GENOME
Fivoriamben'ny krômôzôma sy famakafakana momba ny fambolena biomass Miscanthus lutarioriparius genome
Nanopore sequencing |Illumina |Hi-C |RNA-sequencing |Phylogeny
Ao anatin'ity fanadihadiana ity, ny Biomarker Technologies dia nanome fanohanana ara-teknika momba ny fizotry ny Nanopore, ny fivorian'ny genome de novo, ny fivorian'ny Hi-C, sns.
Abstract
Miscanthus, zavamaniry maharitra rhizomatous, dia manana fahafahana lehibe amin'ny famokarana bioenergy noho ny fandeferana avo lenta sy ny fihenjanana.Mitatitra ny fivorian'ny krômôzôma izahayMiscanthus lutarioripariusgenome amin'ny fampifangaroana ny sequencing Oxford Nanopore sy ny teknolojia Hi-C.Ny fivoriambe 2.07-Gb dia mandrakotra ny 96.64% amin'ny genome, miaraka amin'ny contig N50 amin'ny 1.71 Mb.Ny filaharan'ny centromere sy telomere dia mitambatra ho an'ny chromosome 19 sy chromosome 10, tsirairay avy.Ny fiavian'ny allotetraploid an'ny M. lutarioriparius dia voamarina amin'ny alàlan'ny famerenana zanabolana centromeric.Ny firafitry ny genome tetraploid sy ny fanovana chromosomal maromaro mifandraika amin'ny ampemby dia aseho mazava tsara.Tandem dika mitovy fototarazo nyM. lutarioripariusIzy ireo dia manankarena tsy vitan'ny hoe mifandray amin'ny valin'ny adin-tsaina, fa biosynthesis amin'ny rindrin'ny sela.Ny fianakaviana Gene mifandray amin'ny fanoherana ny aretina, ny biosynthesis amin'ny rindrin'ny sela ary ny fitaterana ion metaly dia mivelatra sy mivoatra.Ny fanitarana ireo fianakaviana ireo dia mety ho fototry ny génomika manan-danja amin'ny fanatsarana ny toetra miavakaM. lutarioriparius.
Antontan'isa manan-danja amin'ny fivorian'ny genome
Sary.Fijerena ny fivorian'ny genome M. lutarioriparius
Vaovao sy zava-nisongadina mikendry ny hizara ireo tranga mahomby farany amin'ny Biomarker Technologies, maka ireo zava-bita ara-tsiansa vaovao ary koa ireo teknika malaza ampiharina mandritra ny fandalinana.
Fotoana fandefasana: Jan-05-2022