ĠENOME
Assemblaġġ fuq skala tal-kromożomi u analiżi tal-ġenoma tal-wiċċ tal-bijomassa Miscanthus lutarioriparius
Sekwenzar tan-nanopori |Illumina |Hi-C |Sekwenzar tal-RNA |Filoġenija
F'dan l-istudju, Biomarker Technologies ipprovdew appoġġ tekniku dwar is-sekwenzjar ta 'Nanopore, assemblaġġ tal-ġenoma de novo, assemblaġġ assistit Hi-C, eċċ.
Astratt
Miscanthus, pjanta perenni rhizomatous, għandha potenzjal kbir għall-produzzjoni tal-bijoenerġija għall-bijomassa għolja u t-tolleranza għall-istress tagħha.Nirrapportaw assemblaġġ fuq skala tal-kromożomi taMiscanthus lutarioripariusġenoma billi tgħaqqad is-sekwenzjar ta' Oxford Nanopore u t-teknoloġiji Hi-C.L-assemblaġġ ta '2.07-Gb ikopri 96.64% tal-ġenoma, b'kontig N50 ta' 1.71 Mb.Is-sekwenzi taċ-ċentrumer u tat-telomeri huma mmuntati għad-19-il kromożoma u l-kromożoma 10, rispettivament.L-oriġini allotetraplojde tal-M. lutarioriparius hija kkonfermata bl-użu ta' ripetizzjonijiet tas-satellita ċentromeriċi.L-istruttura tal-ġenoma tetraploid u diversi arranġamenti mill-ġdid tal-kromożomi relattivi għas-sorgu huma murija b'mod ċar.Tandem ġeni duplikati taM. lutarioripariushuma arrikkit funzjonali mhux biss f'termini relatati mar-rispons għall-istress, iżda l-bijosintesi tal-ħajt taċ-ċelluli.Familji tal-ġeni relatati mar-reżistenza għall-mard, il-bijosintesi tal-ħajt taċ-ċelluli u t-trasport tal-jone tal-metall huma estiżi u evolvew ħafna.L-espansjoni ta 'dawn il-familji tista' tkun bażi ġenomika importanti għat-titjib ta 'karatteristiċi notevoli ta'M. lutarioriparius.
Statistika ewlenija tal-assemblaġġ tal-ġenoma
Figura.Ħarsa ġenerali lejn l-assemblaġġ tal-ġenoma M. lutarioriparius....
Aħbarijiet u Highlights għandu l-għan li jaqsam l-aħħar każijiet ta’ suċċess mat-Teknoloġiji tal-Bijomarker, li jinqabad kisbiet xjentifiċi ġodda kif ukoll tekniki prominenti applikati matul l-istudju.
Ħin tal-post: Jan-05-2022