Mion-sgrùdadh Comann air feadh a’ Ghineim
Sruth-obrach
Buannachdan Seirbheis
●Eòlas farsaing agus clàran foillseachaidhLe eòlas cruinnichte ann an GWAS, tha BMKGene air ceudan de phròiseactan gnèithean a chrìochnachadh ann an rannsachadh GWAS sluaigh, air cuideachadh le luchd-rannsachaidh còrr is 100 artaigil fhoillseachadh, agus ràinig am bàillidh buaidh cruinnichte 500.
● Mion-sgrùdadh bith-fhiosrachaidh coileantaTha an t-sruth-obrach a’ toirt a-steach mion-sgrùdadh co-cheangailte ri feartan SNP, a’ lìbhrigeadh seata de ghinean tagraiche agus an notaichean gnìomh co-fhreagarrach.
●Sgioba bith-fhiosrachaidh sgileil agus cearcall anailis goiridLe eòlas mòr ann an mion-sgrùdadh genomics adhartach, bidh sgioba BMKGene a’ lìbhrigeadh mion-sgrùdaidhean coileanta le ùine tionndaidh luath.
●Taic às dèidh reic:Tha ar gealladh a’ dol nas fhaide na crìoch a chur air pròiseact le ùine seirbheis às dèidh reic 3 mìosan. Rè na h-ùine seo, bidh sinn a’ tabhann obair leanmhainn air pròiseactan, cuideachadh le fuasgladh dhuilgheadasan, agus seiseanan C&A gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.
Sònrachaidhean agus riatanasan seirbheis
| Seòrsa sreathachaidh | Sgèile sluaigh a thathar a’ moladh | Ro-innleachd sreathachaidh | Riatanasan niùclasaid |
| Sreathachadh Gìnoma Iomlan | 200 sampall | 10x | Dùmhlachd: ≥ 1 ng/ µL Suim iomlan ≥ 30ng Milleadh no truailleadh cuibhrichte no gun mhilleadh no truailleadh idir |
| Bloigh Meudaichte-Locus Sònraichte (SLAF) | Doimhneachd taga: 10x Àireamh nan tagaichean: < 400 Mb: Thathar a’ moladh WGS < 1Gb: 100K tagaichean 1Gb > 2Gb: 300K tagaichean 500k tagaichean aig a’ char as àirde | Dùmhlachd ≥ 5 ng/µL Suim iomlan ≥ 80 ng Nanoboinne OD260/280=1.6-2.5 Gel agarose: gun lobhadh no truailleadh no truailleadh cuibhrichte
|
Taghadh Stuthan
Diofar sheòrsachan, fo-ghnèithean, rèisean-tìre/bancaichean gine/teaghlaichean measgaichte/goireasan fiadhaich
Diofar sheòrsachan, fo-ghnèithean, agus rèisean-tìre
Teaghlach leth-pheathraichean/teaghlach làn-pheathraichean/goireasan fiadhaich
Sruth-obrach Seirbheis
Dealbhadh deuchainn
Lìbhrigeadh sampall
às-tharraing RNA
Togail leabharlainn
Seicheamhachadh
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às dèidh reic
A’ gabhail a-steach an anailis a leanas:
- Mion-sgrùdadh co-cheangailte air feadh a’ ghinòim: modail LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Notaichean gnìomhach air ginean tagraiche
Mion-sgrùdadh comann feartan SNP – plota Manhattan
Mion-sgrùdadh comann feartan SNP – plota QQ
Rannsaich na leasachaidhean a tha air an comasachadh le seirbheisean de GWAS aig BMKGene tro chruinneachadh de fhoillseachaidhean air an taghadh gu faiceallach:
Lv, L. et al. (2023) ‘Sealladh air bunait ginteil fulangas ammonia ann an clam-bhàin Sinonovacula constricta le sgrùdadh co-cheangailte air feadh a’ ghineim’,Àiteachas-uisge, 569, td. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) ‘Tha mion-sgrùdaidhean ioma-omics air 398 gabhail ri muilt earball-sionnach a’ nochdadh roinnean genomic co-cheangailte ri dachaigheachadh, feartan metabolite, agus buaidhean an-aghaidh sèid’,Lusan Moileciuil, 15(8), td. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Mapadh Comann air Feadh a' Ghenòma de Fheinotaipean Hulless Barely ann an Àrainneachd Tart',Crìochan ann an Saidheans Lusan, 13, td. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) ‘Bidh GmST1, a bhios a’ còdachadh sulfotransferase, a’ toirt strì an aghaidh sreathan bhìoras moasaig pònairean soighe G2 agus G3’,Lusan, Cealla & Àrainneachd, 44(8), td. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
