条形 bratach-03

Toraidhean

Sreathachadh Exome Slàn Daonna

Tha sreath-sgrùdadh exome slàn daonna (hWES) air aithneachadh gu farsaing mar dhòigh-obrach sreath-sgrùdaidh cosg-èifeachdach agus cumhachdach airson mùthaidhean a dh’ adhbharaicheas galairean a chomharrachadh. A dh’ aindeoin nach eil iad a’ dèanamh suas ach mu 1.7% den genome gu lèir, tha pàirt chudromach aig exons le bhith a’ nochdadh gu dìreach pròifil ghnìomhan pròtain iomlan. Gu sònraichte, ann an genome daonna, tha còrr air 85% de mùthaidhean co-cheangailte ri galairean a’ nochdadh taobh a-staigh nan roinnean còdaidh pròtain. Tha BMKGENE a’ tabhann seirbheis sreath-sgrùdaidh exome slàn daonna coileanta agus sùbailte le dà ro-innleachd glacaidh exon eadar-dhealaichte rim faighinn gus coinneachadh ri diofar amasan rannsachaidh.


Mion-fhiosrachadh Seirbheis

Toraidhean Taisbeanaidh

Feartan Seirbheis

● Dà phannal exome rim faighinn stèidhichte air beairteachadh targaid le proban: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) agus xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sreathachadh air Illumina NovaSeq.

● Pìob-loidhne bith-fhiosrachaidh a tha ag amas air mion-sgrùdadh galair no mion-sgrùdadh tumhair.

Buannachdan Seirbheis

A’ targaideadh roinn còdaidh pròtainLe bhith a’ glacadh agus a’ cur sreath air roinnean còdaidh pròtain, thathar a’ cleachdadh hWES gus atharrachaidhean co-cheangailte ri structar pròtain fhoillseachadh.

Cosg-èifeachdach:Bidh hWES a’ toirt a-mach timcheall air 85% de na mùthaidhean co-cheangailte ri galairean daonna bho 1% de ghinòm an duine.

Cruinneas ÀrdLe doimhneachd sreath àrd, bidh hWES a’ comasachadh lorg atharrachaidhean cumanta agus atharrachaidhean tearc le triceadan nas ìsle na 1%.

Smachd Càileachd TeannBidh sinn a’ cur an gnìomh còig prìomh phuingean smachd thar gach ìre, bho ullachadh shampaill is leabharlainn gu sreath-sgrùdadh agus bith-fhiosrachadh. Bidh an sgrùdadh mionaideach seo a’ dèanamh cinnteach gun tèid toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh gu cunbhalach.

Mion-sgrùdadh Bith-fhiosrachaidh CoileantaTha ar loidhne-phìoban a’ dol nas fhaide na bhith a’ comharrachadh atharrachaidhean air a’ ghìneom iomraidh, oir tha e a’ toirt a-steach mion-sgrùdadh adhartach a chaidh a dhealbhadh gus dèiligeadh gu sònraichte ri ceistean rannsachaidh co-cheangailte ri taobhan ginteil ghalaran no mion-sgrùdadh tumhair.

Taic às dèidh reic:Tha ar gealladh a’ dol nas fhaide na crìoch a chur air pròiseact le ùine seirbheis às dèidh reic 3 mìosan. Rè na h-ùine seo, bidh sinn a’ tabhann obair leanmhainn air pròiseactan, cuideachadh le fuasgladh dhuilgheadasan, agus seiseanan C&A gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.

Sònrachaidhean Eisimpleir

Ro-innleachd Glacaidh Exon

Ro-innleachd Sreathachaidh

Toradh Dàta a thathar a’ Moladh

Tagh Sure Human All Exon v6 (Agilent)

no Pannal Tar-chinealachachaidh Exome xGen v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5 -10 GB

Airson eas-òrdughan/galairean tearc Mendelian: > 50x

Airson sampallan tumhair: ≥ 100x

Riatanasan Sampall

Seòrsa Sampall

 

 Suim(Qubit®)

 

Dùmhlachd 

Meud

 

 

 Purity (NanoDrop™)

 

DNA genomic

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280=1.8-2.0
 
gun mhilleadh, gun truailleadh

 

Bith-fhiosrachadh

Sruth-obrach WES_BI_Galar-01

Tha mion-sgrùdadh bith-fhiosrachail air sampallan galair hWES a’ gabhail a-steach:

● Dàta sreathachaidh QC

● Co-thaobhadh Gìneam Iomraidh

● Comharrachadh SNPan agus InDels

● Mìneachadh Gnìomhach air SNPan agus InDels

Sruth-obrach WES_BI_Tumor-01

Tha mion-sgrùdadh bith-fhiosrachail air sampallan tumhair a’ gabhail a-steach:

● Dàta sreathachaidh QC

● Co-thaobhadh Gìneam Iomraidh

● Comharrachadh SNPan, InDels agus atharrachaidhean somatic

● Comharrachadh atharrachaidhean loidhne-ghine

● Mion-sgrùdadh air soidhnichean mùthaidh

● Comharrachadh ghinean dràibhidh stèidhichte air mùthaidhean buannachd-gnìomh

● Nòtaichean mu mhùthaidhean aig ìre so-leòntachd dhrogaichean

● Mion-sgrùdadh neo-aonghnèitheachd – àireamhachadh purrachd agus ploideachd

Sruth-obrach Seirbheis

lìbhrigeadh sampall

Lìbhrigeadh sampall

Deuchainn pìleat

Tarraing DNA

Ullachadh Leabharlainn

Togail leabharlainn

Seicheamhachadh

Seicheamhachadh

Mion-sgrùdadh dàta

Mion-sgrùdadh dàta

数据上传-01

Lìbhrigeadh dàta

Seirbheisean às dèidh reic

Seirbheisean às dèidh reic


  • Roimhe:
  • Air adhart:

  • QC Dàta – Staitistig air glacadh Exome

     

    wps_doc_22

     

    Aithneachadh caochlaideach – InDels

    dealbh 36

    Mion-sgrùdadh adhartach: comharrachadh agus sgaoileadh SNPan/InDels cronail – plota Circos

     

    dealbh 37

    Mion-sgrùdadh tumhair: comharrachadh agus sgaoileadh mùthaidhean somatach – plota Circos

     

    dealbh 38

     

    Mion-sgrùdadh tumhair: loidhnichean clonal

     

    dealbh 39

     

    faigh luachan

    Sgrìobh do theachdaireachd an seo agus cuir thugainn i

    Cuir do theachdaireachd thugainn: