Seicheamhachadh Amplicon (16S/18S/ITS)

Tha sreath Amplicon (16S/18S/ITS) le Illumina na dhòigh air iomadachd meanbh-fhàs-bheairtean a sgrùdadh le bhith a’ comharrachadh phròifilean meanbh-fhàs-bheairtean a rèir an sreathan agus an uairsin a’ feuchainn ri beairteas agus iomadachd coimhearsnachd a dhì-chòdachadh taobh a-staigh gach sampall agus eadar sampallan. Leigidh loidhne-phìoban BMKCloud Amplicon (NGS) le mion-sgrùdadh a dhèanamh air 16S, 18S, ITS agus iomadh gine gnìomhach. Bidh e a’ tòiseachadh le bearradh leughaidh, cruinneachadh leughaidh aig ceann paidhir agus measadh càileachd, agus an uairsin cruinneachadh de leughaidhean coltach ris gus Aonadan Tacsonamach Obrachaidh (OTUn) a chruthachadh a thathas a’ cleachdadh ann an sia earrannan mion-sgrùdaidh eadar-dhealaichte. Bidh anotachadh tacsonamach a’ toirt seachad fiosrachadh mu pailteas agus co-dhèanamh coimeasach gach sampall, agus bidh mion-sgrùdaidhean iomadachd alpha agus beta a’ cur fòcas air iomadachd meanbh-fhàs-bheairtean taobh a-staigh agus eadar sampallan, fa leth. Bidh mion-sgrùdadh eadar-dhealaichte eadar buidhnean a’ lorg OTUn a tha eadar-dhealaichte a’ cleachdadh deuchainnean paraimeadrach agus neo-pharaimeadrach, agus bidh mion-sgrùdadh co-dhàimh a’ ceangal nan eadar-dhealachaidhean sin ri factaran àrainneachdail. Mu dheireadh, thathas a’ ro-innse pailteas gine gnìomhach stèidhichte air pailteas gine comharrachaidh, a’ toirt sealladh air gnìomh agus eag-eòlas anns gach sampall.