BMKGENE клиенттерінің негізгі мысалында келтірілген зерттеу түрлерінің жабайы әртүрлілігін зерттеу әлеуетін зерттеңіз.Жақында Өсімдік биотехнологиясы журналының биылғы басылымында жарияланған «Хромосома деңгейіндегі жабайы Hevea brasiliensis геномы: геномдық көмекті өсіру және жоғары резеңке өнімділігі үшін маңызды орындарды ашу» атты мақала құнды анықтамалық болып табылады.
Бразилиялық резеңке ағашы (Hevea brasiliensis) негізгі табиғи каучук көзі ретінде биік.Өткен ғасырда дәстүрлі селекциялық әдістемелер резеңке өндірісінің керемет алты есе өсуіне әкелді.Дегенмен, резеңке шығымдылығын арттыруға жауап беретін негізгі генетикалық жыныс жұмбақ болып қала береді.
Бұл зерттеу Nanopore ұзақ оқылатын секвенирлеу, Illumina NGS секвенирлеу және Hi-C технологиясының синергиясын қолдана отырып, жабайы резеңке ағашы үшін хромосома деңгейіндегі геномды құруға кірісті.
Сонымен қатар, Illumina платформасын пайдалана отырып, толық геномды қайта секвенирлеу (WGS) үшін жоғары өнімді вариацияларды, жабайы штаммдарды және ұқсас түрлерді қамтитын 147 гермплазма ресурстарының қоры жиналды.Кейінгі реттілік деректері популяция құрылымын, әртүрлілігін және байланыс тепе-теңдігін бөлуге мүмкіндік беретін қатаң популяциялық генетикалық талдаудан өтті.Бұл талдау популяциялардағы үйлену өзгерістеріне жарық түсіреді.
Әрі қарайғы зерттеулер Fst, π, Tajima's D және LD қамтитын талдауды қамтыды, бұл латекс шығымының жоғарылауынан туындайтын таңдау сигналдарын ашуға бағытталған, әсіресе Уикхэм клондарына назар аударады.
Жалпы геномдық қауымдастықтың талдауында (GWAS) қорытындылай келе, кірістілік белгілеріне байланысты маркерлер және кейіннен өнімділікке байланысты гендер анықталды.Бастапқы валидация екі ERF гені үшін әр түрлі мутанттар арасындағы ерекше транскрипциялық әрекеттерді ашты, бұл олардың функционалдық маңыздылығына алдын ала шолу жасады.Одан әрі растау алдағы зерттеулер аясында жоспарланған.
BMKGENE биоинформатика талдауында маңызды рөл атқара отырып, осы үлкен популяцияның толық геномдық қайта секвенциясына үлес қосқанын мақтан тұтады.Біздің үлкен тәжірибеміз NGS/TGS секвенирлеуін және 1000+ түр массивіндегі мультиомика биоинформатика талдауын қамтиды.Алдағы жобаларыңызда сізбен серіктес болу мүмкіндігін асыға күтеміз.
үшін осы жерді басыңызосы зерттеу туралы көбірек біліңіз
Жіберу уақыты: 29 тамыз 2023 ж