Sequenciamento longo sem codificação-Illumina
Vantagens do serviço
●Análise conjunta de mRNA e lncRNA: combinando a quantificação de transcritos de mRNA com o estudo do lncRNA e seus alvos, é possível obter uma visão geral aprofundada do mecanismo regulatório subjacente à resposta celular.
●Ampla experiência: Nossa equipe traz uma vasta experiência para cada projeto, com um histórico de processamento de mais de 23.000 amostras na BMK, abrangendo diversos tipos de amostras e projetos de lncRNA.
●Rigoroso controle de qualidade: Implementamos pontos de controle centrais em todas as etapas, desde a preparação de amostras e bibliotecas até sequenciamento e bioinformática. Esse monitoramento meticuloso garante a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.
●Suporte pós-venda: Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto com um período de serviço pós-venda de 3 meses. Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.
Requisitos de amostra e entrega
| Biblioteca | Plataforma | Dados recomendados | Controle de qualidade de dados |
| Biblioteca direcional esgotada de rRNA | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nucleotídeos:
| Conc.(ng/μl) | Quantidade (μg) | Pureza | Integridade |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contaminação limitada ou inexistente de proteínas ou DNA mostrada no gel. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevação limitada ou nenhuma elevação da linha de base |
● Plantas:
Raiz, Caule ou Pétala: 450 mg
Folha ou Semente: 300 mg
Fruta: 1,2g
● Animal:
Coração ou Intestino: 450 mg
Vísceras ou Cérebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Ossos, Cabelo ou Pele: 1,5g
● Artrópodes:
Insetos: 9g
Crustáceos: 450 mg
● Sangue total:2 tubos
● Células: 106 células
● Soro e Plasma: 6ml
Entrega de amostra recomendada
Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (folha de estanho não é recomendada)
Rotulagem da amostra: Grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Expedição:
1. Gelo seco: As amostras precisam ser embaladas em sacos e enterradas em gelo seco.
2. Tubos RNAstable: As amostras de RNA podem ser secas em tubo de estabilização de RNA (por exemplo, RNAstable®) e enviadas em temperatura ambiente.
Fluxo de trabalho de serviço
Projeto de experimento
Entrega de amostra
Extração de RNA
Construção de biblioteca
Sequenciamento
Análise de dados
Serviços pós-venda
Bioinformática
Análise de Expressão Gênica Diferencial (DEGs)
Quantificação da expressão de lncRNA – agrupamento
Enriquecimento de genes alvo de lncRNA
Análise conjunta da posição de mRNA e lncRNA – gráfico Circos (o círculo intermediário é mRNA e o círculo interno é lncRNA)
Explore os avanços facilitados pelos serviços de sequenciamento de lncRNA da BMKGene por meio de uma coleção selecionada de publicações.
Ji, H. et al. (2020) 'Identificação, previsão funcional e verificação chave de lncRNA de lncRNAs relacionados ao estresse pelo frio no fígado de ratos', Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), pp. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'A análise transcriptômica integrativa revela o mecanismo imunológico para uma cepa de carpa comum resistente ao CyHV-3', Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Priorização baseada na integração multi-Omics de redes concorrentes de regulação de RNA endógeno em câncer de pulmão de pequenas células: características moleculares e candidatos a medicamentos', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Dissecção genética da rede de coexpressão genética subjacente à fotossíntese em Populus', Plant Biotechnology Journal, 18(4), pp. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Uma rede regulatória global para expressão gênica desregulada e sinalização metabólica anormal em células imunológicas no microambiente da doença de Graves e tireoidite de Hashimoto', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
