mRNA-seq (NGS) ជាមួយហ្សែនយោង
RNA-seq គឺជាឧបករណ៍ស្តង់ដារមួយនៅទូទាំងវិទ្យាសាស្ត្រជីវិត និងដំណាំ ដោយភ្ជាប់គម្លាតរវាងហ្សែន និងប្រូតេអូម។ ចំណុចខ្លាំងរបស់វាស្ថិតនៅក្នុងការរកឃើញប្រតិចារិកថ្មី និងវាស់បរិមាណការបញ្ចេញមតិរបស់វានៅក្នុងការវិភាគតែមួយ។ វាត្រូវបានគេប្រើយ៉ាងទូលំទូលាយសម្រាប់ការសិក្សាប្រតិចារិកប្រៀបធៀប ដោយបង្ហាញពីហ្សែនដែលទាក់ទងនឹងលក្ខណៈ ឬ phenotype ផ្សេងៗ ដូចជាការប្រៀបធៀប mutants ទៅនឹងប្រភេទធម្មជាតិ ឬការបង្ហាញការបញ្ចេញមតិហ្សែនក្រោមលក្ខខណ្ឌជាក់លាក់។ កម្មវិធី BMKCloud mRNA(Reference) រួមបញ្ចូលការវាស់បរិមាណការបញ្ចេញមតិ ការវិភាគការបញ្ចេញមតិឌីផេរ៉ង់ស្យែល (DEG) និងការវិភាគរចនាសម្ព័ន្ធលំដាប់ទៅក្នុងបំពង់ជីវព័ត៌មាន mRNA-seq(NGS) និងបញ្ចូលគ្នានូវចំណុចខ្លាំងនៃកម្មវិធីស្រដៀងគ្នា ដោយធានាបាននូវភាពងាយស្រួល និងភាពងាយស្រួលប្រើប្រាស់។ អ្នកប្រើប្រាស់អាចផ្ទុកឡើងទិន្នន័យ RNA-seq របស់ពួកគេទៅកាន់ cloud ដែលកម្មវិធីនេះផ្តល់ជូននូវដំណោះស្រាយវិភាគជីវព័ត៌មានដ៏ទូលំទូលាយ និងតែមួយគត់។ លើសពីនេះ វាផ្តល់អាទិភាពដល់បទពិសោធន៍របស់អតិថិជន ដោយផ្តល់ជូននូវប្រតិបត្តិការផ្ទាល់ខ្លួនដែលត្រូវបានរៀបចំតាមតម្រូវការជាក់លាក់របស់អ្នកប្រើប្រាស់។ អ្នកប្រើប្រាស់អាចកំណត់ប៉ារ៉ាម៉ែត្រ និងដាក់ស្នើបេសកកម្មបំពង់បង្ហូរទិន្នន័យដោយខ្លួនឯង ពិនិត្យមើលរបាយការណ៍អន្តរកម្ម មើលទិន្នន័យ/ដ្យាក្រាម និងបំពេញការជីកយករ៉ែទិន្នន័យ ដូចជា៖ ការជ្រើសរើសហ្សែនគោលដៅ ការដាក់ជាក្រុមមុខងារ ការធ្វើដ្យាក្រាម។ល។
វេទិកា៖អ៊ីលមូណា, MGI
យុទ្ធសាស្ត្រ៖RNA-Seq
ប្លង់: ទិន្នន័យស្អាតបាត និងស្របគ្នា។
ប្រភេទបណ្ណាល័យ៖fr-unstranded, fr-firststrand ឬ fr-secondstrand
ប្រវែងអាន៖១៥០ ប៊ីប
ប្រភេទឯកសារ៖*.fastq, *.fq, *.fastq.gz ឬ *.fq.gz។ ប្រព័ន្ធនឹងផ្គូផ្គងឯកសារ .fastq ដោយស្វ័យប្រវត្តិទៅតាមឈ្មោះឯកសាររបស់ពួកគេ,ឧទាហរណ៍ *_1.fastq ផ្គូផ្គងជាមួយ *._2.fastq។
ចំនួនគំរូ៖មិនមានការរឹតបន្តឹងលើចំនួនទេនៃសំណាក ប៉ុន្តែពេលវេលាវិភាគនឹងកើនឡើងតាមចំនួនគំរូកំពុងលូតលាស់។
បរិមាណទិន្នន័យដែលបានណែនាំ៖៦ក្រាម ក្នុងមួយគំរូ
