លំដាប់ CircRNA-Illumina
លក្ខណៈពិសេស
● ការថយចុះ rRNA អមដោយការរៀបចំបណ្ណាល័យតាមទិសដៅ បើកដំណើរការទិន្នន័យលំដាប់លំដោយដែលមានលក្ខណៈជាក់លាក់។
● លំហូរការងារជីវព័ត៌មានអាចឱ្យការព្យាករណ៍ circRNA និងបរិមាណការបញ្ចេញមតិ
អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម
●បណ្ណាល័យ RNA កាន់តែទូលំទូលាយ៖យើងប្រើ rRNA depletion ជំនួសឱ្យការ depletion RNA លីនេអ៊ែរក្នុងការរៀបចំមុនបណ្ណាល័យរបស់យើង ដោយធានាថាទិន្នន័យលំដាប់លំដោយរួមបញ្ចូលមិនត្រឹមតែ circRNA ប៉ុណ្ណោះទេប៉ុន្តែក៏មាន mRNA និង lncRNA ផងដែរ ដែលអនុញ្ញាតឱ្យមានការវិភាគរួមគ្នាលើសំណុំទិន្នន័យទាំងនេះ។
●ការវិភាគជាជម្រើសនៃបណ្តាញ RNA endogenous (ceRNA) ប្រកួតប្រជែង៖ ផ្តល់ការយល់ដឹងកាន់តែស៊ីជម្រៅអំពីយន្តការគ្រប់គ្រងកោសិកា
●ជំនាញទូលំទូលាយ: ជាមួយនឹងកំណត់ត្រានៃដំណើរការគំរូជាង 20,000 នៅ BMK ដែលលាតសន្ធឹងលើប្រភេទគំរូចម្រុះ និងគម្រោង lncRNA ក្រុមការងាររបស់យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គ្រប់គម្រោង។
●ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពយ៉ាងម៉ត់ចត់៖ យើងអនុវត្តចំណុចត្រួតពិនិត្យស្នូលនៅគ្រប់ដំណាក់កាលទាំងអស់ ចាប់ពីការរៀបចំគំរូ និងបណ្ណាល័យ រហូតដល់ការចាត់ថ្នាក់ និងជីវព័ត៌មានវិទ្យា។ការត្រួតពិនិត្យយ៉ាងម៉ត់ចត់នេះធានាបាននូវលទ្ធផលដែលមានគុណភាពខ្ពស់ជាប់លាប់។
● ការគាំទ្រក្រោយការលក់៖ ការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងលើសពីការបញ្ចប់គម្រោងជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មក្រោយការលក់រយៈពេល 3 ខែ។ក្នុងអំឡុងពេលនេះ យើងផ្តល់ជូននូវការតាមដានគម្រោង ជំនួយដោះស្រាយបញ្ហា និងវគ្គ Q&A ដើម្បីដោះស្រាយរាល់សំណួរដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។
តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន
| បណ្ណាល័យ | វេទិកា | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ | ទិន្នន័យ QC |
| Poly A សំបូរទៅដោយ | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
តម្រូវការគំរូ៖
នុយក្លេអូទីត៖
| Conc.(ng/μl) | បរិមាណ (μg) | ភាពបរិសុទ្ធ | សុចរិតភាព |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 មានកំណត់ ឬគ្មានការចម្លងរោគ DNA បង្ហាញនៅលើជែល។ | សម្រាប់រុក្ខជាតិ៖ RIN≥6.5; សម្រាប់សត្វ៖ RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; កម្រិតមូលដ្ឋាន ឬគ្មានការលើកឡើង |
● រុក្ខជាតិ៖
ឫស ដើម ឬផ្កាៈ ៤៥០ មីលីក្រាម
ស្លឹកឬគ្រាប់៖ ៣០០ មីលីក្រាម
ផ្លែឈើ៖ ១,២ ក្រាម។
●សត្វ៖
បេះដូង ឬពោះវៀន៖ ៤៥០ មីលីក្រាម
Viscera ឬ Brain: 240 mg
សាច់ដុំ៖ ៦០០ មីលីក្រាម
ឆ្អឹង សក់ ឬស្បែក៖ ១,៥ ក្រាម។
● Arthropods៖
សត្វល្អិត៖ ៩ ក្រាម។
Crustacea: 450 មីលីក្រាម
● ឈាមទាំងមូល៖2 បំពង់
● ក្រឡា៖ 106 កោសិកា
● សេរ៉ូម និងប្លាស្មា: 6 មីលីលីត្រ
ការចែកចាយគំរូដែលបានណែនាំ
កុងតឺន័រ: បំពង់ centrifuge 2 មីលីលីត្រ (ក្រដាសសំណប៉ាហាំងមិនត្រូវបានណែនាំទេ)
ការដាក់ស្លាកគំរូ៖ ក្រុម + ចម្លងឧទាហរណ៍ A1, A2, A3;B1, B2, B3 ......
ការដឹកជញ្ជូន៖
1. ទឹកកកស្ងួត៖ គំរូត្រូវវេចខ្ចប់ក្នុងថង់ ហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។
2. បំពង់ RNAstable: សំណាក RNA អាចត្រូវបានស្ងួតនៅក្នុងបំពង់ស្ថេរភាព RNA (ឧ. RNAstable®) និងដឹកជញ្ជូនក្នុងសីតុណ្ហភាពបន្ទប់។
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការរចនាពិសោធន៍
ការចែកចាយគំរូ
ការទាញយក RNA
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
ជីវព័ត៌មានវិទ្យា
ការព្យាករណ៍ circRNA: ការចែកចាយក្រូម៉ូសូម
ឌីផេរ៉ង់ស្យែល circRNAs - គ្រោងភ្នំភ្លើង
ឌីផេរ៉ង់ស្យែល circRNAs - ចង្កោមឋានានុក្រម
ការពង្រឹងមុខងារនៃហ្សែនម៉ាស៊ីនរបស់ circRNA
ស្វែងយល់ពីភាពជឿនលឿននៃការស្រាវជ្រាវដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មតម្រៀប circRNA របស់ BMKGene តាមរយៈបណ្តុំនៃការបោះពុម្ពដែលបានរៀបចំ។
Wang, X. et al ។(2021) 'CPSF4 ធ្វើនិយ័តកម្មការបង្កើត circRNA និង microRNA ដែលសម្របសម្រួលហ្សែនស្ងាត់នៅក្នុងមហារីកថ្លើម', Oncogene 2021 40:25, 40(25), ទំព័រ 4338–4351។doi: 10.1038/s41388-021-01867-6 ។
Xia, K. et al ។(2023) 'X oo-responsive transcriptome បង្ហាញពីតួនាទីរបស់រង្វង់ RNA133 ក្នុងភាពធន់នឹងជំងឺដោយធ្វើនិយ័តកម្មការបញ្ចេញមតិរបស់ OsARAB នៅក្នុងស្រូវ', Phytopathology Research, 5(1), ទំព័រ 1-14។doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al ។(2023) 'CPSF3 កែប្រែសមតុល្យនៃប្រតិចារឹករាងជារង្វង់ និងលីនេអ៊ែរនៅក្នុងមហារីកថ្លើម'។doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al ។(2023) 'ការវាយតម្លៃទូលំទូលាយនៃ circRNAs ក្នុងជំងឺក្រិនថ្លើមមុន និងក្រោយការប្តូរថ្លើម', International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
