lncrna

Os RNAs não codificantes longos (lncRNAs) são RNAs com mais de 200 nucleotídeos, com baixo potencial de codificação, mas com funções regulatórias críticas. O pipeline BMKCloud lncRNA foi projetado para analisar bibliotecas com depleção de rRNA, utilizando um genoma de referência de alta qualidade e bem anotado, por meio da análise conjunta da expressão de lncRNAs e mRNAs. Após o corte e controle de qualidade das sequências, estas são alinhadas ao genoma de referência para a montagem dos transcritos. A análise subsequente da estrutura gênica revela splicing alternativo e novos genes. Os transcritos são identificados como mRNAs ou lncRNAs, e a análise de expressão diferencial identifica lncRNAs diferencialmente expressos, seus alvos e genes diferencialmente expressos (DEGs). Tanto os DEGs quanto os alvos dos lncRNAs diferencialmente expressos são anotados funcionalmente para identificar categorias funcionais enriquecidas.