ការធ្វើលំដាប់ CircRNA-Illumina
លក្ខណៈពិសេស
● ការថយចុះ rRNA បន្តដោយការរៀបចំបណ្ណាល័យទិសដៅ ដែលអនុញ្ញាតឱ្យមានទិន្នន័យលំដាប់ជាក់លាក់នៃខ្សែ។
● លំហូរការងារជីវព័ត៌មានវិទ្យាអាចឱ្យមានការទស្សន៍ទាយ circRNA និងការវាស់បរិមាណការបញ្ចេញមតិ។
គុណសម្បត្តិសេវាកម្ម
●ជំនាញទូលំទូលាយយើងបានដំណើរការសំណាកជាង 20,000 ដែលគ្របដណ្តប់លើប្រភេទសំណាកចម្រុះ យើងនាំមកនូវជំនាញជាច្រើនដល់គ្រប់គម្រោងទាំងអស់។
●ការគ្រប់គ្រងគុណភាពយ៉ាងម៉ត់ចត់យើងអនុវត្តចំណុចត្រួតពិនិត្យស្នូលនៅគ្រប់ដំណាក់កាលទាំងអស់ ចាប់ពីការរៀបចំគំរូរហូតដល់ការរៀបចំបណ្ណាល័យ ការរៀបចំលំដាប់ និងជីវព័ត៌មានវិទ្យា។ ការត្រួតពិនិត្យយ៉ាងហ្មត់ចត់របស់យើងធានានូវការផ្តល់លទ្ធផលដែលមានគុណភាពខ្ពស់ជាប់លាប់។
●បណ្ណាល័យ RNA ដ៏ទូលំទូលាយបន្ថែមទៀត៖យើងប្រើការថយចុះ rRNA ជំនួសឱ្យការថយចុះ RNA លីនេអ៊ែរនៅក្នុងការរៀបចំមុនបណ្ណាល័យរបស់យើង ដោយធានាថាទិន្នន័យលំដាប់លំដោយមិនត្រឹមតែរួមបញ្ចូល circRNA ប៉ុណ្ណោះទេ ប៉ុន្តែថែមទាំង mRNA និង lncRNA ផងដែរ ដែលអាចឱ្យមានការវិភាគរួមគ្នានៃសំណុំទិន្នន័យទាំងនេះ។
●ការវិភាគជាជម្រើសនៃបណ្តាញ RNA ខាងក្នុងដែលមានការប្រកួតប្រជែង (ceRNA)៖ ផ្តល់នូវការយល់ដឹងកាន់តែស៊ីជម្រៅអំពីយន្តការនិយតកម្មកោសិកា។
● ការគាំទ្រក្រោយពេលលក់យើងយល់ពីសារៈសំខាន់នៃការមានវត្តមាន នោះហើយជាមូលហេតុដែលការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងលាតសន្ធឹងលើសពីការបញ្ចប់គម្រោងជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មក្រោយពេលលក់រយៈពេល 3 ខែ។ ក្នុងអំឡុងពេលនេះ យើងផ្តល់ជូននូវការតាមដានគម្រោង ជំនួយដោះស្រាយបញ្ហា និងវគ្គសំណួរ និងចម្លើយ ដើម្បីដោះស្រាយសំណួរណាមួយដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។
តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន
| បណ្ណាល័យ | វេទិកា | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ | ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពទិន្នន័យ |
| បណ្ណាល័យទិសដៅដែលថយចុះ rRNA | អ៊ីលមូណា PE150 | ១៦-២០ ជីកាបៃ | Q30≥85% |
តម្រូវការគំរូ៖
នុយក្លេអូទីត៖
| កំហាប់ (ng/μl) | បរិមាណ (μg) | ភាពបរិសុទ្ធ | ភាពស្មោះត្រង់ |
| ≥ ៨០ | ≥ ០.៨ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ការចម្លងរោគប្រូតេអ៊ីន ឬ DNA មានកម្រិត ឬគ្មានការបង្ហាញនៅលើជែល។ | RIN≥6.0; ៥.០≥២៨S/១៨S≥១.០; កម្ពស់មូលដ្ឋានមានកំណត់ ឬគ្មាន |
● រុក្ខជាតិ៖
ឫស ដើម ឬ ផ្កា៖ ៤៥០ មីលីក្រាម
ស្លឹក ឬ គ្រាប់៖ ៣០០ មីលីក្រាម
ផ្លែឈើ៖ ១,២ ក្រាម
● សត្វ៖
បេះដូង ឬ ពោះវៀន៖ ៤៥០ មីលីក្រាម
សរីរាង្គខាងក្នុង ឬខួរក្បាល៖ ២៤០ មីលីក្រាម
សាច់ដុំ៖ ៦០០ មីលីក្រាម
ឆ្អឹង សក់ ឬស្បែក៖ ១,៥ក្រាម
● សត្វអសិរពិស៖
សត្វល្អិត៖ ៩ក្រាម
សត្វក្រៀល៖ ៤៥០ មីលីក្រាម
● ឈាមទាំងមូល៖បំពង់ចំនួន ២
● កោសិកា៖ 106 កោសិកា
● សេរ៉ូម និង ប្លាស្មា: ៦ មីលីលីត្រ
ការដឹកជញ្ជូនគំរូដែលបានណែនាំ
កុងតឺន័រ៖ បំពង់បង្វិលចំណុះ 2 មីលីលីត្រ (មិនណែនាំឱ្យប្រើក្រដាសអាលុយមីញ៉ូមទេ)
ការដាក់ស្លាកគំរូ៖ ក្រុម + ចម្លង ឧ. A1, A2, A3; B1, B2, B3។
ការដឹកជញ្ជូន៖
១. ទឹកកកស្ងួត៖ សំណាកត្រូវវេចខ្ចប់ក្នុងថង់ ហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។
២. បំពង់ RNAstable៖ គំរូ RNA អាចត្រូវបានសម្ងួតក្នុងបំពង់ស្ថេរភាព RNA (ឧ. RNAstable®) ហើយដឹកជញ្ជូននៅសីតុណ្ហភាពបន្ទប់។
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការរចនាពិសោធន៍
ការដឹកជញ្ជូនគំរូ
ការស្រង់ចេញ RNA
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
ការរៀបចំលំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
ជីវព័ត៌មានវិទ្យា
- ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពទិន្នន័យ
- ការតម្រឹមហ្សែន
- ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ CircRNA
- ការបញ្ចេញមតិ CircRNA
- ការវិភាគការបញ្ចេញមតិឌីផេរ៉ង់ស្យែល
ការព្យាករណ៍ circRNA៖ ការចែកចាយក្រូម៉ូសូម
circRNAs ដែលបានបង្ហាញខុសគ្នា - គ្រោងភ្នំភ្លើង
circRNA ដែលបានបង្ហាញខុសគ្នា - ការដាក់ជាក្រុមតាមឋានានុក្រម
ការបង្កើនមុខងារនៃហ្សែនម៉ាស៊ីនរបស់ circRNA
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពស្រាវជ្រាវដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មលំដាប់ circRNA របស់ BMKGene តាមរយៈការប្រមូលផ្ដុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយដែលបានរៀបចំយ៉ាងល្អ។
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 គ្រប់គ្រងការបង្កើត circRNA និងការបិទហ្សែនដែលសម្របសម្រួលដោយ microRNA នៅក្នុងជំងឺមហារីកថ្លើមកោសិកា',អុងកូហ្សែន2021 40:25, 40(25), ទំព័រ 4338–4351។ doi: 10.1038/s41388-021-01867-6។
Xia, K. et al. (2023) 'ប្រតិចារិកដែលឆ្លើយតប X oo បង្ហាញពីតួនាទីរបស់ RNA133 រាងជារង្វង់ក្នុងភាពធន់នឹងជំងឺដោយការគ្រប់គ្រងការបញ្ចេញមតិរបស់ OsARAB នៅក្នុងស្រូវ',ការស្រាវជ្រាវរោគវិទ្យារុក្ខជាតិ, 5(1), ទំព័រ 1–14។ doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6។
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 កែប្រែតុល្យភាពនៃប្រតិចារិករាងជារង្វង់ និងលីនេអ៊ែរនៅក្នុងជំងឺមហារីកថ្លើមកោសិកា'។ doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1។
Zhang, Y. et al. (2023) 'ការវាយតម្លៃដ៏ទូលំទូលាយនៃ circRNAs ក្នុងជំងឺបេះដូងនិងសរសៃឈាមក្រិនថ្លើមមុននិងក្រោយពេលប្តូរថ្លើម',ឱសថសាស្ត្រភាពស៊ាំអន្តរជាតិ, 114, ទំ។ 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
