BMKGENE кардарларынын негизги окуясы менен мисалга алынган жапайы ар түрдүү изилдөө түрлөрүн изилдөө потенциалын изилдеңиз.Жакында Plant Biotechnology Journal журналынын быйылкы санында жарык көргөн “Хромосома деңгээлиндеги Wild Hevea brasiliensis геному: Геномдун жардамы менен өстүрүүнү кеңейтүү жана резинадан жогорку түшүмдүүлүк үчүн маанилүү жерлерди ачуу” деген макала баалуу шилтеме катары турат.
Бразилиялык резина дарагы (Hevea brasiliensis) негизги табигый резина булагы катары бийик турат.Өткөн кылымдын ичинде салттуу асылдандыруу методологиялары каучук өндүрүшүнүн алты эсе чоң өсүшүнө түрткү болду.Бирок, каучуктун түшүмдүүлүгүн жогорулатуу үчүн жооптуу болгон негизги генетикалык тек табышмактуу бойдон калууда.
Бул изилдөө Nanopore узак окуу секвенирлөө, Illumina NGS секвенирлөө жана Hi-C технологиясынын синергиясын колдонуу менен жапайы резина дарагы үчүн хромосома деңгээлиндеги геномду түзүүгө киришти.
Буга катар эле, Illumina платформасын колдонуу менен геномдун комплекстүү ресеквенциясы (WGS) үчүн жогорку түшүмдүүлүктөгү вариацияларды, жапайы штаммдарды жана ага тиешелүү түрлөрдү камтыган 147 гермплазма ресурстарынын короосу чогултулган.Кийинки секвенирлөө маалыматтары популяциянын структурасын, көп түрдүүлүгүн жана байланыштын тең салмаксыздыгын ажыратууга мүмкүндүк берүүчү катуу популяциялык генетикалык анализден өттү.Бул талдоо популяциялар боюнча үй-жайлуу өзгөрүүлөргө жарык чачат.
Кийинки изилдөөлөр Fst, π, Tajima's D жана LD камтыган анализди камтыды, алар латекстин жакшыртылган түшүмүнөн келип чыккан тандоо сигналдарын ачууга багытталган, айрыкча Уикхэм клондоруна басым жасады.
Геном боюнча Ассоциациянын Анализинде (GWAS) жыйынтыкталган, түшүмдүүлүк белгилери менен байланышкан маркерлер жана андан кийин түшүмдүүлүк менен байланышкан гендер аныкталды.Алгачкы валидация эки ERF гени үчүн ар кандай мутанттардын айырмалоочу транскрипциялык ишмердүүлүгүн ачып берди, бул алардын функционалдык маанисин алдын ала көрүүгө мүмкүндүк берди.Андан ары ырастоо алдыдагы изилдөөлөрдүн алкагында пландаштырылууда.
BMKGENE биоинформатика анализинде маанилүү ролу менен бирге, бул чоң популяциянын геномунун кеңири секвенциясына салым кошкону менен сыймыктанат.Биздин чоң тажрыйбабыз NGS/TGS секвенирлөө жана 1000+ түрлөрдүн массивиндеги мультиомикалык биоинформатика анализин камтыйт.Биз сиздин алдыда боло турган долбоорлоруңузда сиз менен өнөктөш болуу мүмкүнчүлүгүн чыдамсыздык менен күтөбүз.
үчүн бул жерди басыңызбул изилдөө жөнүндө көбүрөөк билүү
Посттун убактысы: 29-август-2023