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Sequenciamento de Exoma Completo Humano

O sequenciamento completo do exoma (WES) é considerado uma estratégia de sequenciamento econômica para identificar mutações causadoras de doenças.Embora os exons ocupem apenas aproximadamente 1,7% de todo o genoma, eles representam diretamente o perfil das funções proteicas totais.No genoma humano, foi relatado que mais de 85% das mutações relacionadas a doenças ocorrem na região codificadora de proteínas.

A BMKGENE oferece serviços abrangentes e flexíveis de sequenciamento de exoma humano com diferentes estratégias de captura de éxons disponíveis para atender a vários objetivos de pesquisa.

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq


Detalhes do serviço

Resultados de demonstração

Vantagens do serviço

● Região Codificadora de Proteínas Alvo: ao capturar e sequenciar a região codificadora de proteínas, o hWES é utilizado para revelar variantes relacionadas à estrutura da proteína;
● Alta Precisão: com alta profundidade de sequenciamento, o hWES facilita a detecção de variantes comuns e variantes raras com frequências inferiores a 1%;
● Custo-benefício: hWES produz aproximadamente 85% de mutações de doenças humanas a partir de 1% do genoma humano;
● Cinco procedimentos rigorosos de controle de qualidade cobrindo todo o processo com Q30>85% garantido.

Especificações de amostra

Plataforma

 

Biblioteca

 

Estratégia de Captura de Exons

 

 Recomendar estratégia de sequenciamento

 

 

 

Plataforma Illumina NovaSeq

 

PE150

Agilent SureSelect Humano Todos Exon V6

Painel IDT xGen Exome Hyb V2

5 GB

10 GB

Requisitos de amostra

Tipo de amostra

 

 Quantia(Qubit®)

 

Volume

 

 Concentração

 

 

 Pureza (NanoDrop™)

 

DNA genômico

 

≥300ng
≥ 15 μL
≥ 20 ng/μL
 
DO260/280=1,8-2,0
 
sem degradação, sem contaminação

 

Profundidade de sequenciamento recomendada

Para distúrbios mendelianos/doenças raras: profundidade de sequenciamento efetiva acima de 50×
Para amostras de tumor: profundidade efetiva de sequenciamento acima de 100×

Bioinformática

Fluxo de trabalho WES_BI_Disease-01
Fluxo de trabalho WES_BI_Tumor-01

Fluxo de trabalho de serviço

entrega de amostra

Entrega de amostra

Experiência piloto

Extração de DNA

Preparação da Biblioteca

Construção de biblioteca

Sequenciamento

Sequenciamento

Análise de dados

Análise de dados

数据上传-01

Entrega de dados

Serviços pós-venda

Serviços pós-venda


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  • 1. Estatísticas de alinhamento

    Tabela 1 Estatísticas do resultado do mapa

     

    wps_doc_19

    Tabela 2 Estatísticas de captura de exoma

    wps_doc_2

    2. Detecção de Variação

    Figura 1 Estatísticas de SNV e InDel

    wps_doc_4

    wps_doc_3


     

    3.Análise Avançada

    Figura 2 Gráfico Circos de SNV e InDel prejudiciais em todo o genoma

    wps_doc_5 wps_doc_6

    Tabela 3 Triagem de genes causadores de doenças

    wps_doc_7 wps_doc_8 wps_doc_9

     

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