ផែនទីកំដៅ
ឧបករណ៍ Heatmap ទទួលយកឯកសារទិន្នន័យម៉ាទ្រីសជាការបញ្ចូល ហើយអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកប្រើប្រាស់ច្រោះ ធ្វើឱ្យមានលក្ខណៈធម្មតា និងដាក់ជាក្រុមទិន្នន័យ។ ករណីប្រើប្រាស់ចម្បងសម្រាប់ heatmaps គឺការវិភាគចង្កោមនៃកម្រិតការបញ្ចេញហ្សែនរវាងគំរូផ្សេងៗគ្នា។
ចំណារពន្យល់ហ្សែន
ឧបករណ៍ Gene Annotation អនុវត្តការបញ្ចូលហ្សែនដោយផ្អែកលើការតម្រឹមលំដាប់នៃឯកសារ FASTA ដែលបានបញ្ចូលទល់នឹងមូលដ្ឋានទិន្នន័យផ្សេងៗ។
ឧបករណ៍ស្វែងរកការតម្រឹមមូលដ្ឋានមូលដ្ឋាន (BLAST)
ឧបករណ៍ BLAST គឺជាកំណែរួមបញ្ចូលគ្នារបស់ BMKCloud របស់ NCBI BLAST ហើយអាចត្រូវបានប្រើដើម្បីអនុវត្តមុខងារដូចគ្នាដោយប្រើទិន្នន័យដែលបានផ្ទុកឡើងទៅក្នុងគណនី BMKCloud។
ការព្យាករណ៍ CDS_UTR
ឧបករណ៍ព្យាករណ៍ CDS_UTR ត្រូវបានរចនាឡើងដើម្បីព្យាករណ៍តំបន់សរសេរកូដ (CDS) និងតំបន់មិនសរសេរកូដ (UTR) នៅក្នុងលំដាប់ប្រតិចារិកដែលបានផ្តល់ឱ្យដោយផ្អែកលើលទ្ធផល BLAST ទល់នឹងមូលដ្ឋានទិន្នន័យប្រូតេអ៊ីនដែលគេស្គាល់ និងលទ្ធផលនៃការព្យាករណ៍ ORF។
ដីឡូត៍ម៉ាន់ហាតាន់
ឧបករណ៍ Manhattan Plot អាចឱ្យបង្ហាញការពិសោធន៍គំរូខ្ពស់ ហើយត្រូវបានគេប្រើជាទូទៅនៅក្នុងការសិក្សាអំពីសមាគមទូទាំងហ្សែន (GWAS)។
ដ្យាក្រាមសៀក
ឧបករណ៍ដ្យាក្រាម CIRCOS ផ្តល់នូវការមើលឃើញប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាពអំពីរបៀបដែលលក្ខណៈពិសេសហ្សែនត្រូវបានចែកចាយពាសពេញហ្សែន។ លក្ខណៈពិសេសទូទៅរួមមាន ទីតាំងបរិមាណ SNPs InDels វ៉ារ្យ៉ង់រចនាសម្ព័ន្ធ និងចំនួនចម្លង។
ការបង្កើនភាពសម្បូរបែបនៃហ្សែន (GO)
ឧបករណ៍ GO Enrichment ផ្តល់នូវការវិភាគមុខងារបង្កើនប្រសិទ្ធភាព។ កម្មវិធីចម្បងនៅក្នុងឧបករណ៍នេះគឺកញ្ចប់ TopGO-Bioconductor ដែលរួមមានការវិភាគការបញ្ចេញមតិឌីផេរ៉ង់ស្យែល ការវិភាគ GO enrichment និងការមើលឃើញលទ្ធផល។
ការវិភាគបណ្តាញសហការបញ្ចេញហ្សែនដែលមានទម្ងន់ (WGCNA)
WGCNA គឺជាវិធីសាស្ត្រជីកយកទិន្នន័យដែលប្រើប្រាស់យ៉ាងទូលំទូលាយសម្រាប់ស្វែងរកម៉ូឌុលសហបញ្ចេញហ្សែន។ វាអាចអនុវត្តបានចំពោះសំណុំទិន្នន័យបញ្ចេញមតិផ្សេងៗ រួមទាំងទិន្នន័យមីក្រូអារេ និងការបញ្ចេញមតិហ្សែន NGS។
អ៊ីនធឺប្រូស្កេន
ឧបករណ៍ InterProScan ផ្តល់នូវការវិភាគ និងចាត់ថ្នាក់លំដាប់ប្រូតេអ៊ីន InterPro។
បង្កើនគុណភាពអាហារ GO KEGG
ឧបករណ៍ GO KEGG Enrichment ត្រូវបានរចនាឡើងដើម្បីបង្កើតអ៊ីស្តូក្រាម GO enrichment អ៊ីស្តូក្រាម KEGG enrichment និងផ្លូវ KEGG enrichment ដោយផ្អែកលើសំណុំហ្សែនដែលបានផ្តល់ជូន និងចំណារពន្យល់ដែលត្រូវគ្នា។
