RNA pequeno
Os pequenos RNAs (sRNAs) são RNAs não codificantes curtos com um comprimento médio de 18 a 30 nucleotídeos, incluindo miRNAs, siRNAs e piRNAs, que desempenham papéis importantes em processos regulatórios. O pipeline de sRNAs do BMKCloud oferece análises padrão e personalizadas para a identificação de miRNAs. Após o corte e o controle de qualidade das sequências, estas são alinhadas a múltiplos bancos de dados para classificar os sRNAs e selecionar os miRNAs, sendo posteriormente mapeadas para o genoma de referência. Os miRNAs são identificados com base em bancos de dados de miRNAs conhecidos, fornecendo informações sobre estrutura secundária, família de miRNAs e genes-alvo. A análise de expressão diferencial identifica os miRNAs diferencialmente expressos e os genes-alvo correspondentes são anotados funcionalmente para encontrar categorias enriquecidas.
Fluxo de trabalho em bioinformática