Long Non-coding Sequencing-Illumina
អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម
●ការវិភាគរួមនៃ mRNA និង lncRNA៖ ដោយរួមបញ្ចូលគ្នានូវបរិមាណនៃប្រតិចារឹក mRNA ជាមួយនឹងការសិក្សាអំពី lncRNA និងគោលដៅរបស់ពួកគេ វាអាចទៅរួចដើម្បីទទួលបានទិដ្ឋភាពទូទៅស៊ីជម្រៅនៃយន្តការបទប្បញ្ញត្តិដែលស្ថិតនៅក្រោមការឆ្លើយតបរបស់កោសិកា។
●ជំនាញទូលំទូលាយ៖ យើងបានដំណើរការគំរូជាង 230,000 ដែលលាតសន្ធឹងនូវគំរូចម្រុះ និងគោលបំណងរបស់គម្រោង។ យើងនាំមកនូវភាពសម្បូរបែបនៃជំនាញដល់គ្រប់គម្រោង។
●ការវិភាគរួមនៃ mRNA និង lncRNA៖ យើងរួមបញ្ចូលគ្នានូវបរិមាណនៃប្រតិចារឹក mRNA ជាមួយនឹងការសិក្សាអំពី lncRNA និងគោលដៅរបស់ពួកគេ ដែលធ្វើឱ្យវាអាចទទួលបានទិដ្ឋភាពទូទៅស៊ីជម្រៅនៃយន្តការបទប្បញ្ញត្តិដែលស្ថិតនៅក្រោមការឆ្លើយតបរបស់កោសិកា។
●ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពយ៉ាងម៉ត់ចត់៖ យើងអនុវត្តចំណុចត្រួតពិនិត្យស្នូលនៅគ្រប់ដំណាក់កាលទាំងអស់ ចាប់ពីការរៀបចំគំរូរហូតដល់ការរៀបចំបណ្ណាល័យ លំដាប់លំដោយ និងជីវព័ត៌មានវិទ្យា។ ការត្រួតពិនិត្យយ៉ាងម៉ត់ចត់របស់យើងធានាបាននូវលទ្ធផលដែលមានគុណភាពខ្ពស់ជាប់លាប់។
●ចំណារពន្យល់ទូលំទូលាយ៖ យើងប្រើមូលដ្ឋានទិន្នន័យច្រើនដើម្បីកត់ចំណាំមុខងារនៃហ្សែនដែលបង្ហាញដោយឌីផេរ៉ង់ស្យែល (DEGs) និងធ្វើការវិភាគការពង្រឹងដែលត្រូវគ្នា។ វិធីសាស្រ្តដ៏ទូលំទូលាយនេះផ្តល់នូវការយល់ដឹងអំពីដំណើរការកោសិកា និងម៉ូលេគុលដែលស្ថិតនៅក្រោមការឆ្លើយតបរបស់ប្រតិចារិក ដោយធានាថាអ្នកទទួលបានព័ត៌មានទាំងអស់ដែលអាចធ្វើទៅបានអំពីទិន្នន័យពិសោធន៍របស់អ្នក។
●ការគាំទ្រក្រោយការលក់៖ យើងយល់ពីសារៈសំខាន់នៃការមានវត្តមាន នោះហើយជាមូលហេតុដែលការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងលើសពីការបញ្ចប់គម្រោងជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មក្រោយការលក់រយៈពេល 3 ខែ។ ក្នុងអំឡុងពេលនេះ យើងផ្តល់ជូននូវការតាមដានគម្រោង ជំនួយដោះស្រាយបញ្ហា និងវគ្គ Q&A ដើម្បីដោះស្រាយរាល់សំណួរដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។
តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន
| បណ្ណាល័យ | វេទិកា | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ | ទិន្នន័យ QC |
| rRNA បាត់បង់បណ្ណាល័យទិសដៅ | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
នុយក្លេអូទីត៖
| Conc.(ng/μl) | បរិមាណ (μg) | ភាពបរិសុទ្ធ | សុចរិតភាព |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 មានកំណត់ ឬគ្មានការចម្លងរោគ DNA បង្ហាញនៅលើជែល។ | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; កម្រិតមូលដ្ឋាន ឬគ្មានការលើកឡើង |
● រុក្ខជាតិ៖
ឫស ដើម ឬផ្កាៈ ៤៥០ មីលីក្រាម
ស្លឹកឬគ្រាប់៖ ៣០០ មីលីក្រាម
ផ្លែឈើ៖ ១,២ ក្រាម។
●សត្វ៖
បេះដូង ឬពោះវៀន៖ ៤៥០ មីលីក្រាម
Viscera ឬ Brain: 240 mg
សាច់ដុំ៖ ៦០០ មីលីក្រាម
ឆ្អឹង សក់ ឬស្បែក៖ ១,៥ ក្រាម។
● Arthropods៖
សត្វល្អិត៖ ៩ ក្រាម។
Crustacea: 450 មីលីក្រាម
● ឈាមទាំងមូល៖2 បំពង់
● កោសិកា: 106 កោសិកា
● សេរ៉ូម និងប្លាស្មា: 6 មីលីលីត្រ
ការចែកចាយគំរូដែលបានណែនាំ
កុងតឺន័រ: បំពង់ centrifuge 2 មីលីលីត្រ (ក្រដាសសំណប៉ាហាំងមិនត្រូវបានណែនាំទេ)
ការដាក់ស្លាកគំរូ៖ ក្រុម + ចម្លងឧទាហរណ៍ A1, A2, A3; B1, B2, B3 ។
ការដឹកជញ្ជូន៖
1. ទឹកកកស្ងួត៖ គំរូត្រូវវេចខ្ចប់ក្នុងថង់ ហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។
2. បំពង់ RNAstable: សំណាក RNA អាចត្រូវបានស្ងួតនៅក្នុងបំពង់ស្ថេរភាព RNA (ឧ. RNAstable®) និងដឹកជញ្ជូនក្នុងសីតុណ្ហភាពបន្ទប់។
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការរចនាពិសោធន៍
ការចែកចាយគំរូ
ការទាញយក RNA
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
ជីវព័ត៌មានវិទ្យា
- ទិន្នន័យឆៅ
- ទិន្នន័យ QC
- ការតម្រឹមហ្សែន
- រចនាសម្ព័ន្ធហ្សែន (ការភ្ជាប់ជម្មើសជំនួស ការបង្កើនប្រសិទ្ធភាពរចនាសម្ព័ន្ធហ្សែន និងការព្យាករណ៍ហ្សែនប្រលោមលោក)
- បរិមាណនៃការបញ្ចេញហ្សែន
- ការវិភាគការបញ្ចេញមតិឌីផេរ៉ង់ស្យែល
- ចំណារពន្យល់ DEG និងការពង្រឹង + ឌីផេរ៉ង់ស្យែលបានបង្ហាញពីហ្សែនគោលដៅ lncRNA
- ការកំណត់អត្តសញ្ញាណប្រតិចារិក
- ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ lncRNA (ការអភិរក្ស lncRNA និង lncRNA ដែលគេស្គាល់)
- ការព្យាករណ៍ហ្សែនគោលដៅ lncRNA
- បរិមាណកន្សោម lncRNA
- ការវិភាគរួមគ្នាជាមួយទិន្នន័យ mRNA
ការវិភាគហ្សែនឌីផេរ៉ង់ស្យែល (DEGs)
បរិមាណនៃការបញ្ចេញមតិ lncRNA - ចង្កោម
ការពង្រឹងហ្សែនគោលដៅ lncRNA
ការវិភាគទីតាំង mRNA និង lncRNA រួម - គ្រោង Circos (រង្វង់កណ្តាលគឺ mRNA និង cicrlce ខាងក្នុងគឺ lncRNA)
ស្វែងរកភាពជឿនលឿនដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្ម equing lncRNA របស់ BMKGene តាមរយៈបណ្តុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយ។
Ji, H. et al ។ (2020) 'ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ ការព្យាករណ៍មុខងារ និងការផ្ទៀងផ្ទាត់ lncRNA គន្លឹះនៃ lncRNAs ទាក់ទងនឹងស្ត្រេសត្រជាក់នៅក្នុងថ្លើមកណ្តុរ',របាយការណ៍វិទ្យាសាស្ត្រឆ្នាំ ២០២០ ១០:១, ១០(១), ទំព័រ ១–១៤។ doi: 10.1038/s41598-020-57451-7 ។
Jia, Z. et al ។ (2021) 'ការវិភាគប្រតិចារិករួមបញ្ចូលគ្នាបង្ហាញពីយន្តការភាពស៊ាំសម្រាប់ CyHV-3-Resistant Common Strain',ព្រំដែននៅក្នុង Immunology, 12, ទំ។ 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX។
Wang, XJ et al ។ (2022) 'ការផ្តល់អាទិភាពលើការរួមបញ្ចូលពហុ Omics នៃបណ្តាញបទប្បញ្ញត្តិ RNA Endogenous ប្រកួតប្រជែងក្នុងមហារីកសួតកោសិកាតូច៖ លក្ខណៈម៉ូលេគុល និងបេក្ខជនឱសថ',ព្រំដែននៃជំងឺមហារីក, 12, ទំ។ 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX ។
Xiao, L. et al ។ (ឆ្នាំ 2020) 'ការបំបែកហ្សែននៃបណ្តាញរួមផ្សំហ្សែនដែលសំយោគរស្មីសំយោគនៅក្នុង Populus',ទិនានុប្បវត្តិជីវបច្ចេកវិទ្យារុក្ខជាតិ, 18(4), ទំព័រ 1015–1026 ។ doi: 10.1111/PBI.13270 ។
Zheng, H. et al ។ (2022) 'បណ្តាញនិយតកម្មសកលសម្រាប់ការបញ្ចេញហ្សែនដែលគ្រប់គ្រងដោយភាពមិនប្រក្រតី និងសញ្ញានៃការរំលាយអាហារខុសប្រក្រតីនៅក្នុងកោសិកាភាពស៊ាំក្នុងមីក្រូបរិស្ថាននៃជំងឺផ្នូរ និងជំងឺក្រពេញទីរ៉ូអ៊ីតរបស់ Hashimoto',ព្រំដែននៅក្នុង Immunology, 13, ទំ។ 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX។
