Ядронун обочолонуу 10 × гезитинин хром сегиз кесилиштүү микрофлуиддик тутумун эки эселенген кесилиштүү микрофлуиддик системасын түзөт. Бул системада шаңдуу жана праймер менен гель мончоктору, ферменттер жана бирдиктүү ферменттер жана бирдиктүү ядро гель мончок-имулсия (асыл таш). Гем түзүлгөндөн кийин, клетка лизиз жана ар бир асылкоддордо ар бир асыл таш кезинде жүргүзүлөт. MRNA CDNA молекулаларына 10 × шаркалык жана уми менен транзакцияланат, бул андан ары Стандарттык китепкананын курулушун курууга дуушар болгон.
● Тоңдурулган ткандардан бирден-бир ядро токтотууну даярдоо
Glel гель мончок-ин-эмульсиянын (асыл тукумдуу) пайда болгон CDNA синтези
● Гемдеги ар бир мончок 4 бөлүмдөн турган праймерлер менен жүктөлгөн:
МРНКны приминг жана CDNA синтези үчүн POLY (DT) куйругу,
Универсал-молекулалык идентификатор (Уми)
10x штрих-код
Жарым-жартылай жарым-жартылай окуган
Бир ядро РНК бир клетка РНКнын ырааттуулугун четтетүүнү, катышуу үчүн:
Frozen Тоңдурулган үлгүлөрдү колдонуу жана жаңы үлгүлөр менен гана чектелбейт
● Тоңдурулган клеткалардын стресстери, стресс-индукцияланган генинин түрүндө чагылдырылган жаңы клеткаларда чагылдырылган жаңы клеткалардын ферментматикалык дарылоосуна салыштырмалуу
Red кан клеткаларын алдын-ала кетирүүнүн кажети жок
● Чексиз клетка диаметри
● Талдоого татыктуу болгон ири үлгүлөр, анын ичинде ткандардын кесилишинде клетка бүртүкчөлөрүнө же жок кылынган татаал жана назик ткандардын түрлөрүн кошо алганда
Клетка / кыртыш | Себеби |
Unfresh тоңдурулган ткандардын | Жаңы же узак сакталган уюмдарды алуу мүмкүн болбой жатат |
Булчуң клеткасы, мегакариоцитте, май ... | Клетканын диаметри аспапка кирүү үчүн өтө чоң |
Боор ... | Бир клеткаларды айырмалай албай калуу үчүн өтө эле назик |
Нейрон клеткасы, мээ ... | Көбүрөөк сезимталдык, стресске оңой, Секвенингдин натыйжаларын өзгөртөт |
Pancreas, Theroid ... | Бир клетка токтотуу өндүрүшүнө таасир эткен эндогендүү ферменттерге бай |
Жалгыз ядро | Бир клетка |
Чексиз клетка диаметри | Клетка диаметри: 10-40 μm |
Материал тоңдурулган ткандарга болот | Материал жаңы ткандар болушу керек |
Тоңдурулган клеткалардын төмөн стресси | Ферменттин дарылоосу клетканын стресс реакциясына алып келиши мүмкүн |
Эритроцит клеткалары жок кылынышы керек | Эритроцит клеткалары алынып салынышы керек |
Ядролук биоинформаны билдирет | Бүтүндөй клетка биоинформаны билдирет |
Үлгү талаптары | Китепкана | Сезүү стратегия | Берилген маалыматтар | Сапатты көзөмөлдөө |
Animal Tissue ≥ 200 мг Өсүмдүктөр ткандары ≥ 400 мг | 10x Genomics Sn CDNA китепканасы | Illumina pe150 | 100k pe бир клетка үчүн окуйт (100-200 ГБ) | 700-1200 нуклеи / μl жана ядро микроскоп астында байкалган |
Үлгүлүү даярдоо боюнча жетекчилик жана тейлөө иштери боюнча көбүрөөк маалымат алуу үчүнBMKGENE EXPER
Төмөнкү анализди камтыйт:
● Сапатты контролдоо: Клеткалардын саны, Генди аныктоо, клеткаларды, РНК молекулалары жана сандык
● Ички үлгүлүү анализ:
Клетка кластери жана кластердик аннотация
Дифференциалдык сөз айкашы анализ: Кластердеги бузуктук
Компаниянын функционалдык аннотациясы жана кластердик диеглерди байытуу
● Тандоо аралык талдоо:
Маалыматтардын айкалышы
Дифференциалдык сөз айкашын талдоо: Топтордогу DEGSди аныктоо
Топтук Дегсинин функционалдык аннотациясы жана байытуу
● Өркүндөтүлгөн анализ:
Клетка циклинин анализи
Псевдотимим
Уюлдук байланыш анализи (уюлдук телефон)
Генди байытууну талдоо (GEEA)
Inner-Sample анализ
Уюлдук кластер:
Дифференциалдык туюнтма талдоо: Cluster Degs
Топтардык анализ
Дифференциалдык туюнтма талдоосу: Топтун бузулушу
Өркүндөтүлгөн анализ:
Псевдотимим
Клетка циклинин анализи:
БМКЖИНИНИН БҮГҮН БИЛДИРҮҮСҮ РНКнын карама-каршылыктуу кызматтары, ушул өзгөчөлөнгөн басылмалардагы 10x хром аркылуу
Ванг, Л. жана Аль. (2021) "Бир клетка транскриптомдук талдоо стероиддик жактан туруктуу астмада иммундук пейзажды ачып берет",Америка Кошмо Штаттарынын Улуттук Илимдер академиясынын иши, 118 (2), б. E2005590118. DOI: 10.1073 / PNAS.2005590118
Чжэн, H. ж.б. (2022) "Мүрзөлөрдүн оорусу жана Хашимото" Хашимото "Мээлерин жана Хашимото-тироидитинин мүрзөлөрүндөгү иммундук клеткаларга, глобалдык жөнгө салуучу графикалык жана анормалдуу затабулук үчүн дүйнөлүк жөнгө салуу тармагы,Иммунологиядагы чек аралар, 13, б. 879824. DOI: 10.3389 / Fimmu.2022.879824 / BIBTEX.
Тянь, Х. et al. (2023) "Бир клетка транскриптому Лейкоциттердин иммунитетинин иммундук жоопторун Флориндер (паралхтис оливасей)",AquaCulture, 566, б. 739238. DOI: 10.1016 / J.Aquacultulture.2023.739238.
Ю, Ю. (2023) 'Photodynamic терапиясы иммундук өткөрүү пунктунун ингибитендери жетишсиздигин жакшыртат, ал эми ашказан рагы менен бейтаптарга каршы иммунитет аркылуу иммундук өткөрүү пунктунун ингибиторлорунун натыйжасын жакшыртат,Ашказан рагы26 (5), 798-813-бб. DOI: 10.1007 / S10120-023-01409-X / METCICS.