ØSàr eòlas: Chaidh còrr air 200,000 sampall a phròiseasadh ann am BMK a’ còmhdach diofar sheòrsaichean sampall, a’ toirt a-steach cultar cealla, clò, lionn bodhaig, msaa agus còrr air 7,000 pròiseact mRNA-Seq dùinte a’ còmhdach diofar raointean rannsachaidh.
ØSiostam smachd càileachd teann: Thathas a’ cumail sùil gheur air prìomh phuingean smachd càileachd tro gach ceum a’ gabhail a-steach ullachadh sampall, ullachadh leabharlainn, sreath agus bioinformatics gus toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh.
ØIoma stòran-dàta rim faighinn airson comharrachadh gnìomh agus sgrùdaidhean beairteachaidh gus diofar amasan rannsachaidh a choileanadh.
ØSeirbheisean às deidh reic: Seirbheisean às deidh reic dligheach airson 3 mìosan às deidh crìoch a chuir air a’ phròiseact, a ’toirt a-steach leantainn phròiseactan, fuasgladh dhuilgheadasan, toraidhean Q&A, msaa.
Leabharlann | Ro-innleachd sreathach | Dàta air a mholadh | Smachd Càileachd |
Poly A beairteachadh | Illumina airson PE 150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
Purity | Ionracas | Suim |
OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5Pròtain cuibhrichte no gun truailleadh DNA air a nochdadh air gel. | Airson lusan: RIN≥6.5; Airson beathaichean: RIN≥7; 28S / 18S≥1.0; àrdachadh bun-loidhne cuibhrichte no gun chrìoch | Conc.≥30 ng/μl;Volumn ≥ 10 μl;Iomlan ≥ 1.5 μg |
Meud: Cuideam (tioram):≥1 g
* Airson clò nas lugha na 5 mg, tha sinn a’ moladh sampall clò reòta (ann an nitrogen leaghaidh) a chuir.
Crochadh cealla:Cunntas cealla = 3 × 106- 1 × 107
* Tha sinn a’ moladh lysate cealla reòta a chuir air falbh.Air eagal ‘s gu bheil an cealla sin a’ cunntadh nas lugha na 5 × 105, thathas a ’moladh flash reòta ann an nitrigin leaghaidh, a tha nas fheàrr airson meanbh-tharraing.
Samhlaidhean fala:Meud ≥ 1 ml
Microorganism:Aifreann ≥ 1 g
Container: tiùb centrifuge 2 ml (chan eilear a’ moladh foil staoin)
Bileag sampaill: Buidheann + ath-riochdachadh me A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Gluasad:
Bith-fiosrachadh
Eukaryotic sruth-obrach mion-sgrùdadh sreath mRNA
Bith-fiosrachadh
ØSmachd càileachd dàta amh
ØCo-thaobhadh genome iomraidh
ØMion-sgrùdadh structar tar-sgrìobhaidh
ØMeudachadh abairt
ØMion-sgrùdadh faireachdainn eadar-dhealaichte
ØComharrachadh gnìomh agus beairteachadh
1.mRNA lùb sùghaidh dàta
2.Mion-sgrùdadh faireachdainn eadar-dhealaichte - cuilbheart bholcàno
3.Nota KEGG air DEGs
4.Seòrsachadh GO air DEGs