GENOME
Perhimpunan skala kromosom dan analisis genom tanaman biojisim Miscanthus lutarioriparius
Penjujukan nanopori |Illumina |Hi-C |Penjujukan RNA |Filogeni
Dalam kajian ini, Biomarker Technologies menyediakan sokongan teknikal pada penjujukan Nanopore, pemasangan genom de novo, pemasangan dibantu Hi-C, dsb.
Abstrak
Miscanthus, tumbuhan saka rhizomatous, mempunyai potensi besar untuk pengeluaran biotenaga untuk biojisim yang tinggi dan toleransi tekanan.Kami melaporkan perhimpunan skala kromosomMiscanthus lutarioripariusgenom dengan menggabungkan penjujukan Oxford Nanopore dan teknologi Hi-C.Pemasangan 2.07-Gb meliputi 96.64% genom, dengan contig N50 sebanyak 1.71 Mb.Urutan sentromer dan telomere dipasang untuk kesemua 19 kromosom dan kromosom 10, masing-masing.Asal alotetraploid M. lutarioriparius disahkan menggunakan ulangan satelit centromeric.Struktur genom tetraploid dan beberapa penyusunan semula kromosom berbanding sorghum ditunjukkan dengan jelas.Tandem pendua gen daripadaM. lutarioripariusberfungsi diperkaya bukan sahaja dari segi yang berkaitan dengan tindak balas tekanan, tetapi biosintesis dinding sel.Keluarga gen yang berkaitan dengan rintangan penyakit, biosintesis dinding sel dan pengangkutan ion logam sangat berkembang dan berkembang.Pengembangan keluarga ini mungkin merupakan asas genomik yang penting untuk peningkatan ciri-ciri yang luar biasaM. lutarioriparius.
Statistik utama pemasangan genom
Rajah.Gambaran keseluruhan pemasangan genom M. lutarioriparius
Berita dan Sorotan bertujuan untuk berkongsi kes-kes kejayaan terbaharu dengan Biomarker Technologies, menangkap pencapaian saintifik novel serta teknik menonjol yang digunakan semasa kajian.
Masa siaran: Jan-05-2022