● ទាមទារហ្សែនយោង។
● Lambda DNA ត្រូវបានបន្ថែមដើម្បីតាមដានប្រសិទ្ធភាពនៃការបំប្លែង bisulfite ។
● តម្រៀបនៅលើ Illumina NovaSeq ។
●ស្តង់ដារមាសសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវ DNA Methylation៖ បច្ចេកវិទ្យាដំណើរការបំប្លែងមេទីលចាស់ទុំនេះ មានភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់ និងអាចបន្តពូជបានល្អ។
●ការគ្របដណ្តប់ធំទូលាយ និងដំណោះស្រាយមូលដ្ឋានតែមួយ៖ការរកឃើញទីតាំង methylation នៅកម្រិតហ្សែនធំទូលាយ។
●វេទិកាពេញលេញ៖ផ្តល់សេវាកម្មល្អឥតខ្ចោះតែម្តង ចាប់ពីដំណើរការគំរូ ការសាងសង់បណ្ណាល័យ លំដាប់លំដោយ រហូតដល់ការវិភាគជីវព័ត៌មាន។
●ជំនាញទូលំទូលាយ៖ ជាមួយនឹងគម្រោងលំដាប់ WGBS ត្រូវបានបញ្ចប់ដោយជោគជ័យលើប្រភេទសត្វចម្រុះ BMKGENE នាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាងមួយទសវត្សរ៍ ក្រុមវិភាគដែលមានជំនាញខ្ពស់ ខ្លឹមសារដ៏ទូលំទូលាយ និងការគាំទ្រក្រោយការលក់ដ៏ល្អ។
●លទ្ធភាពចូលរួមជាមួយការវិភាគប្រតិចារិក៖ អនុញ្ញាតឱ្យមានការវិភាគរួមបញ្ចូលគ្នានៃ WGBS ជាមួយនឹងទិន្នន័យ omics ផ្សេងទៀតដូចជា RNA-seq ។
បណ្ណាល័យ | យុទ្ធសាស្រ្តលំដាប់ | ទិន្នផលទិន្នន័យដែលបានណែនាំ | ការត្រួតពិនិត្យគុណភាព |
Bisulfite ព្យាបាល | Illumina PE150 | ជម្រៅ 30x | Q30 ≥ 85% ការបំប្លែង Bisulfite > 99% |
ការប្រមូលផ្តុំ (ng / μL) | បរិមាណសរុប (µg) | តម្រូវការបន្ថែម | |
DNA ហ្សែន | ≥ ៥ | ≥ 400 ng | ការរិចរិលឬការចម្លងរោគមានកំណត់ |
រួមបញ្ចូលការវិភាគដូចខាងក្រោមៈ
● ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពលំដាប់ឆៅ;
● ការធ្វើផែនទីដើម្បីយោងហ្សែន;
●ការរកឃើញនៃមូលដ្ឋាន methylated 5mC;
● ការវិភាគនៃការចែកចាយមេទីល និងចំណារពន្យល់;
● ការវិភាគនៃតំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល (DMRs);
● ចំណារពន្យល់មុខងារនៃហ្សែនដែលទាក់ទងនឹង DMRs ។
ការរកឃើញមេទីល 5mC៖ ប្រភេទនៃទីតាំងមេទីល
ផែនទី Methylation ។ ការចែកចាយមេទីល 5mC ហ្សែនធំទូលាយ
ចំណារពន្យល់អំពីតំបន់ដែលមានជាតិមេទីលខ្ពស់។
តំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ហ្សែនដែលពាក់ព័ន្ធ
តំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ចំណារពន្យល់អំពីហ្សែនដែលពាក់ព័ន្ធ (ហ្សែន Ontology)
ស្វែងរកភាពជឿនលឿននៃការស្រាវជ្រាវដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មតម្រៀបហ្សែនប៊ីស៊ុលហ្វីតទាំងមូលរបស់ BMKGene តាមរយៈបណ្តុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយ។
អ្នកគាំទ្រ, Y. et al ។ (2020) 'ការវិភាគទម្រង់ DNA methylation កំឡុងពេលអភិវឌ្ឍសាច់ដុំគ្រោងឆ្អឹងរបស់ចៀម ដោយប្រើលំដាប់ហ្សែនទាំងមូល bisulfite',ហ្សែន BMC, ២១(១), ទំព័រ ១–១៥។ doi: 10.1186/S12864-020-6751-5 ។
Zhao, X. et al ។ (2022) 'ការរំខានមេទីលអាស៊ីត deoxyribonucleic ប្រលោមលោកនៅក្នុងកម្មករដែលប៉ះពាល់នឹងក្លរួវីនីល',គីមីវិទ្យា និងសុខភាពឧស្សាហកម្ម, 38(7), ទំព័រ 377–388 ។ doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al ។ (2020) 'ទំនាក់ទំនងរវាង genome methylation, កម្រិតនៃ RNAs ដែលមិនសរសេរកូដ, mRNAs និងសារធាតុរំលាយនៅក្នុងផ្លែប៉េងប៉ោះទុំ',ទិនានុប្បវត្តិរុក្ខជាតិ, 103(3), ទំព័រ 980–994 ។ doi: 10.1111/TPJ.14778 ។