Seicheamhachadh Bisulfite Riochdachaidh Lùghdaichte (RRBS)
Tha sreath-sgrùdadh bisulfite riochdachaidh lùghdaichte (RRBS) an urra ri beairteachadh roinnean beairteach ann an eileanan CpG le bhith a’ sgoltadh MspI agus an uairsin a’ taghadh meud de bhloighean 200-500/600 bps. Mar thoradh air an sin, chan eil ach roinnean faisg air eileanan CpG air an sreath-sgrùdadh, agus tha an fheadhainn le eileanan CpG fad às air an dùnadh a-mach às an anailis. Leigidh am pròiseas seo, còmhla ri sreath-sgrùdadh bisulfite, le lorg àrd-rùn air methylation DNA, agus tha an dòigh-obrach sreath-sgrùdaidh, PE150, ag amas gu sònraichte air cinn nan cuir-a-steach seach a’ mheadhan, ag àrdachadh èifeachdas pròifileadh methylation.
Tha an dòigh-obrach seo air nochdadh mar roghainn eile cosg-èifeachdach is èifeachdach an àite Sreathachadh Bisulfite an Genome Iomlan (WGBS) ann an rannsachadh methylation DNA. Ged a bheir WGBS lèirsinn choileanta le bhith a’ sgrùdadh a’ genome gu lèir aig rùn aon bhunait, faodaidh a chosgais àrd a bhith na fhactar cuibhrichte, agus tha RRBS a’ lughdachadh na dùbhlain seo gu ro-innleachdail le bhith a’ dèanamh anailis roghnach air pàirt riochdachail den genome. Tha an dòigh-obrach seo na inneal luachmhor a leigeas le rannsachadh methylation DNA cosg-èifeachdach agus a leasaicheas eòlas air uidheaman epigenetic.
Feartan Seirbheis
● Sreathachadh air Illumina NovaSeq.
● Feumaidh e genome iomraidh.
● Cleachdar DNA Lambda gus sùil a chumail air èifeachdas tionndaidh bisulfite.
● Tha èifeachdas cnàmhaidh MspI air a sgrùdadh cuideachd.
● Cnàmhadh dùbailte einnsein airson sampallan planntrais.
Buannachdan Seirbheis
●Roghainn eile a tha èifeachdach a thaobh cosgais agus èifeachdach an àite WGBSLeigidh e le anailis a bhith air a dhèanamh aig cosgais nas ìsle agus le riatanasan sampall nas ìsle.
●Àrd-ùrlar Coileanta:Bidh sinn a’ toirt seachad seirbheis aon-stad sàr-mhath bho phròiseasadh shampall, togail leabharlainn, agus sreath-sgrùdadh gu mion-sgrùdadh bith-fhiosrachaidh.
●Eòlas farsaingTha sinn air soirbheachadh thar raon farsaing de ghnèithean. Tha còrr is deich bliadhna de eòlas, sgioba anailis sgileil, susbaint coileanta, agus taic iar-reic sàr-mhath aig BMKGENE.
Sònrachaidhean Seirbheis
| Leabharlann | Ro-innleachd Sreathachaidh | Toradh dàta a thathar a’ moladh | Smachd càileachd |
| Leabharlann air a chnàmhadh le MspI agus air a làimhseachadh le Bisulfite | Illumina PE150 | 8 GB | Q30 ≥ 85% Tionndadh bisulfite > 99% Èifeachdas gearraidh MspI > 95% |
Riatanasan Sampall
| Dùmhlachd (ng/µL) | Suim iomlan (µg) |
| |
| DNA genomic | ≥ 30 | ≥ 1 | Milleadh no truailleadh cuibhrichte |
Sruth-obrach Seirbheis
Lìbhrigeadh sampall
Togail leabharlainn
Seicheamhachadh
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às dèidh reic
Tha mion-sgrùdadh BI a’ gabhail a-steach:
● Smachd càileachd sreath-chàraidh amh;
● Mapadh gu genome iomraidh;
● Lorgaidh bhunaitean meitilichte 5mC agus comharrachadh motif;
● Mion-sgrùdadh air sgaoileadh meitileachaidh agus coimeas sampall;
● Mion-sgrùdadh air Roinnean Methylated gu Diofraichte (DMRn);
● Notaichean gnìomhachail air ginean co-cheangailte ri DMRan.
Smachd càileachd: èifeachdas cnàmhaidh (ann am mapadh genome)
Smachd càileachd: tionndadh bisulfite (ann an às-tharraing fiosrachaidh methylation)
Mapa meitileachaidh: sgaoileadh air feadh a’ ghineim meitileachaidh 5mC
Coimeas sampall: Mion-sgrùdadh Prìomh Cho-phàirtean
Mion-sgrùdadh Roinnean Methylated Eadar-dhealaichte (DMRn): mapa teas
Rannsaich na h-adhartasan rannsachaidh a tha air an comasachadh le seirbheisean sreath-chàraidh bisulfite làn-ghineamach BMKGene tro chruinneachadh taghte de fhoillseachaidhean.
Li, Z. et al. (2022) ‘Ath-phrògramadh àrd-dhìlseachd ann an ceallan coltach ri Leydig le gnìomhachadh CRISPR agus factaran paracrine’,PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) ‘Mion-sgrùdadh meitileachaidh DNA air feadh a’ ghenòma air co-dhèanamh bodhaig ann an càraid monozygotic Sìneach’,Iris Eòrpach air Rannsachadh Clionaigeach, 53(11), td. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) ‘Methylation DNA agus co-mheas waist-to-crom: sgrùdadh co-cheangail air feadh an epigenome ann an càraid monozygotic Sìneach’,Iris Rannsachaidh Endocrinological, 45(12), td. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
