ផែនទីកំដៅ
ឯកសារទិន្នន័យម៉ាទ្រីសត្រូវបានប្រើសម្រាប់ការគូរផែនទីកំដៅ ដែលអាចត្រង ធ្វើឱ្យធម្មតា និងទិន្នន័យម៉ាទ្រីសចង្កោម។វាភាគច្រើនត្រូវបានប្រើសម្រាប់ការវិភាគចង្កោមនៃកម្រិតនៃការបញ្ចេញហ្សែនរវាងគំរូផ្សេងៗគ្នា។
ចំណារពន្យល់ហ្សែន
ចំណារពន្យល់មុខងារហ្សែនត្រូវបានអនុវត្តដោយការគូសផែនទីលំដាប់លំដោយនៅក្នុងឯកសារ FASTA ប្រឆាំងនឹងមូលដ្ឋានទិន្នន័យផ្សេងៗ។
ចំណារពន្យល់ហ្សែន
ឧបករណ៍ស្វែងរកតម្រឹមមូលដ្ឋានមូលដ្ឋាន
CDS_UTR_ការទស្សន៍ទាយ
ឧបករណ៍នេះត្រូវបានរចនាឡើងដើម្បីទស្សន៍ទាយតំបន់សរសេរកូដ (CDS) និងតំបន់មិនសរសេរកូដ (UTR) នៅក្នុងលំដាប់ប្រតិចារិកដែលបានផ្តល់ឱ្យដោយផ្អែកលើការបំផ្ទុះប្រឆាំងនឹងមូលដ្ឋានទិន្នន័យប្រូតេអ៊ីនដែលគេស្គាល់ និងការព្យាករណ៍ ORF ។
គម្រោង Manhattan
គ្រោង Manhattan អនុញ្ញាតឱ្យបង្ហាញទិន្នន័យជាមួយនឹងចំណុចទិន្នន័យមួយចំនួនធំ។វាត្រូវបានគេប្រើជាទូទៅក្នុងការសិក្សាអំពីទំនាក់ទំនងទូលំទូលាយហ្សែន (GWAS)។
សៀក
ដ្យាក្រាម CIRCOS អនុញ្ញាតការបង្ហាញដោយផ្ទាល់នៃការចែកចាយ SNP, InDeL, SV, CNV លើហ្សែន។
GO_ពង្រឹង
TopGO គឺជាឧបករណ៍ដែលត្រូវបានរចនាឡើងសម្រាប់ការពង្រឹងមុខងារ។កញ្ចប់ TopGO-Bioconductor មានការវិភាគកន្សោមឌីផេរ៉ង់ស្យែល ការវិភាគការពង្រឹង GO និងការមើលឃើញលទ្ធផល។វានឹងបង្កើតថតឯកសារដែលមានលទ្ធផលឈ្មោះ "ក្រាហ្វ" ដែលមានលទ្ធផលសម្រាប់ topGO_BP, topGO_CC និង topGO_MF ។
WGCNA
WGCNA គឺជាវិធីសាស្រ្តរុករកទិន្នន័យដែលត្រូវបានប្រើប្រាស់យ៉ាងទូលំទូលាយសម្រាប់ការស្វែងរកម៉ូឌុលរួមនៃហ្សែនវាអាចអនុវត្តបានចំពោះសំណុំទិន្នន័យកន្សោមផ្សេងៗ រួមទាំងទិន្នន័យមីក្រូអារេ និងទិន្នន័យកន្សោមហ្សែនដែលមានប្រភពមកពីលំដាប់ជំនាន់ក្រោយ។
InterProScan
ការវិភាគ និងចំណាត់ថ្នាក់ប្រូតេអ៊ីន InterPro
GO_KEGG_ពង្រឹង
ឧបករណ៍នេះត្រូវបានរចនាឡើងដើម្បីបង្កើត GO enrichment histogram, KEGG enrichment histogram និង KEGG enrichment pathway ដោយផ្អែកលើសំណុំហ្សែនដែលបានផ្តល់ និងចំណារពន្យល់ដែលត្រូវគ្នា។