BMKCloud Log in
条形 Banner-០៣

ផលិតផល

ពន្ធុវិទ្យាប្រៀបធៀប

ពន្ធុវិទ្យាប្រៀបធៀបមានន័យត្រង់ថាការប្រៀបធៀបលំដាប់ហ្សែនពេញលេញ និងរចនាសម្ព័ន្ធនៃប្រភេទផ្សេងៗគ្នា។វិន័យនេះមានគោលបំណងបង្ហាញពីការវិវត្តនៃប្រភេទសត្វ មុខងារហ្សែន យន្តការគ្រប់គ្រងហ្សែននៅកម្រិតហ្សែន ដោយកំណត់អត្តសញ្ញាណរចនាសម្ព័ន្ធលំដាប់ និងធាតុដែលបានអភិរក្ស ឬបែងចែកប្រភេទផ្សេងៗគ្នា។ការសិក្សាអំពីពន្ធុវិទ្យាប្រៀបធៀបធម្មតារួមមានការវិភាគនៅក្នុងគ្រួសារហ្សែន ការវិវត្តន៍វិវត្តន៍ ការចម្លងហ្សែនទាំងមូល សម្ពាធជ្រើសរើស។ល។


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

លទ្ធផលសាកល្បង

ករណី​សិក្សា

អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

១- ពន្ធុវិទ្យាប្រៀបធៀប

● កញ្ចប់វិភាគដ៏ទូលំទូលាយ ដែលមានការវិភាគចំនួនប្រាំបីដែលទាមទារជាទូទៅបំផុត។

● ភាពជឿជាក់ខ្ពស់ក្នុងការវិភាគជាមួយនឹងការបកស្រាយលម្អិត និងងាយយល់លើលទ្ធផល

● តួរលេខដែលត្រៀមរួចជាស្រេចដែលបានរចនាឡើងយ៉ាងល្អ

● ក្រុមជីវព័ត៌មានវិទ្យាដែលមានជំនាញខ្ពស់បំពេញតម្រូវការការវិភាគផ្ទាល់ខ្លួនចម្រុះ

● ពេលវេលាបង្វិលខ្លីជាង ជាមួយនឹងភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់ក្នុងការវិភាគ

● បទពិសោធន៍ដ៏សម្បូរបែបជាមួយនឹងករណីជោគជ័យជាង 90 ជាមួយនឹងកត្តាផលប៉ះពាល់ដែលបានបោះពុម្ពជាបន្តបន្ទាប់ជាង 900

លក្ខណៈបច្ចេកទេសនៃសេវាកម្ម

ពេលវេលាបង្វិលតាមការប៉ាន់ស្មាន

ចំនួនប្រភេទ

វិភាគ

30 ថ្ងៃធ្វើការ

៦ - ១២

ការចង្កោមគ្រួសារហ្សែន

ការពង្រីក និងបង្រួមគ្រួសារហ្សែន

ការសាងសង់ដើមឈើ Phylogenetic

ការប៉ាន់ប្រមាណពេលវេលាខុសគ្នា (តម្រូវឱ្យមានការក្រិតតាមខ្នាតហ្វូស៊ីល)

ពេលវេលាបញ្ចូល LTR (សម្រាប់រុក្ខជាតិ)

ការចម្លងហ្សែនទាំងមូល (សម្រាប់រុក្ខជាតិ)

សម្ពាធជ្រើសរើស

ការវិភាគសំយោគ

ការវិភាគជីវវិទ្យា

● គ្រួសារហ្សែន

● Phylogenetics

● ពេលវេលាខុសគ្នា

● សម្ពាធជ្រើសរើស

● ការវិភាគសំយោគ

流程图 ពន្ធុវិទ្យាប្រៀបធៀប

តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន

តម្រូវការគំរូ៖

ជាលិកា ឬ DNA សម្រាប់​លំដាប់​ហ្សែន និង​ការ​ផ្គុំ

សម្រាប់ជាលិកា

ប្រភេទសត្វ

ជាលិកា

ការស្ទង់មតិ

PacBio CCS

សត្វ

ជាលិកា visceral

0.5 ~ 1 ក្រាម។

≥ 3.5 ក្រាម។

ជាលិកាសាច់ដុំ

≥ 5.0 ក្រាម។

≥ 5.0 មីលីលីត្រ

ឈាមថនិកសត្វ

≥ 0.5 មីលីលីត្រ

ឈាមមាន់/ត្រី

រុក្ខជាតិ

ស្លឹកស្រស់

1 ~ 2 ក្រាម។

≥ 5.0 ក្រាម។

 

ផ្កា/ដើម

1 ~ 2 ក្រាម។

≥ 10.0 ក្រាម។

 

ឫស/គ្រាប់ពូជ

1 ~ 2 ក្រាម។

≥ 20.0 ក្រាម។

កោសិកា

កោសិកាវប្បធម៌

-

≥ 1 x 108

ទិន្នន័យ

ឯកសារលំដាប់ហ្សែន (.fasta) និងឯកសារចំណារពន្យល់ (.gff3) នៃប្រភេទសត្វដែលទាក់ទងយ៉ាងជិតស្និទ្ធ

លំហូរការងារសេវាកម្ម

គំរូ QC

ការរចនាពិសោធន៍

ការចែកចាយគំរូ

ការចែកចាយគំរូ

ការរៀបចំបណ្ណាល័យ

ការសាងសង់បណ្ណាល័យ

លំដាប់

លំដាប់

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

សេវាកម្មក្រោយពេលលក់

សេវាកម្មក្រោយពេលលក់


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • *លទ្ធផលសាកល្បងដែលបង្ហាញនៅទីនេះគឺសុទ្ធតែមកពីហ្សែនដែលបានបោះពុម្ពផ្សាយដោយ Biomarker Technologies

    1.LTR ការប៉ាន់ស្មានពេលវេលាបញ្ចូល៖ តួលេខនេះបង្ហាញពីការចែកចាយ bimodal តែមួយគត់នៅក្នុងពេលវេលាបញ្ចូល LTR-RTs នៅក្នុងហ្សែន Weining rye បើប្រៀបធៀបទៅនឹងប្រភេទសត្វដទៃទៀត។កំពូលភ្នំថ្មីបំផុតបានលេចឡើងប្រហែល 0.5 លានឆ្នាំមុន។

    3LTR-insertion-time-estimation-in-Weining-rye

    Li Guang et al ។ហ្សែនធម្មជាតិឆ្នាំ 2021

     

     

    2.Phylogeny និងការវិភាគគ្រួសារហ្សែនលើសត្វចាហួយ (Sechium edule): តាមរយៈការវិភាគរបស់ chayote និង 13 ប្រភេទផ្សេងទៀតដែលពាក់ព័ន្ធនៅក្នុងគ្រួសារហ្សែន Chayote ត្រូវបានគេរកឃើញថាមានទំនាក់ទំនងជិតស្និទ្ធបំផុតជាមួយពស់វែក (Trichosanthes anguina) ។ចាហួយបានមកពីពស់វែកនៅប្រហែល 27-45 Mya និងការចម្លងហ្សែនទាំងមូល (WGD) ត្រូវបានគេសង្កេតឃើញនៅក្នុង chayote ក្នុង 25±4 Mya ដែលជាព្រឹត្តិការណ៍ WGD ទីបីនៅក្នុង cucuibitaceae ។

    4 Phylogenetic-ដើមឈើ-នៃ-chayote

    Fu A et al ។ការស្រាវជ្រាវផ្នែកសាកវប្បកម្មឆ្នាំ 2021

     

     

    3.Synteny analysis: ហ្សែនមួយចំនួនដែលទាក់ទងនឹង phytohormones ក្នុងការវិវត្តន៍ផ្លែឈើ ត្រូវបានគេរកឃើញនៅក្នុង chayote, gourd និង squash ។ទំនាក់​ទំនង​រវាង​ចាហួយ​និង​កំពឹស​គឺ​ខ្ពស់​ជាង​បន្តិច​រវាង​ចាហួយ​និង​ពពែ​ពស់។

    4 Phylogenetic-ដើមឈើ-នៃ-chayote

    Fu A et al ។ការស្រាវជ្រាវផ្នែកសាកវប្បកម្មឆ្នាំ 2021

     

     

    4. ការវិភាគគ្រួសារហ្សែន៖ ការបង្កើន KEGG លើការពង្រីកគ្រួសារហ្សែន និងការកន្ត្រាក់នៅក្នុងហ្សែន G.thurberi និង G.davidsonii បានបង្ហាញថា ជីវសំយោគស្តេរ៉ូអ៊ីត និង brassinosteroid biosynthesis ដែលទាក់ទងនឹងហ្សែនត្រូវបានពង្រីក។

    4 Phylogenetic-ដើមឈើ-នៃ-chayote

    Yang Z et al ។ជីវវិទ្យា BMCឆ្នាំ 2021

     

     

    5.ការវិភាគការចម្លងហ្សែនទាំងមូល៖ ការវិភាគការបែងចែក 4DTV និង Ks បានបង្ហាញព្រឹត្តិការណ៍ចម្លងហ្សែនទាំងមូល។កំពូលនៃ intraspecies បានបង្ហាញពីព្រឹត្តិការណ៍ចម្លង។កំពូលនៃប្រភេទអន្តរប្រភេទបានបង្ហាញពីព្រឹត្តិការណ៍ជាក់លាក់។ការវិភាគបានបង្ហាញថាការប្រៀបធៀបជាមួយនឹងប្រភេទសត្វដែលទាក់ទងយ៉ាងជិតស្និទ្ធចំនួនបីផ្សេងទៀត O. europaea បានឆ្លងកាត់ការចម្លងហ្សែនទ្រង់ទ្រាយធំនាពេលថ្មីៗនេះ។

    4 Phylogenetic-ដើមឈើ-នៃ-chayote

    Rao G et al ។ការស្រាវជ្រាវផ្នែកសាកវប្បកម្មឆ្នាំ 2021

    ករណី BMK

    ផ្កាកុលាបដោយគ្មានស្នាមប្រេះ៖ ការយល់ដឹងអំពីហ្សែនដែលភ្ជាប់ទៅនឹងការបន្សាំសំណើម

    បោះពុម្ពផ្សាយ៖ ការពិនិត្យឡើងវិញវិទ្យាសាស្ត្រជាតិឆ្នាំ 2021

    យុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀប៖

    'Basye'sគ្មានបន្លា' (រ.Wichurainan) ហ្សែន៖
    ប្រហែល93 X PacBio + ប្រហាក់ប្រហែល។90 X Nanopore + 267 X Illumina

    លទ្ធផលសំខាន់

    1.ហ្សែនណូម R.wichuraiana ដែលមានគុណភាពខ្ពស់ត្រូវបានសាងសង់ដោយប្រើបច្ចេកទេសលំដាប់លំដោយដែលអានបានយូរ ដែលផ្តល់លទ្ធផលការជួបប្រជុំគ្នានៃ 530.07 Mb (ទំហំហ្សែនប៉ាន់ស្មានគឺប្រហែល 525.9 Mb ដោយ flow cytometry និង 525.5 ដោយការស្ទាបស្ទង់ហ្សែន។ ; Heterozygosity គឺនៅជុំវិញ 525.9 Mb ។ពិន្ទុប៉ាន់ស្មានរបស់ BUSCO គឺ 93.9% ។ប្រៀបធៀបជាមួយ "Old blush" (haploOB) គុណភាព និងភាពពេញលេញនៃហ្សែននេះត្រូវបានបញ្ជាក់ដោយភាពត្រឹមត្រូវមូលដ្ឋានតែមួយ និងសន្ទស្សន៍ការផ្គុំ LTR (LAI=20.03)។ហ្សែន R.wichuraiana មានហ្សែនសរសេរកូដប្រូតេអ៊ីន 32,674 ។

    2.Multi-omics ការវិភាគរួមគ្នា រួមមាន ពន្ធុវិទ្យាប្រៀបធៀប ការធ្វើត្រាប់តាម ការវិភាគ QTL នៃចំនួនប្រជាជនហ្សែន បានបង្ហាញឱ្យឃើញពីភាពជាក់លាក់ដ៏សំខាន់រវាង R. wichuraiana និង Rosa chinensis ។ដូចគ្នានេះផងដែរ, ការប្រែប្រួលនៃការបញ្ចេញមតិនៃហ្សែនដែលទាក់ទងនៅក្នុង QTL ទំនងជាត្រូវបានផ្សារភ្ជាប់ជាមួយនឹងលំនាំដើម។

    7KEGG-enrichment-on-gene-family-expansion-and-contraction

    ការវិភាគហ្សែនប្រៀបធៀបរវាង Basye;s Thornless និង Rosa chinensis រួមទាំងការវិភាគសំយោគ ចង្កោមគ្រួសារហ្សែន ការវិភាគការពង្រីក និងការកន្ត្រាក់ បានបង្ហាញនូវការប្រែប្រួលមួយចំនួនធំ ដែលទាក់ទងទៅនឹងលក្ខណៈសំខាន់ៗនៅក្នុងផ្កាកុលាប។ការពង្រីកតែមួយគត់នៅក្នុងគ្រួសារហ្សែន NAC និង FAR1/FRS ទំនងជាត្រូវបានផ្សារភ្ជាប់ជាមួយនឹងភាពធន់នឹងចំណុចខ្មៅ។

    81 ការប្រៀបធៀប-ហ្សែន-ការវិភាគ-រវាង-BT-និង-OB 82 ការប្រៀបធៀប-ហ្សែន-ការវិភាគ-រវាង-BT-និង-OB 83 ការប្រៀបធៀប-ហ្សែន-ការវិភាគ-រវាង-BT-និង-OB

    ការវិភាគហ្សែនប្រៀបធៀបរវាងហ្សែន BT និង haploOB ។

    ឯកសារយោង

    Zhong, M. , et al ។"ផ្កាកុលាបដោយគ្មានស្នាមប្រឡាក់៖ ការយល់ដឹងអំពីហ្សែនដែលភ្ជាប់ទៅនឹងការបន្សាំសំណើម"ការពិនិត្យឡើងវិញវិទ្យាសាស្ត្រជាតិ, 2021;, nwab092 ។

    ទទួលបានសម្រង់

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖