条形 Banner-០៣

ផលិតផល

លំដាប់ហ្សែនប៊ីស៊ុលហ្វីតទាំងមូល (WGBS)

企业微信截图_17374388013932

Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) តំណាងឱ្យវិធីសាស្រ្តស្តង់ដារមាសសម្រាប់ការរុករកស៊ីជម្រៅនៃ DNA methylation ជាពិសេសទីតាំងទីប្រាំនៅក្នុង cytosine (5-mC) ដែលជានិយតករសំខាន់នៃការបញ្ចេញហ្សែន និងសកម្មភាពកោសិកា។ គោលការណ៍ជាមូលដ្ឋាននៃ WGBS ពាក់ព័ន្ធនឹងការព្យាបាល bisulfite ដែលជំរុញឱ្យមានការបំប្លែង cytosines unmethylated ទៅ uracil (C ទៅ U) ខណៈពេលដែលទុកឱ្យ methylated cytosines មិនផ្លាស់ប្តូរ។ បច្ចេកទេសនេះផ្តល់នូវដំណោះស្រាយមូលដ្ឋានតែមួយ ដែលអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកស្រាវជ្រាវធ្វើការស៊ើបអង្កេតយ៉ាងទូលំទូលាយអំពីមេទីលឡូម និងរកឃើញគំរូមេទីលមិនប្រក្រតីដែលទាក់ទងនឹងលក្ខខណ្ឌផ្សេងៗ ជាពិសេសមហារីក។ តាមរយៈការប្រើប្រាស់ WGBS អ្នកវិទ្យាសាស្ត្រអាចទទួលបានការយល់ដឹងដែលមិនអាចប្រៀបផ្ទឹមបានទៅលើទេសភាពមេទីលដែលធំទូលាយនៃហ្សែន ដោយផ្តល់នូវការយល់ដឹងយ៉ាងច្បាស់លាស់អំពីយន្តការអេពីតូហ្សែនដែលបង្កប់នូវដំណើរការជីវសាស្រ្តចម្រុះ និងជំងឺ។


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

ជីវព័ត៌មានវិទ្យា

លទ្ធផលសាកល្បង

ការបោះពុម្ពផ្សាយពិសេស

លក្ខណៈពិសេសសេវាកម្ម

● ទាមទារហ្សែនយោង។

● Lambda DNA ត្រូវបានបន្ថែមដើម្បីតាមដានប្រសិទ្ធភាពនៃការបំប្លែង bisulfite ។

● តម្រៀបនៅលើ Illumina NovaSeq ។

អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

ស្តង់ដារមាសសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវ DNA Methylation៖ បច្ចេកវិទ្យាដំណើរការបំប្លែងមេទីលចាស់ទុំនេះ មានភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់ និងអាចបន្តពូជបានល្អ។

ការគ្របដណ្តប់ធំទូលាយ និងដំណោះស្រាយមូលដ្ឋានតែមួយ៖ការរកឃើញទីតាំង methylation នៅកម្រិតហ្សែនធំទូលាយ។

វេទិកាពេញលេញ៖ផ្តល់សេវាកម្មល្អឥតខ្ចោះតែម្តង ចាប់ពីដំណើរការគំរូ ការសាងសង់បណ្ណាល័យ លំដាប់លំដោយ រហូតដល់ការវិភាគជីវព័ត៌មាន។

ជំនាញទូលំទូលាយ៖ ជាមួយនឹងគម្រោងលំដាប់ WGBS ត្រូវបានបញ្ចប់ដោយជោគជ័យលើប្រភេទសត្វចម្រុះ BMKGENE នាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាងមួយទសវត្សរ៍ ក្រុមវិភាគដែលមានជំនាញខ្ពស់ ខ្លឹមសារដ៏ទូលំទូលាយ និងការគាំទ្រក្រោយការលក់ដ៏ល្អ។

លទ្ធភាពចូលរួមជាមួយការវិភាគប្រតិចារិក៖ អនុញ្ញាតឱ្យមានការវិភាគរួមបញ្ចូលគ្នានៃ WGBS ជាមួយនឹងទិន្នន័យ omics ផ្សេងទៀតដូចជា RNA-seq ។

ការបញ្ជាក់គំរូ

បណ្ណាល័យ

យុទ្ធសាស្រ្តលំដាប់

ទិន្នផលទិន្នន័យដែលបានណែនាំ

ការត្រួតពិនិត្យគុណភាព

Bisulfite ព្យាបាល

Illumina PE150

ជម្រៅ 30x

Q30 ≥ 85%

ការបំប្លែង Bisulfite > 99%

តម្រូវការគំរូ

 

ការប្រមូលផ្តុំ (ng / μL)

បរិមាណសរុប (µg)

តម្រូវការបន្ថែម

DNA ហ្សែន

≥ ៥

≥ 400 ng

ការរិចរិលឬការចម្លងរោគមានកំណត់

លំហូរការងារសេវាកម្ម

ការចែកចាយគំរូ

ការចែកចាយគំរូ

ការពិសោធន៍សាកល្បង

ការទាញយក DNA

ការរៀបចំបណ្ណាល័យ

ការសាងសង់បណ្ណាល័យ

លំដាប់

លំដាប់

ការវិភាគទិន្នន័យ

ការវិភាគទិន្នន័យ

数据上传-០១

ការផ្តល់ទិន្នន័យ


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • 流程图羽4-01

    រួមបញ្ចូលការវិភាគដូចខាងក្រោមៈ

    ● ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពលំដាប់ឆៅ;

    ● ការធ្វើផែនទីដើម្បីយោងហ្សែន;

    ●ការរកឃើញនៃមូលដ្ឋាន methylated 5mC;

    ● ការវិភាគនៃការចែកចាយមេទីល និងចំណារពន្យល់;

    ● ការវិភាគនៃតំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល (DMRs);

    ● ចំណារពន្យល់មុខងារនៃហ្សែនដែលទាក់ទងនឹង DMRs ។

    ការរកឃើញមេទីល 5mC៖ ប្រភេទនៃទីតាំងមេទីល

     

    图片79

     

    ផែនទី Methylation ។ ការចែកចាយមេទីល 5mC ហ្សែនធំទូលាយ

     

    图片80

     

    ចំណារពន្យល់អំពីតំបន់ដែលមានជាតិមេទីលខ្ពស់។

    图片81

    តំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ហ្សែនដែលពាក់ព័ន្ធ

     

    图片82

     

    តំបន់មេទីលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ចំណារពន្យល់អំពីហ្សែនដែលពាក់ព័ន្ធ (ហ្សែន Ontology)

     

    图片 ៨៣

     

    ស្វែងរកភាពជឿនលឿននៃការស្រាវជ្រាវដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មតម្រៀបហ្សែនប៊ីស៊ុលហ្វីតទាំងមូលរបស់ BMKGene តាមរយៈបណ្តុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយ។

    អ្នកគាំទ្រ, Y. et al ។ (2020) 'ការវិភាគទម្រង់ DNA methylation កំឡុងពេលអភិវឌ្ឍសាច់ដុំគ្រោងឆ្អឹងរបស់ចៀម ដោយប្រើលំដាប់ហ្សែនទាំងមូល bisulfite',ហ្សែន BMC, ២១(១), ទំព័រ ១–១៥។ doi: 10.1186/S12864-020-6751-5 ។

    Zhao, X. et al ។ (2022) 'ការរំខានមេទីលអាស៊ីត deoxyribonucleic ប្រលោមលោកនៅក្នុងកម្មករដែលប៉ះពាល់នឹងក្លរួវីនីល',គីមីវិទ្យា និងសុខភាពឧស្សាហកម្ម, 38(7), ទំព័រ 377–388 ។ doi: 10.1177/07482337221098600

    Zuo, J. et al ។ (2020) 'ទំនាក់ទំនងរវាង genome methylation, កម្រិតនៃ RNAs ដែលមិនសរសេរកូដ, mRNAs និងសារធាតុរំលាយនៅក្នុងផ្លែប៉េងប៉ោះទុំ',ទិនានុប្បវត្តិរុក្ខជាតិ, 103(3), ទំព័រ 980–994 ។ doi: 10.1111/TPJ.14778 ។

    ទទួលបានសម្រង់

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖