● depleção de rRNA seguida de preparação direcional da biblioteca de mRNA.
● Sequenciamento no Illumina NovaSeq.
●Estude as mudanças em comunidades microbianas complexas:Isso acontece no nível transcricional e explora potenciais novos genes.
●Explicando as interações da comunidade microbiana com o hospedeiro ou ambiente.
●Análise Bioinformática Abrangente: Isso fornece insights sobre composições taxonômicas e funcionais da comunidade, bem como análise diferencial de expressão gênica.
●Extensa anotação genética:Usando bancos de dados atualizados de funções genéticas para obter informações informativas sobre a expressão gênica de comunidades microbianas.
●Suporte pós-venda:Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto, com um período de serviço pós-venda de 3 meses. Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.
Plataforma de sequenciamento | Estratégia de sequenciamento | Dados recomendados | Controle de qualidade de dados |
Illumina NovaSeq | PE150 | 12 GB | Q30≥85% |
Concentração (ng/µL) | Quantidade total (µg) | Volume (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Inclui a seguinte análise:
● Controle de qualidade de dados de sequenciamento
● Montagem da transcrição
● Anotação Taxonômica e Abundância
● Anotação Funcional e Abundância
● Quantificação de Expressões e Análise Diferencial
Distribuição taxonômica de cada amostra:
Análise de diversidade beta: UPGMA
Anotação funcional – abundância GO
Abundância de taxonomia diferencial – LEFSE
Explore os avanços facilitados pelos serviços de sequenciamento de meta transcriptômica da BMKGene por meio de uma coleção selecionada de publicações.
Lu, Z. et al. (2023) 'A tolerância ácida de bactérias da ordem Bacteroidales que utilizam lactato contribui para a prevenção da acidose ruminal em cabras adaptadas a uma dieta rica em concentrado',Nutrição Animal, 14, pp. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Canção, Z. et al. (2017) 'Desvendando a microbiota funcional central na fermentação tradicional em estado sólido por amplicons de alto rendimento e sequenciamento metatranscriptômico',Fronteiras em Microbiologia, 8 (JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Novos micovírus descobertos em uma pesquisa metatranscriptômica do fungo fitopatogênico Alternaria',Vírus, 14(11), pág. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Análise paralela do metatranscriptoma revela degradação de metabólitos secundários de plantas por besouros e seus simbiontes intestinais',Molecular Ecologia, 31(15), pp. doi: 10.1111/MEC.16557.