BMKCloud Log in
条形 bratach-03

Bathar

Sequencing mRNA eukaryotic-Illumina

Tha sreath mRNA a’ comasachadh cunntas a thoirt air a h-uile mRNA a chaidh ath-sgrìobhadh bho cheallan fo chumhachan sònraichte.Is e teicneòlas cumhachdach a th’ ann airson ìomhaigh faireachdainn gine, structaran gine agus uidheamachd moileciuil de phròiseasan bith-eòlasach sònraichte a nochdadh.Gu ruige seo, tha seicheamh mRNA air a chleachdadh gu farsaing ann an rannsachadh bunaiteach, breithneachadh clionaigeach, leasachadh dhrogaichean, msaa.

Àrd-ùrlar: Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq


Mion-fhiosrachadh seirbheis

Bith-fiosrachadh

Toraidhean Demo

Buannachdan

● Eòlas fìor mhath: Chaidh còrr air 200,000 sampall a phròiseasadh ann am BMK a ’còmhdach diofar sheòrsaichean sampall, a’ toirt a-steach cultar cealla, clò, lionn bodhaig, msaa agus còrr air 7,000 pròiseact mRNA-Seq dùinte a ’còmhdach diofar raon rannsachaidh.

● Siostam smachd càileachd teann: Bithear a’ cumail sùil gheur air prìomh phuingean smachd càileachd tro gach ceum a’ gabhail a-steach ullachadh sampall, ullachadh leabharlainn, òrdugh agus bioinformatics gus toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh.

● Ioma stòran-dàta rim faighinn airson comharrachadh gnìomh agus sgrùdaidhean beairteachaidh gus diofar amasan rannsachaidh a choileanadh.

● Seirbheisean às dèidh reic: Seirbheisean às dèidh reic dligheach airson 3 mìosan às deidh crìoch a’ phròiseict, a’ toirt a-steach leantainn phròiseactan, fuasgladh dhuilgheadasan, toraidhean Q&A, msaa.

Sampall riatanasan agus lìbhrigeadh

Leabharlann Ro-innleachd sreathach Dàta air a mholadh Smachd Càileachd
Poly A beairteachadh Illumina airson PE 150

6 Gb

Q30≥85%

Sampall Riatanasan:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Suim (μg)

Purity

Ionracas

≥20

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Pròtain cuibhrichte no gun truailleadh DNA air a nochdadh air gel.

Airson lusan: RIN≥6.5;

Airson beathaichean: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

àrdachadh bun-loidhne cuingealaichte no gun a bhith ann

Meud: Cuideam (tioram):≥1 g
* Airson clò nas lugha na 5 mg, tha sinn a’ moladh sampall clò reòta (ann an nitrogen leaghaidh) a chuir.

Crochadh cealla:Cunntas cealla = 3 × 106- 1 × 107
* Tha sinn a’ moladh lysate cealla reòta a chuir air falbh.Ma tha an cealla sin nas lugha na 5 × 105.

Samhlaidhean fuil:Meud ≥ 1 ml

Microorganism:Aifreann ≥ 1 g

Lìbhrigeadh sampall air a mholadh

Container: tiùb centrifuge 2 ml (chan eilear a’ moladh foil staoin)

Bileag sampaill: Buidheann + ath-riochdachadh me A1, A2, A3;B1, B2, B3......

Gluasad:

  1. Deigh thioram: Feumaidh sampaill a bhith air am pacadh ann am pocannan agus air an tiodhlacadh ann an deigh thioram.
  2. Tiùban RNAstable: Faodar sampallan RNA a thiormachadh ann an tiùb seasmhach RNA (me RNAstable®) agus a chuir a-steach aig teòthachd an t-seòmair.

Sruth Obrach Seirbheis

Eisimpleir QC

Dealbhadh deuchainn

lìbhrigeadh sampall

Lìbhrigeadh sampall

Deuchainn pìleat

às-tharraing RNA

Ag ullachadh leabharlainn

Togalach leabharlainn

Seicheamh

Seicheamh

Mion-sgrùdadh dàta

Mion-sgrùdadh dàta

Seirbheisean às deidh reic

Seirbheisean às deidh reic


  • Roimhe:
  • Air adhart:

  • Bith-fiosrachadh

    wps_doc_10

    Eukaryotic sruth-obrach mion-sgrùdadh sreath mRNA

    Bith-fiosrachadh

    ØSmachd càileachd dàta amh

    ØCo-thaobhadh genome iomraidh

    ØMion-sgrùdadh structar tar-sgrìobhaidh

    ØMeudachadh abairt

    ØMion-sgrùdadh abairt eadar-dhealaichte

    ØComharrachadh gnìomh agus beairteachadh

    1.mRNA lùb sùghaidh dàta

    3(1)

    2.Mion-sgrùdadh faireachdainn eadar-dhealaichte - cuilbheart bholcàno

    4(1)

    3.Nota KEGG air DEGs

    5(1)

    4.Seòrsachadh GO air DEGs

    6(1)

    faigh cuòt

    Sgrìobh do theachdaireachd an seo agus cuir thugainn e

    Cuir do theachdaireachd thugainn: