BMKCloud Log in

Bathar

Assay airson Chromatin Transposase-ruigsinneach le Seicheamh Àrd Trochur (ATAC-seq)

Assay airson Chromatin Transposase-ruigsinneach le Ìomhaigh le Seicheamh Àrd Trochur (ATAC-seq)

Tha ATAC-seq na dhòigh sreathachaidh àrd-toradh airson mion-sgrùdadh air ruigsinneachd chromatin air feadh genome, a tha cudromach airson smachd epigenetic cruinneil air faireachdainn gine.Bidh innealan-atharrachaidh seicheamhach air an cuir a-steach do roinnean chromatin fosgailte le transposase hyperactive Tn5.Às deidh leudachadh PCR, thèid leabharlann sreathachaidh a thogail.Gheibhear a h-uile roinn chromatin fosgailte fo chumhachan ùine-fànais sònraichte, chan ann a-mhàin air a chuingealachadh ri làraich ceangail factar tar-sgrìobhaidh, no sgìre atharraichte histone sònraichte.

Cuir fios thugainn

Mion-fhiosrachadh seirbheis

Bith-fiosrachadh

Toraidhean Demo

Buannachdan seirbheis

● Mion-sgrùdadh Cuimseach: Pìob-loidhne anailis proifeasanta gus coinneachadh ri diofar fheumalachdan sgrùdaidh gnàthaichte;

● Eòlas farsaing: Na ceudan de phròiseactan air an crìochnachadh gu soirbheachail gu ruige seo, a’ toirt a-steach sampallan bheathaichean is phlanntaichean.

Sònrachaidhean seirbheis

Àrd-ùrlar: àrd-ùrlar Illumina NovaSeq

Seòrsa leabharlainn: ATAC-seq

Toradh dàta a thathar a’ moladh: ≥20M a’ leughadh

Sampall Riatanasan

Seòrsa sampall: Fìnean, ceallan beò, no ceallan reòta agus mar sin air adhart

Àireamh cealla: ≥ 5 × 10⁵ceallan, tha àireamh cealla neo-mhearachdach deatamach airson soirbheachas an deuchainn;

Cuideam fighe: ≥ 200mg clò ùr;

Fuil: ≥ 2 mL

Sruth Obrach Seirbheis

Eisimpleir QC

Dealbhadh deuchainn

lìbhrigeadh sampall

Lìbhrigeadh sampall

Deuchainn pìleat

às-tharraing DNA

Ag ullachadh leabharlainn

Togalach leabharlainn

Seicheamh

Seicheamh

Mion-sgrùdadh dàta

Mion-sgrùdadh dàta

Seirbheisean às deidh reic

Seirbheisean às deidh reic

Roimhe: 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio

Air adhart: Sreath genome bisulfite slàn

1.Heatmap air ATAC a’ leughadh cuairteachadh aig TSS agus sgìrean faisg air làimh (±3 kb)

2.Distribution roinn chromatin fosgailte ann an diofar phàirtean genome

3.Differential stùc gairm eadar buidhnean

faigh cuòt

Sgrìobh do theachdaireachd an seo agus cuir thugainn e

Batharroinnean-seòrsa

Cuir do theachdaireachd thugainn: