条形បដា - 03

ផលិតផល

ចម្រៀង MRNA ប្រវែងពេញ -Pacbio

ខណៈពេលដែល MRNA MRNA ដែលមានមូលដ្ឋាននៅ NGS គឺជាឧបករណ៍ដែលអាចបត់បែនបានសម្រាប់ការកត់សំគាល់ហ្សែនការពឹងផ្អែករបស់វាលើការអានខ្លីដាក់កម្រិតលើការវិភាគប្រតិចារឹក។ ម៉្យាងវិញទៀតការសរសេរប្រភេទ Pacbio (iso-seq) ប្រើបច្ចេកវិទ្យាអានជាយូរមកហើយដែលធ្វើឱ្យមានលំដាប់លំដោយនៃការផ្លាស់ប្តូរប្រតិចារិក MRNA ប្រវែងពេញ។ វិធីសាស្រ្តនេះជួយសម្រួលដល់ការរុករករ៉ែជម្មើសជំនួសសំលាប់ហ្សែននិងថ្នាំ poly-adenylation ។ ទោះយ៉ាងណាក៏ដោយមានជម្រើសផ្សេងទៀតសម្រាប់ការកំណត់បរិមាណនៃការបញ្ចេញមតិហ្សែនដោយសារតែចំនួនទឹកប្រាក់ខ្ពស់នៃទិន្នន័យដែលត្រូវការ។ បច្ចេកវិទ្យាលំដាប់ប៉ាស៊ីហ្វិកពឹងផ្អែកលើម៉ូលេគុលតែមួយដែលជាពេលវេលាពិត (SMRT) ពេលវេលា (SMRT) ដែលផ្តល់នូវគុណសម្បត្តិខុសគ្នាក្នុងការចាប់យកឯកសារ MRNA ប្រវែងពេញលេញ។ វិធីសាស្រ្តប្រកបដោយភាពច្នៃប្រឌិតនេះទាក់ទងនឹងការប្រើប្រាស់រលក We Size-Mode (ZMW) និងអណ្តូងមីឡាដែលអាចឱ្យការសង្កេតពេលវេលាពិតប្រាកដនៃសកម្មភាព polymerase ឌីអិនអេក្នុងពេលសរសេរ។ នៅក្នុង Zmws នេះ Polymerate DNA របស់ PacBio សំយោគខ្សែដែលមានលក្ខណៈគ្រប់គ្រាន់ដែលបង្កើតបានអានឱ្យបានយូរដែលលាតសន្ធឹងការប្រតិបត្ដិការបញ្ចូល MRNE ទាំងមូល។ ប្រតិបត្ដិការក្នុងតំបន់ PacBio ក្នុងរបៀបប្រមូលផ្តុំរាងជារង្វង់ (ស៊ីស៊ីអេសអេស) ជួយបង្កើនភាពត្រឹមត្រូវដោយបន្តការបញ្ជាទិញម៉ូលេគុលដូចគ្នាម្តងហើយម្តងទៀត។ ការអាន Hifi ដែលបានបង្កើតមានភាពត្រឹមត្រូវដែលអាចប្រៀបធៀបទៅនឹង NGS ដែលរួមចំណែកដល់ការវិភាគដ៏ទូលំទូលាយនិងអាចជឿទុកចិត្តបាននៃលក្ខណៈប្រតិកម្មនៃលក្ខណៈពិសេសដែលស្មុគស្មាញ។

វេទិកា: Pacbio ភាគបទទី 2; pacbio revio


  • :
  • ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

    ជីវវិទ្យាព័ត៌មានវិទ្យា

    លទ្ធផលនៃការបង្ហាញ

    ការបោះពុម្ពផ្សាយពិសេស

    លក្ខណៈពិសេស

    ●ការសំយោគស៊ីអេសអេសមកពីប៉ូលីអេលអិនអេណាអមដោយការរៀបចំបណ្ណាល័យ

    ●លំដាប់ក្នុងរបៀប CCS បង្កើត Hifi អាន

    ●កំណត់ហេតុនៃប្រតិចារិកប្រវែងពេញ

    ●ការវិភាគមិនចាំបាច់មានហ្សែនយោងទេ។ ទោះយ៉ាងណាក៏ដោយវាអាចមានការងារធ្វើ

    ●ការវិភាគជីវគីមីអាចជួយឱ្យមានការវិភាគនៃប្រតិចារឹក istcorm isform LNCRNA បានប្រើហ្សែនហ្សែន, poly-adenyation និងរចនាសម្ព័ន្ធហ្សែន

    អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

    2

    ភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់: Hifi អានដោយភាពត្រឹមត្រូវ> 99,9% (សំណួរទី 30) បើប្រៀបធៀបទៅនឹង NGS

    alages ការវិភាគការបែកខ្ចាត់ខ្ចាយជំនួស: លំដាប់នៃឯកសារប្រតិចារិកទាំងមូលជួយឱ្យការកំណត់អត្តសញ្ញាណនិងលក្ខណៈរបស់ ISOOFORM បាន

    ជំនាញទូលំទូលាយ: ដោយមានកំណត់ត្រានៃការបញ្ចប់គម្រោងប្រតិបត្ដិការប្រកាន់ខ្ជាប់ប្រវែងជាង 1100 ពើឌអូសពេញនិងកែច្នៃតាមគំរូចំនួន 2300 ក្រុមរបស់យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គម្រោងទាំងអស់។

    ការគាំទ្រក្រោយការលក់: ការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងបានពង្រីកហួសពីការបញ្ចប់គម្រោងជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មរយៈពេល 3 ខែបន្ទាប់ពីការលក់។ ក្នុងអំឡុងពេលនេះយើងផ្តល់ជូននូវគម្រោងតាមដានការដោះស្រាយការដោះស្រាយបញ្ហានិងសំណួរនិងចម្លើយដើម្បីដោះស្រាយសំណួរដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។

    តម្រូវការគំរូនិងការដឹកជញ្ជូន

    បន្ណាល័យ

    យុទ្ធសាស្ត្រលំដាប់ចម្រុះ

    ទិន្នន័យបានណែនាំ

    ការត្រួតពិនិត្យគុណភាព

    ប៉ូលីយ៉ាបានបង្កើនបណ្ណាល័យ MRNA CCS

    Pacbio ភាគទី II

    pacbio revio

    20/40 ជីកាបៃ

    5/10 m ស៊ីស៊ីអេស

    សំណួរ 30 000%

    តម្រូវការគំរូ:

    នុយក្លេអ៊ែរ:

    ●រុក្ខជាតិ:

    ឫសដើមឬ petal: 450 មីលីក្រាម

    ស្លឹកឬគ្រាប់: 300 មីលីក្រាម

    ផ្លែឈើ: 1,2 ក្រាម

    ●សត្វ:

    បេះដូងឬពោះវៀន: 300 មីលីក្រាម

    viscera ឬខួរក្បាល: 240 មីលីក្រាម

    សាច់ដុំ: 450 មីលីក្រាម

    ឆ្អឹងសក់ឬស្បែក: 1 ក្រាម

    ● arthropods:

    សត្វល្អិត: 6 ក្រាម

    Crustacea: 300 មីលីក្រាម

    ●ឈាមទាំងមូល: 1 បំពង់

    ●កោសិកា: 106 កោសិកា

     

    conc (ng / μl)

    ចំនួនទឹកប្រាក់ (μg)

    ភាពបរិសុទ្ធ

    សេចក្ដីសុចរិត

    ≥ 100

    ≥ 1.0

    អូឌីអេ 26/280 = 1.7-2.5

    អូឌីអេ 26/230 = 0.5-2.5

    មានកំណត់ឬគ្មានប្រូតេអ៊ីនឬការចម្លងរោគឌីអិនអេបង្ហាញនៅលើជែល។

    សម្រាប់រុក្ខជាតិ: Rin≥7.5;

    សម្រាប់សត្វ: រីមីន 8.0;

    5.0≥ 28 at / 18S≥1.0;

    ការកាត់បន្ថយមូលដ្ឋានមានកំណត់ឬគ្មានមូលដ្ឋាន

    ការដឹកជញ្ជូនគំរូដែលបានណែនាំ

    កុងតឺន័រ: បំពង់សេនធ័រ 2 មីលីលីត្រ (foil សំណប៉ាហាំងមិនត្រូវបានណែនាំទេ)

    ស្លាកគំរូ: ក្រុម + ចម្លងឧ។ A1, A2, A3; B1, B2, B3 ។

    ការដឹកជញ្ជូន:

    1 ។ ទឹកភ្លៀងស្ងួត: សំណាកចាំបាច់ត្រូវដាក់ក្នុងកាបូបហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។

    2 ។ បំពង់ដែលអាចវាស់បាន: សំណាក RNA អាចត្រូវបានស្ងួតហួតហែងក្នុងបំពង់កាយសម្បទាសមស្ថានីយ៍ RNA (ឧ។ Rnastable®) ហើយបានដឹកជញ្ជូនតាមសីតុណ្ហភាពក្នុងបន្ទប់។

    លំហូរការងារសេវាកម្ម

    គំរូ QC

    ការរចនាពិសោធន៍

    ការដឹកជញ្ជូនគំរូ

    ការដឹកជញ្ជូនគំរូ

    ការសាកល្បងសាកល្បង

    ការស្រង់ចេញ RNA

    ការរៀបចំបណ្ណាល័យ

    សំណង់បណ្ណាល័យ

    ការវយបវនយឹង

    ការវយបវនយឹង

    ការវិភាគទិន្នន័យ

    ការវិភាគទិន្នន័យ

    បន្ទាប់ពីសេវាកម្មលក់

    សេវាកម្មក្រោយពេលលក់


  • មុន:
  • បន្ទាប់:

  • --pacbio -2-01

    រួមបញ្ចូលទាំងការវិភាគដូចខាងក្រោមៈ

    ●ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យដើម

    leddready ការវិភាគ Polyadenylation Syressylation (APA)

    ការវិភាគប្រតិចារិក fusion

    alages ការវិភាគការបែកខ្ចាត់ខ្ចាយជំនួស

    ●ការវិភាគផ្នែកវេជ្ជសាស្ត្រដែលមានលក្ខណៈជាសកលថតចំលង orthologs

    scret ការវិភាគឯកសារប្រលោមលោក: ការព្យាករណ៍នៃលំដាប់កូដ (ស៊ីឌី) និងចំណារពន្យល់មុខងារ

    ●ការវិភាគ LNCRNA: ការព្យាករណ៍របស់ LNCRNA និងគោលដៅ

    settification អត្តសញ្ញាណមីក្រូទស្សន៍ (អេសអេសអេស)

    ការវិភាគ BusCo

     

     图片 26

     

    ការវិភាគពុះជំនួស

    图片 27

    ការវិភាគ Polyadenylation ជំនួស (APA)

     

     图片 28

     

    ចំណារពន្យល់មុខងារនៃប្រតិចារិកប្រលោមលោក

    图片 29 

    ស្វែងយល់ពីការជឿនលឿនដែលបានសម្របសម្រួលដោយក្រុមហ៊ុន MRNA MRNA របស់ MRNA ដែលមានប្រវែងថ្មីរបស់ BM Kkgene នៅក្នុងការបោះពុម្ពផ្សាយដ៏ពិសេសនេះ។

     

    Ma, y. et al ។ (2023) ការវិភាគប្រៀបធៀបរបស់ PacBio និងវិធីសាស្រ្តលំដាប់លំដោយ RNA សម្រាប់អត្តសញ្ញាណប័ណ្ណពិសរបស់ Nemopilema nomurai enomics ហ្សែន 85 (6) ទំ។ 110709 ។ ដូយ: 10.1016 / J.YGeno.2023.110709 ។

    ចាវសំណួរៈ al ។ (ឆ្នាំ 2019) 'សក្ដានុពលនៃការអភិវឌ្ឍនៃ Populos Vemcriptome', ទិនានុប្បវត្តិជីវបច្ចេកវិទ្យារុក្ខជាតិ, 17 (1), ទំព័រ 206-219 ។ ដូយៈ 10.1111 / ភីភីអាយ 122958 ។

    តេង, H. et al ។ (2022) ការផ្លាស់ប្តូរថាមវន្តនៃមាតិកាអាស៊ីត ascorbic ក្នុងអំឡុងពេលនៃការអភិវឌ្ឍផ្លែឈើនិងការទុំរបស់ Actinidia Latifolia (មេកានិចដែលមានជាតិអាតូមអាស៊ី) និងយន្តការម៉ូលេគុលដែលពាក់ព័ន្ធ "ទិនានុប្បវត្តិអន្តរជាតិនៃវិទ្យាសាស្ត្រម៉ូលេគុល, 23 (10) ទំ។ 5808 ។ ដូយ: 10.3390 / IJMS23105808 / ស 1 ។

    ហួ, X. et al ។ (2022) ការព្យាករណ៍ដែលមានប្រសិទ្ធភាពនៃ Gathyyyllys ជីវគីមីក្នុងទីក្រុងប៉ារីស Polyphylla ', Caris Polyphylla ", ជីវវិទ្យាជីវវិទ្យា 2022 5: 1, 5 (1) ទំព័រ 1-10 ទំព័រ 1-10 ។ ដូយៈ 10.1038 / s42003-022-03000-Z ។

    លីវអិម et al ។ (2023) 'រួមបញ្ចូល pacbio iso-seq seq seq និង leimina rna-seq នៃ Tuta Desta (Meyrick) ហ្សែនធូរស្បីនិងហ្ស៊ីបភី 450 ហ្សែន 14 (4) ទំ។ 363 ។ DOI: 10.3390 / ឯកសារសត្វល្អិត 1404040303036 / S1 ។

    វ៉ាង, លជុន et al al ។ (ឆ្នាំ 2019) ការស្ទង់មតិនៃភាពស្មុគស្មាញនៃការប្រតិបត្ដិការដែលបានប្រើការវិភាគពេលវេលានៃពេលវេលាពិតប្រាកដរបស់លោក RNA ការយល់ដឹងកាន់តែប្រសើរនៃ Ricinoleic Raincesis នៅ Ricinus Genomices, 20 (1) ទំព័រ 1-17 ។ ដូយៈ 10.1186 / s12864-019-5832-9 ។

    ទទួលបានការដកស្រង់មួយ

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង: