Mion-sgrùdadh mRNA eukaryotic (roghainnean stèidhichte air iomraidhean agus de novo rim faighinn)
Bidh an loidhne-phìoban seo a’ cleachdadh dàta NGS RNA-Seq mar chur-a-steach agus a’ toirt a-mach toraidhean bho iomadh mion-sgrùdadh sìos an abhainn a’ gabhail a-steach ach gun a bhith cuibhrichte gu: measadh càileachd dàta sreathachaidh,ùrmion-sgrùdadh làraich tar-sgrìobhaidh, mion-sgrùdadh splaiseadh caochlaideach, mion-sgrùdadh abairtean eadar-dhealaichte, mion-sgrùdadh gnìomh agus mion-sgrùdadh beairteachaidh.
Mion-sgrùdadh RNA fada neo-chòdaidh
Is e tar-sgrìobhaidhean neo-chòdaidh a th’ ann an RNAn fada neo-chòdaidh (lncRNA) le faid nas fhaide na 200 nt agus tha fios gu bheil pàirt aca ann an eagrachadh agus riaghladh chromatin. Tha teicneòlasan sreath-chur àrd-toraidh agus bith-fhiosrachadh air ar tuigse air sreathan lncRNA agus fiosrachadh suidheachaidh a neartachadh gus lncRNAn le gnìomhan riaghlaidh deatamach a chomharrachadh. Tha an loidhne-phìoban seo a’ toirt seachad mion-sgrùdadh lncRNA a bharrachd air na mion-sgrùdaidhean a tha air an ainmeachadh ann am loidhne-phìoban Mion-sgrùdadh mRNA Eukaryotic.
Sreathachadh amplicon 16S/18S/ITS
Chaidh loidhne-phìoban mion-sgrùdaidh iomadachd meanbh-bhitheach Amplicon Sequencing a leasachadh stèidhichte air bliadhnaichean de eòlas ann am mion-sgrùdadh phròiseactan iomadachd meanbh-bhitheach. Tha mion-sgrùdadh bunaiteach àbhaisteach anns a’ phìob-phìoban, a tha a’ còmhdach susbaint prìomh-shruthach mion-sgrùdaidh rannsachaidh meanbh-bhitheach gnàthach agus mion-sgrùdadh pearsanaichte. Tha an aithisg mion-sgrùdaidh beairteach agus coileanta, leis an roghainn mion-sgrùdadh pearsanta eadar-mheasgte a dhèanamh. A bharrachd air an sin, faodar sampallan agus buidhnean atharrachadh gu sgiobalta airson gnàthachadh agus smachd a bharrachd.
Mion-sgrùdadh Meata-ghineamach Ghunnaichean-spreadhaidh
Bidh loidhne-phìoban Mion-sgrùdadh Metagenomic Shotgun a’ cleachdadh dàta NGS bho stuthan measgaichte genomic a chaidh a thoirt a-mach à sampallan àrainneachdail. Bidh na mion-sgrùdaidhean a tha air an toirt a-steach a’ toirt seachad fiosrachadh mionaideach mu iomadachd agus pailteas ghnèithean, structar sluaigh, dàimh phylogenetic, ginean gnìomhach, agus lìonraidhean co-dhàimh le factaran àrainneachdail.
Mion-sgrùdadh Caochlaideach NGS-WGS
’S e loidhne-phìoban amalaichte airson lorg atharrachaidhean a th’ ann an Mion-sgrùdadh Caochlaidhean NGS-WGS a bhios a’ dèanamh smachd càileachd dàta, co-thaobhadh sreath, anotachadh, agus mion-sgrùdadh mùthaidhean gine. Tha an loidhne-phìoban a’ leantainn cleachdaidhean as fheàrr GATK airson lorg SNP agus InDel agus a’ cleachdadh Manta airson gairm atharrachaidhean structarail.
Sgrùdadh Comann Gèanòm-fharsaing (GWAS)
’S e mion-sgrùdadh sìos an abhainn a th’ ann am pìob-loidhne GWAS a bhios a’ gabhail faidhlichean VCF a chaidh a chruthachadh roimhe agus dàta phenotype co-fhreagarrach airson buidheann de dhaoine fa leth mar chur-a-steach. Le bhith a’ cleachdadh modhan-obrach staitistigeil sònraichte, tha GWAS ag amas air atharrachaidhean niùclasaid air feadh a’ ghineim a lorg a tha co-cheangailte ri eadar-dhealachaidhean phenotype. Tha pàirt chudromach aige ann a bhith a’ sgrùdadh ginean gnìomhach co-cheangailte ri galairean daonna iom-fhillte agus feartan iom-fhillte ann an lusan is beathaichean.
Mion-sgrùdadh Sgaradh Mòr-chuid (BSA)
Tha mion-sgrùdadh BSA a’ toirt a-steach cruinneachadh dhaoine fa leth le feartan fenotypic anabarrach bho shluagh a tha a’ sgaradh. Le bhith a’ dèanamh coimeas eadar loci eadar-dhealaichte eadar na sampallan cruinnichte, bidh an dòigh-obrach seo a’ comharrachadh gu luath comharran moileciuil dlùth-cheangailte co-cheangailte ri ginean targaid. Air a chleachdadh gu farsaing ann am mapadh ginteil lusan is bheathaichean, tha e na inneal luachmhor airson briodadh le taic chomharran.
Mion-sgrùdadh Gintinneachd Mean-fhàsach
Tha sruth-obrach Mion-sgrùdadh Gintinneachd Mean-fhàsach a’ cleachdadh eòlas farsaing BMKGENE ann am pròiseactan mean-fhàs ginteil agus tha e a’ toirt a-steach togail chraobhan fìleogenetach, mion-sgrùdadh neo-chothromachadh ceangail, measadh iomadachd ginteil, comharrachadh sguab roghnach, mion-sgrùdadh càirdeas, mion-sgrùdadh prìomh phàirtean, agus comharrachadh structar sluaigh.
