Sreathachadh mRNA Eukaryotic-NGS
Feartan
● Ullachadh leabharlann mRNA stiùiridh roghainneil gus leigeil le dàta sreathachaidh sònraichte do shreangan fhaighinn
● Bidh diofar mhion-sgrùdaidhean BI a’ còmhdach feumalachdan ar luchd-dèiligidh uile
Buannachdan
●Eòlas farsaingTha sinn air còrr is 600,000 sampall a phròiseasadh, a’ còmhdach diofar sheòrsaichean sampallan leithid cultaran cealla, clòthan, agus lionntan bodhaig. Bidh sinn a’ toirt ar pailteas eòlais gu gach pròiseact.
●Smachd Càileachd TeannBidh sinn a’ cur prìomh phuingean smachd an gnìomh thar gach ìre, bho ullachadh shampaill gu ullachadh leabharlainn, sreath-sgrùdadh agus bith-fhiosrachadh. Bidh ar sgrùdadh mionaideach a’ dèanamh cinnteach gu bheil toraidhean àrd-inbhe air an lìbhrigeadh gu cunbhalach.
●Notaichean CoileantaBidh sinn a’ cleachdadh iomadh stòr-dàta gus na Ginean a tha air an Cur an cèill gu Eadar-dhealaichte (DEGan) a chomharrachadh gu gnìomhach agus gus mion-sgrùdaidhean beairteachaidh co-fhreagarrach a dhèanamh. Tha an dòigh-obrach fharsaing seo a’ toirt sealladh dhuinn air na pròiseasan ceallach is moileciuil a tha aig bonn freagairt an transcriptome, a’ dèanamh cinnteach gum faigh thu a h-uile fiosrachadh a tha comasach mu dhàta an deuchainn agad.
●Taic às dèidh reicTha sinn a’ tuigsinn cho cudromach ’s a tha e a bhith an làthair, agus is e sin as coireach gu bheil ar dealas a’ dol nas fhaide na crìochnachadh a’ phròiseict le ùine seirbheis às dèidh reic 3 mìosan. Rè na h-ùine seo, bidh sinn a’ tabhann obair leanmhainn air a’ phròiseact, cuideachadh le fuasgladh dhuilgheadasan, agus seiseanan C&A gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.
Riatanasan Sampall agus Lìbhrigeadh
| Leabharlann | Ro-innleachd sreathachaidh | Dàta a thathar a’ moladh | Smachd Càileachd |
| Poly A air a neartachadh | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Riatanasan Eisimpleir:
Niùclasaidean:
Riatanasan Sampall as ìsle:
| Dùmhlachd (ng/μl) | Meud (μg) | Purrachd | Ionracas | |
| Leabharlann àbhaisteach | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Truailleadh pròtain no DNA cuibhrichte no gun truailleadh idir air a shealltainn air a’ ghel. | Airson lusan: RIN≥4.0; Airson bheathaichean: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; àrdachadh bun-loidhne cuibhrichte no gun àrdachadh sam bith |
| Leabharlann Treòrachaidh | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Truailleadh pròtain no DNA cuibhrichte no gun truailleadh idir air a shealltainn air a’ ghel. | Airson lusan: RIN≥4.0; Airson bheathaichean: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; àrdachadh bun-loidhne cuibhrichte no gun àrdachadh sam bith |
| Lusan | Ainmhidh | Artrapòdan | Fuil slàn | Ceallan |
| Freumh, Gas no Peatal: 450 mg Duilleag no sìol: 300 mg Measan: 1.2 g | Cridhe no Innidh: 300 mg Innidh no Eanchainn: 240 mg Fèithean: 450 mg Cnàmhan, falt no craiceann: 1g | Biastagan: 6g Crùbagan: 300 mg | 1 tiùb | 106 ceallan |
Lìbhrigeadh Sampall a thathar a’ moladh
Soitheach: tiùb centrifuge 2 ml (Chan eilear a’ moladh foil staoin)
Bileagan sampall: Buidhnean+ath-aithris m.e. A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Luingearachd:
1. Deigh thioram: Feumar sampallan a phacaigeadh ann am pocannan agus an tiodhlacadh ann an deigh thioram.
2. Tiùban clàir RNA: Faodar sampallan RNA a thiormachadh ann an tiùb seasmhachd RNA (me RNAstable®) agus an cur aig teòthachd an t-seòmair.
Riatanasan Sampall agus Lìbhrigeadh
Dealbhadh deuchainn
Lìbhrigeadh sampall
às-tharraing RNA
Togail leabharlainn
Seicheamhachadh
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às dèidh reic
Bith-fhiosrachadh
Airson sampallan le genome iomraidh ri fhaighinn, tha an anailis BI mar a leanas:
ØSmachd càileachd dàta amh
ØCo-thaobhadh genome iomraidh
ØMion-sgrùdadh structar tar-sgrìobhaidh
ØMeudachadh abairtean
ØMion-sgrùdadh abairtean eadar-dhealaichte
ØNotaichean gnìomh agus beairteachadh
Airson sampallan às aonais genome iomraidh, is e seo an roghainn a tha ri fhaighinn:
• Smachd càileachd dàta amh
•Co-chruinneachadh le leasachadh structarail
•Mion-sgrùdadh abairtean eadar-dhealaichte
•Notaichean gnìomh agus beairteachadh
Co-thaobhadh Genome Iomraidh
Sàthadh Dàta
Co-dhàimh shampall agus measadh ath-aithris bith-eòlasach
Ginean air an Cur an cèill gu Diofraichte (DEGan)
Notaichean Gnìomhach air DEGan
Beairteachadh Gnìomhach DEGan
Rannsaich na h-adhartasan a tha air an comasachadh le seirbheisean sreathanachaidh mRNA eukaryotic NGS aig BMKGene tro chruinneachadh curaichte de fhoillseachaidhean.
Huang, L. et al. (2023) ‘Bidh Triclosan agus triclocarban a’ lagachadh comas fàileadh iasg òir le bhith a’ cuingealachadh aithneachadh stuthan fàileadh, a’ cur dragh air tar-chur chomharran fàileadh, agus a’ cur dragh air giullachd fiosrachaidh fàileadh’,Rannsachadh Uisge, 233, td. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) ‘Bidh Aspergillus fumigatus a’ toirt thairis p11 daonna gus phagosomes anns a bheil fungasan ath-stiùireadh gu slighe neo-mhilleadh’,Aoigh Cealla & Mìcrob, 31(3), td 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Factaran Tar-sgrìobhaidh TCP a tha an sàs ann an Leasachadh Bhrògan Bambù Ma (Dendrocalamus latiflorus Munro)',Crìochan ann an Saidheans Lusan, 13, td. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) ‘Genome Chrysanthemum lavandulifolium agus an dòigh-obrach mhóileciuil air a bheil diofar sheòrsaichean capitulum mar bhunait’,Rannsachadh Gàrradaireachd, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) ‘Nano-reactar easgaichte airson leigheas sonodynamic a neartachadh air aillse colorectal tro àrdachadh ROS synergistic agus bacadh autophagy’,Nano an-diugh, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
