана InDel аныктоо боюнча GATK мыкты тажрыйбаларына ылайык келет жана структуралык варианттарды чакыруу үчүн Manta колдонот.
Геномдун кеңири ассоциациясынын изилдөөсү (GWAS)
GWAS конвейери - бул мурда түзүлгөн VCF файлдарын жана жеке адамдардын когорты үчүн тиешелүү фенотип маалыматтарын киргизүү катары кабыл алган ылдыйкы талдоо. Атайын статистикалык методологияларды колдонуу менен, GWAS фенотиптик айырмачылыктар менен байланышкан геномдук нуклеотиддердин вариацияларын ачууга багытталган. Ал адамдын татаал оорулары жана өсүмдүктөр менен жаныбарлардын татаал белгилери менен байланышкан функционалдык гендерди изилдөөдө чечүүчү ролду ойнойт.
Жапырт бөлүү анализи (BSA)
BSA талдоо өзгөчө фенотиптик өзгөчөлүктөргө ээ адамдарды бөлүп турган популяциядан бириктирүүнү камтыйт. Топтолгон үлгүлөрдүн ортосундагы дифференциалдык локустарды салыштыруу менен, бул ыкма максаттуу гендер менен байланышкан тыгыз байланышкан молекулярдык маркерлерди тез аныктайт. Өсүмдүктөрдүн жана жаныбарлардын генетикалык картасын түзүүдө кеңири колдонулуп, маркердик селекциянын баалуу куралы болуп саналат.
Эволюциялык генетикалык анализ
Эволюциялык генетикалык анализдин иш процесси BMKGENEнин генетикалык эволюция долбоорлорундагы кеңири тажрыйбасын колдонот жана филогенетикалык дарактарды курууну, байланыштын тең салмаксыздыгын анализдөөнү, генетикалык ар түрдүүлүктү баалоону, тандалма шыпырып аныктоону, туугандык талдоону, негизги компоненттердин анализин жана популяциянын структурасын мүнөздөйт.
