ការធ្វើលំដាប់ប៊ីស៊ុលហ្វីតហ្សែនទាំងមូល (WGBS)
បច្ចេកទេសនេះ ដែលផ្អែកលើការព្យាបាលដោយប៊ីស៊ុលហ្វីតនៃ DNA ដើម្បីជំរុញការបំប្លែងស៊ីតូស៊ីនដែលមិនមានមេទីលទៅជាអ៊ុយរ៉ាស៊ីល (C ទៅ U) ខណៈពេលដែលទុកស៊ីតូស៊ីនដែលមានមេទីលឱ្យនៅដដែល ឈរជាវិធីសាស្ត្រស្តង់ដារមាសសម្រាប់ការរុករកស៊ីជម្រៅនៃមេទីលនៃ DNA ជាពិសេសទីតាំងទីប្រាំនៅក្នុងស៊ីតូស៊ីន (5-mC) ដែលជានិយតករសំខាន់នៃការបញ្ចេញហ្សែន និងសកម្មភាពកោសិកា។
បច្ចេកទេសនេះផ្តល់នូវគុណភាពបង្ហាញមូលដ្ឋានតែមួយ ដែលអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកស្រាវជ្រាវស៊ើបអង្កេតយ៉ាងទូលំទូលាយអំពីមេទីឡូម និងស្វែងរកលំនាំមេទីឡាស្យុងមិនប្រក្រតីនៅក្នុងគំរូ។ តាមរយៈការប្រើប្រាស់ WGBS អ្នកវិទ្យាសាស្ត្រអាចទទួលបានការយល់ដឹងដែលមិនអាចប្រៀបផ្ទឹមបានអំពីទេសភាពមេទីឡាស្យុងទូទាំងហ្សែន ដោយផ្តល់នូវការយល់ដឹងលម្អិតអំពីយន្តការអេពីហ្សែនដែលជាមូលដ្ឋានគ្រឹះនៃដំណើរការជីវសាស្រ្ត និងជំងឺចម្រុះ។
លក្ខណៈពិសេសសេវាកម្ម
● ការធ្វើលំដាប់លើ Illumina NovaSeq។
● តម្រូវឱ្យមានហ្សែនយោង។
● DNA Lambda ត្រូវបានបន្ថែមដើម្បីតាមដានប្រសិទ្ធភាពបំលែងប៊ីស៊ុលហ្វីត។
គុណសម្បត្តិសេវាកម្ម
●ស្តង់ដារមាសសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវមេទីលឌីអិនអេបច្ចេកវិទ្យាចាស់ទុំនេះមានភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់ និងអាចផលិតឡើងវិញបានល្អ។
●ការគ្របដណ្តប់ទូលំទូលាយ និងគុណភាពបង្ហាញមូលដ្ឋានតែមួយ៖ការរកឃើញកន្លែងមេទីឡាស្យុងគឺនៅកម្រិតទូទាំងហ្សែន។
●វេទិកាពេញលេញ៖យើងខ្ញុំផ្តល់សេវាកម្មតែមួយច្រកចេញចូលតែមួយ ចាប់ពីការដំណើរការគំរូ ការសាងសង់បណ្ណាល័យ ការធ្វើលំដាប់ទិន្នន័យ រហូតដល់ការវិភាគជីវព័ត៌មានវិទ្យា។
●ជំនាញទូលំទូលាយយើងខ្ញុំមានគម្រោងជាច្រើនដែលបានបញ្ចប់លើប្រភេទសត្វផ្សេងៗគ្នា។ BMKGENE នាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាងមួយទសវត្សរ៍ ក្រុមវិភាគដែលមានជំនាញខ្ពស់ ខ្លឹមសារដ៏ទូលំទូលាយ និងការគាំទ្រក្រោយពេលលក់ដ៏ល្អឥតខ្ចោះ។
●លទ្ធភាពក្នុងការចូលរួមជាមួយការវិភាគ Transcriptomicsអនុញ្ញាតឱ្យមានការវិភាគរួមបញ្ចូលគ្នានៃ WGBS ជាមួយទិន្នន័យ omics ផ្សេងទៀតដូចជា RNA-seq។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសគំរូ
| បណ្ណាល័យ | យុទ្ធសាស្ត្ររៀបលំដាប់ | លទ្ធផលទិន្នន័យដែលបានណែនាំ | ការគ្រប់គ្រងគុណភាព |
| ប៊ីស៊ុលហ្វីតត្រូវបានព្យាបាល | អ៊ីលមូណា PE150 | ជម្រៅ 30x | Q30 ≥ 85% ការបំលែងប៊ីស៊ុលហ្វីត > 99% |
តម្រូវការគំរូ
| កំហាប់ (ng/µL) | បរិមាណសរុប (ង) | តម្រូវការបន្ថែម | |
| ឌីអិនអេហ្សែន | ≥ ១.២៥ | ≥ ១០០ | ការរិចរិល ឬការបំពុលមានកំណត់ |
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការដឹកជញ្ជូនគំរូ
ការស្រង់ចេញ DNA
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
ការរៀបចំលំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
ការដឹកជញ្ជូនទិន្នន័យ
សេវាកម្មនេះរួមមានការវិភាគដូចខាងក្រោម៖
● ការគ្រប់គ្រងគុណភាពនៃការធ្វើលំដាប់ឆៅ;
● ការគូសផែនទីទៅកាន់ហ្សែនយោង;
● ការរកឃើញបាសមេទីល 5mC;
● ការវិភាគនៃការចែកចាយមេទីឡាស្យុង និងការចំណារពន្យល់;
● ការវិភាគតំបន់ដែលមានមេទីលខុសៗគ្នា (DMRs);
● ការកំណត់ចំណាំមុខងារនៃហ្សែនដែលជាប់ទាក់ទងនឹង DMRs។
ការរកឃើញមេទីឡាស្យុង 5mC៖ ប្រភេទនៃទីតាំងមេទីឡាស្យុង
ផែនទីមេទីលឡាស្យុង។ ការចែកចាយមេទីលឡាស្យុង 5mC ទូទាំងហ្សែន
ចំណារពន្យល់នៃតំបន់ដែលមានមេទីលខ្ពស់
តំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ហ្សែនពាក់ព័ន្ធ
តំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ការចំណារពន្យល់នៃហ្សែនដែលពាក់ព័ន្ធ (ហ្សែនវិទ្យា)
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពស្រាវជ្រាវដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មស៊ីក្វេនប៊ីស៊ុលហ្វីតហ្សែនទាំងមូលរបស់ BMKGene តាមរយៈការប្រមូលផ្ដុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយដែលបានរៀបចំយ៉ាងល្អ។
Fan, Y. et al. (2020) 'ការវិភាគទម្រង់មេទីឡាស្យុង DNA អំឡុងពេលការអភិវឌ្ឍសាច់ដុំគ្រោងឆ្អឹងចៀមដោយប្រើការរៀបលំដាប់ប៊ីស៊ុលហ្វីតហ្សែនទាំងមូល',ហ្សែន BMC, ២១(១), ទំព័រ ១–១៥។ doi: 10.1186/S12864-020-6751-5 ។
Zhao, X. et al. (2022) 'ការរំខានដល់មេទីឡាស្យុងអាស៊ីត deoxyribonucleic ថ្មីចំពោះកម្មករដែលប៉ះពាល់នឹងវីនីលក្លរួ'ជាតិពុលវិទ្យា និងសុខភាពឧស្សាហកម្ម, 38(7), ទំព័រ 377–388 ។ doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'ទំនាក់ទំនងរវាងមេទីឡាស្យុងហ្សែន កម្រិតនៃ RNA ដែលមិនកូដ mRNA និងសារធាតុរំលាយអាហារនៅក្នុងផ្លែប៉េងប៉ោះទុំ',ទិនានុប្បវត្តិរុក្ខជាតិ, 103(3), ទំព័រ 980–994 ។ doi: 10.1111/TPJ.14778 ។
