បាក់តេរីពេញលេញហ្សែន
អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម
● យុទ្ធសាស្រ្តបន្តបន្ទាប់គ្នាជាច្រើនដែលមានសម្រាប់គោលដៅស្រាវជ្រាវផ្សេងៗគ្នា
● មេរោគបាក់តេរីពេញលេញជាមួយនឹង 0 Gap ធានា។
● មានបទពិសោធន៍ខ្ពស់ក្នុងការប្រមូលផ្តុំហ្សែនរបស់បាក់តេរី ជាមួយនឹងការប្រមូលផ្តុំហ្សែនពេញលេញជាង 10,000 ។
● ក្រុមគាំទ្របច្ចេកទេសបន្ទាប់ពីការលក់ប្រកបដោយវិជ្ជាជីវៈដែលបំពេញតម្រូវការស្រាវជ្រាវជាក់លាក់បន្ថែមទៀត។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសនៃសេវាកម្ម
| លំដាប់យុទ្ធសាស្ត្រ | បណ្ណាល័យ | ធានាគុណភាព | ពេលវេលាបង្វិលតាមការប៉ាន់ស្មាន |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | ណាណូប៉ូ 20K PE150 | 0 គម្លាត | 30 ថ្ងៃ។ |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
ការវិភាគជីវវិទ្យា
● ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យឆៅ
● ការជួបប្រជុំហ្សែន
● ការវិភាគសមាសធាតុហ្សែន
● ចំណារពន្យល់អំពីមុខងារហ្សែន
● ការវិភាគហ្សែនប្រៀបធៀប
តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន
តម្រូវការគំរូ៖
សម្រាប់ការដកស្រង់ DNA:
| ប្រភេទគំរូ | ចំនួនទឹកប្រាក់ | ការប្រមូលផ្តុំ | ភាពបរិសុទ្ធ |
| ការដកស្រង់ DNA | 2 μg | 20 ng / μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
សម្រាប់គំរូជាលិកា៖
| ប្រភេទគំរូ | ការព្យាបាលគំរូដែលបានណែនាំ | ការផ្ទុកគំរូនិងការដឹកជញ្ជូន |
| បាក់តេរី | សង្កេតមើលបាក់តេរីនៅក្រោមមីក្រូទស្សន៍ និងប្រមូលបាក់តេរីក្នុងដំណាក់កាលអិចស្ប៉ូណង់ស្យែលរបស់វា។ ផ្ទេរវប្បធម៌បាក់តេរី (ដែលមានកោសិកាប្រហែល 3-4.5e9) ចូលទៅក្នុង eppendorf 1.5 ឬ 2 មីលីលីត្រ។(រក្សាលើទឹកកក) ច្របាច់បំពង់រយៈពេល 1 នាទីក្នុងកម្រិត 14000 ក្រាម ដើម្បីប្រមូលបាក់តេរី និងយកសារធាតុ supernatant ចេញដោយប្រុងប្រយ័ត្ន។ បិទបំពង់ និងបង្កកបាក់តេរីក្នុងអាសូតរាវយ៉ាងហោចណាស់ 30 នាទី។ទុកបំពង់ក្នុងទូរទឹកកក -80 ℃។ | បង្កកសំណាកក្នុងអាសូតរាវរយៈពេល 3-4 ម៉ោង ហើយរក្សាទុកក្នុងអាសូតរាវ ឬ -80 ដឺក្រេ ដល់ការកក់រយៈពេលយូរ។ការដឹកជញ្ជូនគំរូជាមួយទឹកកកស្ងួតត្រូវបានទាមទារ។ |
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការចែកចាយគំរូ
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
1.Circos នៃ genome បាក់តេរី
2.Coding ការព្យាករណ៍ហ្សែន
ការវិភាគហ្សែនប្រៀបធៀប៖ មែកធាង phylogenetic
