Banner-03

Produtos

Sequenciamento de Metatranscriptoma

Aproveitando a tecnologia de sequenciamento da Illumina, o serviço de sequenciamento de metatranscriptoma da BMKGENE revela a expressão genética dinâmica de uma gama diversificada de micróbios, abrangendo eucariotos, procariontes e vírus, em ambientes naturais como solo, água, mar, fezes e intestino. Nosso serviço abrangente capacita os pesquisadores a se aprofundarem nos perfis completos de expressão gênica de comunidades microbianas complexas. Além da análise taxonômica, nosso serviço de sequenciamento de metatranscriptoma facilita a exploração do enriquecimento funcional, esclarecendo genes expressos diferencialmente e suas funções. Descubra uma riqueza de insights biológicos enquanto navega pelas paisagens complexas de expressão genética, diversidade taxonômica e dinâmica funcional dentro desses diversos nichos ambientais.


Detalhes do serviço

Bioinformática

Resultados de demonstração

Publicações em destaque

Recursos de serviço

● depleção de rRNA seguida de preparação direcional da biblioteca de mRNA.

● Sequenciamento no Illumina NovaSeq.

Vantagens do serviço

Estude as mudanças em comunidades microbianas complexas:Isso acontece no nível transcricional e explora potenciais novos genes.

Explicando as interações da comunidade microbiana com o hospedeiro ou ambiente.

Análise Bioinformática Abrangente: Isso fornece insights sobre composições taxonômicas e funcionais da comunidade, bem como análise diferencial de expressão gênica.

Extensa anotação genética:Usando bancos de dados atualizados de funções genéticas para obter informações informativas sobre a expressão gênica de comunidades microbianas.

Suporte pós-venda:Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto, com um período de serviço pós-venda de 3 meses. Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.

Especificações de serviço

Plataforma de sequenciamento

Estratégia de sequenciamento

Dados recomendados

Controle de qualidade de dados

Illumina NovaSeq

PE150

12 GB

Q30≥85%

Requisitos de amostra

Concentração (ng/µL)

Quantidade total (µg)

Volume (µL)

OD260/280

OD260/230

RIN

≥50

≥1,0

≥20

1,8-2,0

1,0-2,5

≥6,5

 

 

 

Fluxo de trabalho de serviço

entrega de amostra

Entrega de amostra

Preparação da Biblioteca

Construção de biblioteca

Sequenciamento

Sequenciamento

Análise de dados

Análise de dados

Serviços pós-venda

Serviços pós-venda


  • Anterior:
  • Próximo:

  • 流程图7-01

    Inclui a seguinte análise:

    ● Controle de qualidade de dados de sequenciamento

    ● Montagem da transcrição

    ● Anotação Taxonômica e Abundância

    ● Anotação Funcional e Abundância

    ● Quantificação de Expressões e Análise Diferencial

    Distribuição taxonômica de cada amostra:

     

     Foto 73

     

    Análise de diversidade beta: UPGMA

     

    Foto 74 

     

      

    Anotação funcional – abundância GO

     

    75 fotos 

     

    Abundância de taxonomia diferencial – LEFSE

     

     Foto 76

     

    Explore os avanços facilitados pelos serviços de sequenciamento de meta transcriptômica da BMKGene por meio de uma coleção selecionada de publicações.

    Lu, Z. et al. (2023) 'A tolerância ácida de bactérias da ordem Bacteroidales que utilizam lactato contribui para a prevenção da acidose ruminal em cabras adaptadas a uma dieta rica em concentrado',Nutrição Animal, 14, pp. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

    Canção, Z. et al. (2017) 'Desvendando a microbiota funcional central na fermentação tradicional em estado sólido por amplicons de alto rendimento e sequenciamento metatranscriptômico',Fronteiras em Microbiologia, 8 (JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

    Wang, W. et al. (2022) 'Novos micovírus descobertos em uma pesquisa metatranscriptômica do fungo fitopatogênico Alternaria',Vírus, 14(11), pág. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

    Wei, J. et al. (2022) 'Análise paralela do metatranscriptoma revela degradação de metabólitos secundários de plantas por besouros e seus simbiontes intestinais',Molecular Ecologia, 31(15), pp. doi: 10.1111/MEC.16557.

    obter uma cotação

    Escreva aqui sua mensagem e envie para nós

    Envie sua mensagem para nós: